دوره 8، شماره 17 - ( پاییز 1396 )                   جلد 8 شماره 17 صفحات 99-106 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Study of Candidate Genes Affecting Fat-Tail Traits in Specific Region of Chromosome 5 in Lori-Bakhtiari and Zel Sheep by PCR-SSCP . rap. 2018; 8 (17) :99-106
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-872-fa.html
صفدربان مظاهر، حافظیان سیدحسن، رحیمی مبانجی قدرت، فرهادی ایوب. مطالعه ژن‌های کاندیدا مؤثر بر صفات دنبه در محدوده مشخصی از کروموزوم شماره 5 در گوسفندان لری بختیاری و زل با روش PCR-SSCP . پژوهشهاي توليدات دامي. 1396; 8 (17) :99-106

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-872-fa.html


دانش آموخته کارشناسی ارشد
چکیده:   (401 مشاهده)
کیفیت گوشت و ترکیب لاشه از مهم­ترین صفات اقتصادی در گوسفند به شمار می‌روند. چربی بدن و دنبه از جمله عوامل
تأثیرگذار بر کیفیت لاشه و گوشت تولیدی در هر نژاد بوده و وقوع
جهش در توالی ژن­های کنترل­کننده این صفات می­تواند عملکرد حیوان و بالطبع ارزش ارثی را تحت تأثیر قرار دهد. هدف از این مطالعه بررسی چند شکلی برخی نواحی از ژنهای SAR1B، SEC24A و VDAC1 در منطقه ژنومی کاندیدا برای صفات چربی و دنبه روی کروموزوم  شماره 5 گوسفند بود. نمونه­های خون به طور تصادفی از تعداد 300 رأس گوسفند لری بختیاری و 100 رأس گوسفند زل جمع­آوری شد و استخراج DNA به روش نمکی بهینه یافته انجام شد. واکنش­های زنجیره­ای پلیمراز (PCR) برای تکثیر قطعه‌های 478، 579 و 348 جفت بازی ژن‌های مورد مطالعه با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی،  و تعیین ژنوتیپ نمونه­ها با تکنیک SSCP  انجام شد. نتایج به دست آمده سه الگوی باندی A، B و C را برای ژن SAR1B در گوسفند لری بختیاری نشان داد، اما این جایگاه ژنی در گوسفند زل تک شکل بود. برای ژن SEC24A در هر دو نژاد سه الگوی باندی A، B  و C، اما جایگاه VDAC1 در دو نژاد تک شکل بود. تأثیر الگوهای باندی ژن SAR1B بر ویژگی­های دنبه معنی­دار (001/0P <) بود، به طوری که الگوی باندی A بیشترین مقادیر مشاهده شده برای محیط بالا، محیط پایین، ارتفاع و وزن دنبه را نشان داد. الگوهای مختلف باندی ژن SEC24A به طور معنی­داری با ویژگی­های دنبه در ارتباط بود (001/0P <) و الگوی باندی B بیشترین مقادیر را نشان داد. با توجه به تک شکل بودن جایگاه ژنی SAR1B در نژاد بدون دنبه زل و چند شکل بودن آن در نژاد دنبه‌دار لری بختیاری و همچنین چند شکل بودن جایگاه ژنی SEC24A در هر دو نژاد مورد مطالعه، این جایگاه­های نشانگری را  می‌توان به عنوان ژن‌های کاندیدای احتمالی مؤثر بر ویژگی‌های دنبه در نژادهای گوسفند دنبه‌دار مطرح کرد. مطالعه بیشتر نواحی دیگر (اگزون، اینترون و نواحی تنظیمی) این دو ژن  و ارتباط آنها با صفات دنبه برای تأیید نتایج پیشنهاد می­شود.
واژه‌های کلیدی: گوسفند، صفات دنبه، SAR1B، SEC24A، VDAC1
متن کامل [PDF 570 kb]   (107 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي

فهرست منابع
1. Archibald, A.L., N.E. Cockett, B.P. Dalrymple, T. Faraut, J.W. Kijas, J.F. Maddox, J.C. McEwan, V.Hutton Oddy, H.W. Raadsma, C. Wade, J. Wang, W. Wang and X. Xun. 2010. International Sheep Genomics Consortium: The sheep genome reference sequence: a work in progress. Animal Genetics, 41: 449-453. [DOI:10.1111/j.1365-2052.2010.02100.x]
2. Asadi, A., H. Moradi Shahrbabak, P. Azizi, S. Elahian and S. Abbasi. 2015. Investigation of Polymorphism in Exon 4 of GH Gene and Its Association with Growth Traits in Kermani Sheep using PCR- SSCP. Research on Animal Production, 6(12): 139-144 (In Persian).
3. Barzehkar, R., A. Salehi and F. Mahjoubi. 2009. Polymorphisms of the ovine leptingene and its association with growth and carcass traits in three Iranian sheep breeds. Iranian Journal of Biotechnology, 7: 241-246 (In Persian).
4. Bianchi, P., E. Fermo, C. Vercellati, C. Boschetti, W. Barcellini and A. Iurlo. 2009. Congenital dyserythropoietic anemia type II (CDAII) is caused by mutations in the SEC23B gene. Human Mutation, 30: 1292-1298. [DOI:10.1002/humu.21077]
5. Chen, X.W., H. Wang, K. Bajaj, P. Zhang, Z.M. Meng, D. Ma, Y. Bai, H.H. Liu, E. Adams, A. Baines, G. Yu, M.A. Sartor, B. Zhang, Z. Yi, J. Lin, S.G. Young, R. Schekman and D. Ginsburg. 2013. SEC24A deficiency lowers plasma cholesterol through reduced PCSK9 secretion. elife.elifesciences.org
6. Cockett, N.E., M.A. Smith, C.A. Bidwell, K. Segers, T.L. Hadfield, G.D. Snowder, M. Goerges and C. Charlier. 2005. The callipyge mutation and other genes that affect muscle hypertrophy in sheep. Genetic Selection Evolution, 37: S65-S81. [DOI:10.1186/1297-9686-37-S1-S65]
7. Freking, B.A., J.W. Keele, S.D. Shackelford, T.L. Wheeler, M. Koohmaraie, M.K. Nielsen and K.A. Leymaster. 1999. Evaluation of the ovine callipyge locus: III. Genotypic effects on meat quality traits. Journal of Animal Science, 77: 2336-2344. [DOI:10.2527/1999.7792336x]
8. GAN, S.Q., Z. Wei, S. Min, L. Huan, Y. Jing-Quan, L. Yao-Wei, G. Lei, L. Shou-Ren and W. Xin-Hua. 2013. Correlation analysis between polymorphism of the 9383635th locus on X chromosome and fat-tail trait in sheep. Hereditas, 10: 1209-1218.
9. Ge, W., M.E. Davis, H.C. Hines, K.M. Irvin and R.C.M. Simmen. 2001. Association of a genetic marker with blood serum insulin-like growth factor-I concentration and growth traits in Angus cattle. Journal of Animal Science, 79: 1757-1762. [DOI:10.2527/2001.7971757x]
10. Gokdal, O., H. Ulker, F. Karakus, F. Cengiz, C. Temur and H. Handil. 2004. Growth, feedlot performance and carcass characteristics of Karakas and crossbred lambs (F1)(Ile de France x Akkaraman (G1) x Karakas) under rural farm conditions in Turkey. South African Journal of Animal Science, 34: 223-232.
11. Karamichou, E., R. Richardson, G. Nute, K. Gibson and S. Bishop. 2006. Genetic analyses and quantitative trait loci detection, using a partial genome scan, for intramuscular fatty acid composition in Scottish Blackface sheep. Journal of Animal Science, 84: 3228-3238. [DOI:10.2527/jas.2006-204]
12. Meuwissen, T.H.E. and M.E. Goddard. 1996. The use of marker haplotypes in animal breeding schemes. Genetics Selection Evolution, 28: 161-176. [DOI:10.1186/1297-9686-28-2-161]
13. Moradi, M.H., A. Nejati-Javaremi, M. Moradi-Shahrbabak and J.C. McEwan. 2011. Genomic scan of selective sweeps in thin and fat tail sheep breeds for identifying of candidate regions associated with fat deposition. PhD Thesis, Tehran University, Karadj, Iran. 95 pp (In Persian).
14. Moradi, M.H., A. Nejati-Javaremi, M. Moradi-Shahrbabak, K.G. Dodds and J.C. McEwan. 2012. Genomic scan of selective sweeps in thin and fat tail sheep breeds for identifying of candidate regions associated with fat deposition. BMC Genetics, 13: 10-25. [DOI:10.1186/1471-2156-13-10]
15. Negussie, E., O. Rottmann, F. Pirchner and J. Rege. 2003. Patterns of growth and partitioning of fat depots in tropical fat-tailed Menz and Horro sheep breeds. Meat science, 64:491-498. [DOI:10.1016/S0309-1740(02)00227-9]
16. POPGENE. 1999. Version 1.32: the user friendly software for population genetic analysis. Molecular Biology and Biotechnology Centre, University of Alberta, Edmonton, AB, Canada.
17. Oligo7. 2009. Version 7. OLIGO Primer Analysis Software. Molecular Biology Insights, Inc., Cascade, CO, USA. http://www.oligo.net/
18. SAS Institute. 2000. Statistical Analysis System User's Guide. Statistics (8th Edition) SAS Institute Inc. North Carolina, USA.
19. Sun, Y., G. Zhao, R. Liu, M. Zheng, Y. Hu, D. Wu, L. Zhang, P. Li and J. Wen. 2013. The identification of 14 new genes for meat quality traits in chicken using a genome-wide association study. BMC Genomics, 14: 458-464. [DOI:10.1186/1471-2164-14-458]
20. Vatankhah, M., M. Moradi-Shahrbabak, A. Nejati-Javaremi, S.R. Miraie Ashtiani and R. Vaez Torshizy. 2006. Investigation on fat-tail dimension and its relationship with Lori-Bakhtiari sheep's tail weight. Journal of Science and Technology of Agriculture and Natural Resources, Tenth year, No. III (B), autumn (In persian).
21. Wang, Q., H. Li, N. Li, L. Leng, Y. Wang and Z. Tang. 2006. Identification of single nucleotide polymorphism of adipocyte fatty Acid-Binding protein gene and its association with fatness traits in the chicken. Poultry Science, 85: 429-434. [DOI:10.1093/ps/85.3.429]
22. Xia, W. and S.F.A. Grant. 2013. The genetics of human obesity. Annals of New York Academy of Science, 1281: 178-190. [DOI:10.1111/nyas.12020]
23. Zerehdaran, S., S. Alijani and M. Salehinasab. 2016. Detecting Major Genes for Some Economic Traits in Native Fowl of Yazd Province using Different Statistical Methods. Research on Animal Production, 7(13): 163-170 (In Persian).
24. Zhu, X., N. Niu, Y. Liu, T. Du, D. Chen and X. Wang. 2006. Improvement of the sensitivity and resolution of PCR-SSCP analysis with optimized primer concentrations in PCR products. Journal of genetics, 85: 233-243. [DOI:10.1007/BF02935339]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA code

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2018 All Rights Reserved | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb