دوره 8، شماره 16 - ( تابستان 1396 )                   جلد 8 شماره 16 صفحات 165-158 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

(2017). Detection of Polymorphism in Exon 2 of GDF9 gene in Pure and Crossbred of Pakistani Sheep. rap. 8(16), 158-165. doi:10.29252/rap.8.16.158
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-817-fa.html
خدابخش زاده رسول، محمدآبادی محمدرضا، اسمعیلی زاده کشکوئیه علی، مرادی شهربابک حسین. شناسایی چندشکلی‌ در اگزون دوم ژن GDF9در گوسفندان خالص و آمیخته پاکستانی پژوهشهاي توليدات دامي 1396; 8 (16) :165-158 10.29252/rap.8.16.158

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-817-fa.html


چکیده:   (4038 مشاهده)
     ژن GDF9 از مهم­ ترین ژن­ های موثر بر چندقلوزایی گوسفندان می­ باشد. لذا، هدف از انجام این تحقیق شناسایی چندشکلی ­های تک­نوکلئوتیدی موجود در اگزون دوم ژن  GDF9در گوسفندان خالص و آمیخته پاکستانی به روش PCR-SSCP بود. به این منظور، نمونه های خون از 30 رأس گوسفند پاکستانی، 17 رأس گوسفند آمیخته پاکستانی و لری بختیاری و 7 رأس گوسفند آمیخته پاکستانی و کرمانی تهیه و استخراج DNA به روش نمکی بهینه انجام شد. با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی یک قطعه 634 جفت بازی با کمک واکنش زنجیره­ای پلیمراز تکثیر شد. پس از تعیین چند شکلی فضایی تک رشته ­ای محصولات PCR، الگوهای باندی مربوط به ژن GDF9 روی ژل پلی اکریل­آمید 8 درصد رنگ آمیزی شده با نیترات نقره مشاهده شد. در مجموع در سه جمعیت مورد مطالعه، چهار الگوی باندی 1، 2، 3 و 4 با فراوانی­ های 093/0، 129/0، 371/0 و 407/0 بدست آمد. نتایج توالی­یابی منجر به شناسایی سه جهش در موقعیت­های نوکلئوتید 443، 477 و 721 ژن GDF9 در جمعیت­های مورد مطالعه گردید.
واژه‌های کلیدی: چندشکلی، چندقلوزایی، ژنGDF9، PCR-SSCP، SNP
متن کامل [PDF 550 kb]   (1204 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1396/8/8 | ویرایش نهایی: 1396/8/9 | پذیرش: 1396/8/8 | انتشار: 1396/8/8

فهرست منابع
1. Amiri, F., S.R. Miraei-Ashtiani and M. Sadeghi. 2011. Polymorphism in the GDF8 gene and their effects on carcass traits in Lori-Bakhtiari and Zel sheep breeds. Research on Animal Production, 2(4): 148-155.
2. Badbarin, N., S.Z.A. Mirhoseini, A. Bahmani and R. Seid Sharifi. 2013. Polymorphism study of the Growth Differentiation Factor 9 (GDF9) gene and it's correlation with weight quality in Ghareh Ghol sheep. Animal and Birds congress. North Iran, 1073-1076 (In Persian).
3. Bahmani, A., S.Z.A. Mirhoseini, B. Dlir Safat and Z. Ansari. 2010. Polymorphism study of the Growth Differentiatio-n Factor 9 (GDF9) gene in Ghareh Ghol sheep using PCR-SSCP. In: Proceedings of 4th Animal science congress. Iran, 3590-3593 (In Persian).
4. Barzegari, A., S. Atashpaz, K. Ghabili, Z. Nemati, M. Rustaei and R. Azarbaijani. 2010. Polymorphism in GDF9 and BMP15 genes and association with fertility and ovulation rate in Moghani and Ghezel sheep in Iran. Reproduction in Domestic Animals, 45: 666-669. [DOI:10.1111/j.1439-0531.2008.01327.x]
5. Chu, M.X., J. Yang, T. Feng, G.L. Cao, L. Feng, R. Di, W.D. Huang, Q. Tang, H.Y. Ma, K. Li and N. Li .2011. GDF9 as a candidate gene for prolificacy of small tail Han sheep. Biology of Reproduction, 38: 5199-5204. [DOI:10.1007/s11033-010-0670-5]
6. Davis, G.H., G.D. Bruce and K.G. Dodds. 2001. Ovulation rate and litter size of prolific Inverdale (FecXI) and Hanna (FecXH) sheep. Procduction of Advance Animal Genetics, 14: 175-178.
7. Eghbalsaied, S.h., K. Ghaedi, S. Shahmoradi, A. Pirestani, T. saeidi, H. Amini, L. Nicol and A. McNielly. 2012. Presence of SNPs in GDF9 mRNA of Iranian Afshari sheep. International Journal of fertilization Sterility, 5: 225-230.
8. Galloway, S.M., B.M. Lumsden, J.P. Hanraha, M. Mullen, X.Z. Mao and G.L. Wang. 2006. Investigation of the Booroola (FecB) and Inverdale (FecXI) mutations in 21 prolific breeds and strains of sheep sampled in 13 countries. Animal Reproduction Science, 92: 87-96. [DOI:10.1016/j.anireprosci.2005.06.001]
9. Hanrahan, J.P., S.M. Gregan, P. Mulsant, M. Mullen, G.H. Davis, R. Powell and S.M. Galloway. 2004. Mutations in the genes for oocyte derived growth factors GDF9 and BMP15 are associated with both increased ovulation rate and sterility in Cambridge and Belclare sheep (Ovis aries). Biology of Reproduction, 70: 900-909. [DOI:10.1095/biolreprod.103.023093]
10. Javanmard, A., M.R. Mohammadabadi, G.E. Zarrigabayi, A.A. Gharahedaghi, M.R. Nassiry, A. Javadmansh and N. Asadzadeh. 2008. Polymorphism within the intron region of the bovine leptin gene in Iranian Sarabi cattle (Iranian Bos taurus) Russian Journal of Genetics, 44: 495-497. [DOI:10.1134/S1022795408040169]
11. Juengel, J.L., N.L. Hudson, D.A. Heath, P. Smith, K.L. Reader and S.B. Lawrence. 2002. Growth differentiation factor 9 and bone morpHogenetic protein 15 are essential for ovarian follicular development in sheep. Biology of Reproduction, 67: 1777-1789. [DOI:10.1095/biolreprod.102.007146]
12. Khanahmadi, A., Sh. Gharehveysi, R. Khataminejad and J. Arab. 2014. Polymorphic variants of G1 and B4 from GDF9 and BMP15 genes of Dalagh sheep. Research on Animal Production, 5(10): 148- 155.
13. Khodabakhshzadeh, R., M.R. Mohammadabadi, A.K. Esmailizadeh Koshkoieh, H. Moradi-Shahrebabak and S. Ansari Namin. 2015a. Study of mutations available in first-halfexon 2 of GDF9 gene in crossbred sheep born from crossing of Romanov rams with Kermani ewes. Iranian Journal of Animal Science Research, 6(4): 395-403 (In Persian).
14. Khodabakhshzadeh, R., M.R. Mohammadabadi, A.K. Esmailizadeh, H. Moradi-Shahrebabak, F. Bordbar and S. Ansari Namin. 2016b. Identification of point mutations in exon 2 of GDF9 gene in Kermani sheep. Polish Journal of Veterinary Sciences, 19(2): 281-289. [DOI:10.1515/pjvs-2016-0035]
15. Khodabakhshzadeh, R., M.R. Mohammadabadi, H. Moradi, A.K. Esmailizadeh and N.S. Ansari. 2015b. Identify of G-›A point mutation at positions 477 and 721 in exon 2 of GDF9 gene in Kermani sheep. Modern Genetics, 10 (2): 261-268 (In Persian). [DOI:10.1515/pjvs-2016-0035]
16. Khodabakhshzadeh, R., M.R. Mohammadabadi, H. Moradi-Shahrebabak and A.K. Esmailizadeh. 2016a. Identification of available mutations in the first-half (from 5' end) of exon 2 of GDF9 gene in crossbred sheep from crossing of Romanov and Lori-Bakhtiari breeds. Animal Production Research, 4(4): 15-26 (In Persian).
17. Miller, S.A., D.D. Dykes and H.F. Polesky. 1988. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research, 16: 12-15. [DOI:10.1093/nar/16.3.1215]
18. Mishra, A.K., A.L. Arora, S. Kumar and L.L. Prince. 2009. Studies on effect of Booroola (FecB) genotype on lifetime ewes' productivity efficiency, litter size and number of weaned lambs in Garole×Malpura sheep. Animal Reprodution Science, 113: 293-298. [DOI:10.1016/j.anireprosci.2008.06.002]
19. Mohammadabadi, M.R. and R. Sattayimokhtari. 2013. Estimation of (co) variance components of ewe productivity traits in kermani sheep. Slovak Journal of Animal Science, 46: 45-51.
20. Mousavizadeh, A., M.R. Mohammadabadi, A. Torabi, M.R. Nassiry, A. Ghiasi and A.K. Esmailizadeh. 2009. Genetic polymorphism at the growth hormone locus in Iranian Talli goats by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP). Iranian Journal of Biotechnology, 7: 51-53.
21. Rahimi, A. and M. Mohaghegh Dolatabadi. 2013. Identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in exon 2 of the Growth Differentiation Factor 9 (GDF9) gene in Bahmani and Ghashghai sheep. Animal and Birds congress. North Iran, 1454-1458 (In Persian).
22. Shimasaki. S., R.K. Moore, G.F. Erickson and F. Otsuka. 2000. The role of bone morphogenetic proteins in ovarian function. Reproduction, 61: 323-337.
23. Yan, Cm., P. Wang, J. DeMayo, F.J. Demay and J.A. Elvin. 2001. Synergistic roles of bone morphogenetic protein 15 and growth differentiation factor 9 in ovarian function. Molecular Endocrinology, 15: 854-866. [DOI:10.1210/me.15.6.854]
24. Zamani, P., M. Akhondi and M.R. Mohammadabadi. 2015. Associations of Inter-Simple Sequence Repeat loci with predicted breeding values of body weight in sheep. Small Ruminant Research, 132: 123-127. [DOI:10.1016/j.smallrumres.2015.10.018]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production

Designed & Developed by : Yektaweb