دوره 9، شماره 21 - ( پاییز 1397 )                   جلد 9 شماره 21 صفحات 120-128 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Pish Jang Aghajeri J, Rahimi mianji G, Hafezian H, Gholizadeh M. Genetic Diversity of TLR4 and IL2 Loci Involved In Immune System in Some Iranian Indigenous Chicken Breeds. rap. 2018; 9 (21) :120-128
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-834-fa.html
پیش جنگ آقاجری جعفر، رحیمی میانجی قدرت اله، حافظیان سید حسن، قلی زاده محسن. تنوع ژنتیکی جایگاه‌های TLR4 و IL2 دخیل در سیستم ایمنی در چند نژاد مرغ بومی ایران. پژوهشهاي توليدات دامي. 1397; 9 (21) :120-128

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-834-fa.html


دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده‌ی علوم دامی وشیلات، گروه علوم دامی، ساری، ایران و عضو هیات علمی
چکیده:   (455 مشاهده)
در این تحقیق چندشکلی‌های­ آللی در ژن­های کاندید TLR4 و IL2 دخیل در سیستم ایمنی برخی از نژادهای مرغ­ بومی با استفاده از تکنیک PCR-RFLP بررسی شد. 200 قطعه مرغ شامل نژاد­های مرغ بومی عمومی، آذربایجان غربی، مرندی و مازندرانی انتخاب شدند. برای شناسایی جهش در ژن­ های TLR4 و IL2 به ترتیب از آنزیم ­های Sau96I و HphI استفاده شد. برای جایگاه ژنی 257 جفت بازی TLR4، بعد از هضم آنزیمی سه ژنوتیپ CC، CG و GG شناسایی و برای آلل C دو باند 138 و 119 جفت بازی و برای آلل G سه باند 119، 99 و 39 جفت بازی مشاهده شد. در جایگاه ژنی 600 جفت بازی IL2، سه ژنوتیپAA ، AB و BB شناسایی و برای آلل A چهار باند 465، 64، 40 و 31 جفت بازی و برای آلل B پنج باند 454، 64، 40، 31 و 11 جفت بازی مشاهده شد. کل جمعیت­ ها از نظر شاخص تعادل برای دو جایگاه ژنی مورد مطالعه در تعادل هاردی - واینبرگ قرار داشت. شاخص اطلاعات شانون در جایگاه ­های نشانگری TLR4 و IL2 به ترتیب 56/0 و 69/0 و همچنین شاخص تثبیت به ترتیب 05/0- و 10/0- محاسبه شد. بیشترین مقدار شاخص هتروزیگوسیتی مشاهده شده برای جایگاه­ های ژنی TLR4 و IL2 به ترتیب 55/0 و 40/0 برآورد شد. با توجه به چندشکلی‌های موجود در جایگاه ­های ژنی مطالعه شده و کاهش هتروزیگوسیتی در این جمعیت­ ها، می ­توان از بروز تلاقی ­های غیر تصادفی جلوگیری کرد. این امر منجر به افزایش هتروزیگوسیتی و در نتیجه مانع از کاهش تنوع ژنتیکی در جمعیت­ ها خواهد شد. همچنین با مطالعه­ ی پاسخ­ های ایمنی مرتبط با این دو جایگاه ژنی می ­توان از این جایگاه به ­عنوان نشانگرهای مناسب در برنامه­ های اصلاح نژاد مرغ­ های بومی برای افزایش مقاومت به بیماری­ ها بهره برد.
 
متن کامل [PDF 1042 kb]   (111 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد طیور
دریافت: ۱۳۹۶/۹/۷ | ویرایش نهایی: ۱۳۹۷/۹/۶ | پذیرش: ۱۳۹۶/۱۰/۲۰ | انتشار: ۱۳۹۷/۹/۶

فهرست منابع
1. Al-Atiyat, R. 2010. Genetic diversity of indigenous chicken ecotypes in Jordan. African Journal of Biotechnology, 9: 7014-7019.
2. Alinaghizadeh, H., M.R. Mohammad Abadi and S. Zakizadeh. 2010. Exon 2 of BMP15 gene polymorphismin Jabal Barez red goat. Journal of Agricultural Biotechnology, 2(1): 69-80 (In Persian).
3. Allendorf, F.W. and R.F. Leary. 1986. Heterozygosity and fitness in natural populations of animals. Conservation Biology: The Science of Scarcity and Diversity, pp: 57-76.
4. Bulumulla, P.B.A.I.K., P. Silva and H. Jianlin. 2011. Genetic diversity at toll like receptor 7 (TLR7) genes of Sri Lankan indigenous chicken and Ceylon jungle fowl (Gallus lafayetti). Tropical Agricultural Research, 22(4): 367-373. [DOI:10.4038/tar.v22i4.3787]
5. Corander, J., P. Waldmann and M.J. Sillanpää. 2003. Bayesian analysis of genetic differentiation between populations. Genetics, 163: 367-374.
6. Estess, P., A. Nandi, M. Mohamadzadeh and M.H. Siegelman. 1999. Interleukin 15 induces endothelial hyaluronan expression in vitro and promotes activated T cell extravasations through a CD44-dependent pathway in uivo. The Journal of Experimental Medicine, 190: 9-19. [DOI:10.1084/jem.190.1.9]
7. Hemati, B., M.H. Banabazi, S. Shahkarami, E. Mohandesan and P. Burger. 2017. Genetic diversity within Bactrian camel population of Ardebil province. Research on Animal Production, 8(16): 192-197 (In Persian). [DOI:10.29252/rap.8.16.192]
8. Jaiswal, G., S. Kumar, Y. Prasad and D.P. Singh. 2009. PCR-RFLP analysis of IL-2Rγ and IL-15Rα genes in Kadakanath native chicken. Journal of Applied Animal Research, 36: 239-242. [DOI:10.1080/09712119.2009.9707068]
9. Javanmard, A., M.R. Mohammadabadi, G.E. Zarrigabayi, A.A. Gharahedaghi, M.R. Nassiry, A. Javadmansh and N. Asadzadeh. 2008. Polymorphism within the intron region of the bovine leptin gene in Iranian Sarabi cattle (Iranian Bos Taurus). Russian Journal of Genetics, 44 (4): 495-497. [DOI:10.1134/S1022795408040169]
10. Keller, L.F. and D.M. Waller. 2002. Inbreeding effects in wild populations. Trends in Ecology & Evolution, 17: 230-241. [DOI:10.1016/S0169-5347(02)02489-8]
11. Kogut, M., L. Rothwell and P. Kaiser. 2003. Priming by recombinant chicken interleukin-2 induces selective expression of IL-8 and IL-18 mRNA in chicken heterophils during receptor-mediated phagocytosis of opsonized and nonopsonized Salmonella enteric serovar enteritidis. Journal of Molecular Immunology, 40: 603-610. [DOI:10.1016/j.molimm.2003.08.002]
12. Köllisch, G., B.N. Kalali, V. Voelcker, R. Wallich, H. Behrendt, J. Ring, S. Bauer, T. Jakob, M. Mempel and M. Ollert. 2005. Various members of the Toll‐like receptor family contribute to the innate immune response of human epidermal keratinocytes. Immunology, 114: 531-541. [DOI:10.1111/j.1365-2567.2005.02122.x]
13. Kumar, R., S. Kumar, D.P. Singh and P. Gaur. 2007. DNA polymorphism at IL-2Rγ and IL-15Rα genes in Aseel native chicken. Journal of Applied Animal Research, 32: 107-110. [DOI:10.1080/09712119.2007.9706857]
14. Levene, H. 1949. On a matching problem in genetics. The Annals of Mathematical Statistics, 20: 91-94. [DOI:10.1214/aoms/1177730093]
15. Leveque, G., V. Forgetta, S. Morroll, A.L. Smith, N. Bumstead, P. Barrow, J. Loredo-Osti, K. Morgan and D. Malo. 2003. Allelic variation in TLR4 is linked to susceptibility to Salmonella enterica serovar Typhimurium infection in chickens. Infection and Immunity, 71: 1116-1124. [DOI:10.1128/IAI.71.3.1116-1124.2003]
16. Maghsoudi, S.M. and A. Pakdel. 2008. Review of effective genetical methods to induce disease resistance in farm animals. Proceedings of the 1th National conference of the livestock and poultry industry, 1-6 pp., Gorgan, Iran. (In Persian).
17. McDonald, D.G. and J. Dimmick. 2003. The conceptualization and measurement of diversity. Communication Research, 30: 60-79. [DOI:10.1177/0093650202239026]
18. Miller, S.A., D.D. Dykes and H.F. Polesky. 1988. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research, 16(3): 12-15. [DOI:10.1093/nar/16.3.1215]
19. Moazeni, S., M.R. Mohammadabadi, M. Sadeghi, H. Shahrbabak, A. Koshkoieh and F. Bordbar .2016a. Association between UCP gene polymorphisms and growth, breeding value of growth and reproductive traits in Mazandaran indigenous chicken. Open Journal of Animal Sciences, 6(1): 1-8. [DOI:10.4236/ojas.2016.61001]
20. Moazeni, S.M., M.R. Mohammadabadi, M. Sadeghi, H. Moradi Shahrbabak and A.K. Esmailizadeh. 2016b. Association of the melanocortin-3 (MC3R) receptor gene with growth and reproductive traits in Mazandaran indigenous chicken. Journal of Livestock Science and Technologies, 4(2): 51-56.
21. Mohammadabadi, M.R., M. Nikbakhti, H.R. Mirzaee, A. Shandi, D.A. Saghi, M.N. Romanov and I.G Moiseyeva. 2010. Genetic variability in three native Iranian chicken populations of the Khorasan province based on microsatellite markers. Russian journal of genetics, 46(4): 505-509. [DOI:10.1134/S1022795410040198]
22. Mohammadi, A., M.R. Nassiry, J. Mosafer, M.R. Mohammadabadi and G.E. Sulimova. 2009. Distribution of BoLA-DRB3 allelic frequencies and identification of a new allele in the Iranian cattle breed Sistani (Bos indicus). Russian journal of genetics, 45(2): 198-202. [DOI:10.1134/S1022795409020100]
23. Mohammadifar, A. and M.R. Mohammadabadi. 2011. Application of microsatellite markers for a study of Kermani sheep genome. Iranian journal of Animal Science, 42(4): 337-344.
24. Mousavizadeh, A., M.R. Mohammadabadi, A. Torabi, M.R. Nassiry, H. Ghiasi and A.K. Esmailizadeh. 2009. Genetic polymorphism at the growth hormone locus in Iranian Talli goats by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP). Iranian Journal of Biotechnology, 7(1): 51-53.
25. Nei, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proceedings of the National Academy of Sciences, 70: 3321-3323. [DOI:10.1073/pnas.70.12.3321]
26. Nikoubin Borujeni, M., N. Pirany and F. Rafiei Boroujeni. 2016. Analysis of genetic diversity in Fars native chicken based on partial mitochondrial DNA D-loop region sequences. Research on Animal Production, 7(14): 180-185 (In Persian). [DOI:10.29252/rap.7.14.185]
27. Ramasamy, K.T., M.R. Reddy and S. Murugesan. 2011. Toll-like receptor mRNA expression, iNOS gene polymorphism and serum nitric oxide levels in indigenous chickens. Veterinary Research Communications, 35: 321-327. [DOI:10.1007/s11259-011-9472-z]
28. Shojaei, M., M.R. Mohammadabadi, M. Asadi Fozi, O. Dayani, A. Khezri and M. Akhondi. 2010. Association of growth trait and Leptin gene polymorphism in Kermani sheep. Journal of Cell and Molecular Research, 2: 67-73.
29. Tohidi, R., I.B. Idris, J.M. Panandam and M. Hair-Bejo. 2013. Analysis of genetic variation of inducible nitric oxide synthase and natural resistance-associated macrophage protein 1 loci in Malaysian native chickens. African Journal of Biotechnology, 10: 1285-1289.
30. Tohidi, R., I.B. Idris, J.M. Panandam and M.H. Hair-Bejo. 2012. The effects of polymorphisms in IL-2, IFN-γ, TGF-β2, IgL, TLR-4, MD-2, and iNOS genes on resistance to Salmonella E. in indigenous chickens. Avian Pathology, 41: 605-612. [DOI:10.1080/03079457.2012.739680]
31. Thomas, N. and S. Joseph. 2012. Role of SLC11A1 gene in disease resistance. Biotechnology in Animal Husbandry, 28(1): 99-106. [DOI:10.2298/BAH1201099T]
32. Vanhala, T., M. Tuiskula-Haavisto, K. Elo, J. Vilkki and A. Maki-Tanila. 1998. Evaluation of genetic variability and genetic distances between eight chicken lines using microsatellite markers. Poultry Science, 77: 783-790. [DOI:10.1093/ps/77.6.783]
33. Weir, B.S. 1990. Genetic data analysis: Methods for discrete population genetic data. 1rd edn, Sinauer Assoc., Sunderland, MA, USA, 377 pp.
34. Yeh, F.C., Y. Rongcal and T. Boyle. 2000. POPGENE 1.32: A free program for the analysis of genetic variation among and within populations using co-dominant and dominant markers. Department of Renewable Resources, University of Alberta, Alberta, Canada.
35. Zamani, P., M. Akhondi, M.R. Mohammadabadi, A.A. Saki, A. Ershadi, M.H. Banabazi and A.R. Abdolmohammadi. 2013. Genetic variation of Mehraban sheep using two intersimple sequence repeat (ISSR) markers. African Journal of Biotechnology, 10: 1812-1817.
36. Zandi, E., M.R. Mohammadabadi, M. Ezzatkhah and A.K. Esmailizadeh. 2014. Typing of toxigenic isolates of clostridium perfringens by multiplex PCR in ostrich. Iranian Journal of Applied Animal Science, 4: 509-514.
37. Zanetti, E., C. Dalvit, M. De Marchi, R. Dal Zotto and M. Cassandro. 2007. Genetic characterization of Italian chicken breeds using a panel of twenty microsatellite markers. Poljoprivreda, 13(1): 197-200.
38. Zhou, H. and S.J. Lamont. 2003. Association of six candidate genes with antibody response kinetics in hens. Poultry Science, 82: 1118-1126. [DOI:10.1093/ps/82.7.1118]
39. Zhou, H., A. Buitenhuis, S. Weigend and S. Lamont. 2001. Candidate gene promoter polymorphisms and antibody response kinetics in chickens: interferon-γ, interleukin-2 and immunoglobulin light chain. Poultry Science, 80: 1679-1689. [DOI:10.1093/ps/80.12.1679]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2019 All Rights Reserved | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb