دوره 10، شماره 25 - ( پاییز 1398 )                   جلد 10 شماره 25 صفحات 96-103 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

daneshvr amoli A, Esmaelkhanian S, Sanjabi M R, Mirhadi S A. Investigation of Polymorphism of Some Microsatellite Markers in Baluchi Sheep Population . rap. 2019; 10 (25) :96-103
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-672-fa.html
دانشور آملی عبدالرضا، اسماعیل خانیان سعید، سنجابی محمدرضا، میرهادی سید احمد. بررسی چندشکلی تعدادی از نشانگرهای ریزماهواره (Microsatellite) در یک جمعیت از گوسفندان بلوچی . پژوهشهاي توليدات دامي. 1398; 10 (25) :96-103

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-672-fa.html


جهاد دانشگاهی، مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران، بانک سلولهای انسانی و جانوری، تهران، ایران
چکیده:   (587 مشاهده)

    نظر به اهمیت حفظ و نگهداری نژادهای بومی به‌عنوان ذخایر ژنتیکی کشور، نژاد گوسفند بلوچی به‌عنوان پرجمعیت‌ترین نژاد گوسفند ایرانی و داشتن شجره قابل‌اطمینان، انتخاب شد. در این تحقیق با استفاده از 15 نشانگر ریزماهواره (TGLA231, OarVH110, McMA10, McMA1, McM214, McM139 McM63, LSCV38, LSCV36, KD101, BMS2721, BMS995, BMS332, BM1815, BM737 ( تنوع ژنتیکی در یک جمعیت از گوسفند بلوچی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 140 رأس دام از ایستگاه عباس‌آباد مشهد به‌صورت تصادفی انتخاب‌ شدند. پس از انجام واکنش‌های PCR، جایگاه McM139  به هیچ‌کدام از شرایط بهینه‌سازی تکثیر جواب نداد. جایگاه LSCV38 به علت داشتن آلل صفر زیاد و عدم وضوح آللی مورد استفاده قرار نگرفت. بقیه جایگاه‌ها در جمعیت مورد مطالعه چند­شکل بودند. تعداد آلل­های مشاهده‌شده از 6 آلل در جایگاه‌های BM737، BMS332، McMA10 تا 12 آلل در جایگاه McM63 و آلل مؤثر از 51/3 در جایگاه LSCV36 تا 66/8 در جایگاه OarVH110 متغیر بودند. بیشترین هتروزایگوسیتی مورد انتظار در جایگاه OarVH110با 12 آلل و به مقدار (890/0) و کمترین آن در جایگاه LSCV36 (718/0) با 7 آلل مشاهده شد. بیشترین محتوای اطلاعاتی چندشکلی (PIC) در جایگاه OarVH110 (873/0) و کمترین مقدار این معیار در جایگاه LSCV36 (669/0) بود. بیشترین و کمترین مقدار شاخص شانون به ترتیب برای جایگاه OarVH110 (21/2) و LSCV36 (47/1) برآورد شد. با توجه به نتایج، جایگاه‌های ریزماهواره مورداستفاده از چندشکلی بالایی در جمعیت گوسفند بلوچی برخوردار بودند و می‌توان از چندشکلی بالای آنها در مطالعات بعدی، به‌ویژه برای یافتن جایگاه‌های صفات کمی استفاده نمود. وجود آلل­ها و دامنه آللی جدید در این نژاد حاکی از تفاوت ساختار جمعیتی آنها در مقایسه با گوسفندان نژاد‌های خارجی است. 

متن کامل [PDF 1691 kb]   (152 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1395/8/4 | ویرایش نهایی: 1398/9/18 | پذیرش: 1398/3/12 | انتشار: 1398/9/4

فهرست منابع
1. Ruane, J. 1999. A critical review of the value of genetic distance studies in conservation of animal genetic resources. Journal of Animal Breeding and Genetics, 116(5): 317-323. [DOI:10.1046/j.1439-0388.1999.00205.x]
2. Amanlo, H. 2000. Genetic and Animal Breeding. Iran: Zanjan University.
3. Dodgson, J.B., H.H. Cheng and R. Okimoto. 1997. DNA marker technology: a revolution in animal genetics. Poultry Science, 76(8): 1108-1114. [DOI:10.1093/ps/76.8.1108]
4. Schlötterer, C. 2000. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA. Chromosoma, 109(6): p. 365-371. [DOI:10.1007/s004120000089]
5. Amoli, A.D., M. Aminafshar, S.A.S. Fazeli, N.E.J. Kashan and K.J. Khaledi. 2017. Isolation and characterization of Microsatellite markers from Endangered Species Camelus bactrianus. Iranian Journal of Applied Animal Science (IJAS), 7(4): 693-698.
6. Arranz, J., Y. Bayon and F. San Primitivo. 2001. Genetic variation at microsatellite loci in Spanish sheep. Small Ruminant Research, 39(1): 3-10. [DOI:10.1016/S0921-4488(00)00164-4]
7. Tomasco, I., G. Wlasiuk and E. Lessa. 2002. Evaluation of polymorphism in ten microsatellite loci in Uruguayan sheep flocks. Genetics and Molecular Biology, 25(1): 37-41. [DOI:10.1590/S1415-47572002000100008]
8. Banabazi, M.H., S. Esmaeilkhanian, S.M. Ashtiani and M.M. Shahrbabak. 2007. Gentic Variation Within and Between Five Iranian Sheep Populations Using Microsatellite Markers. JWSS- Isfahan University of Technology, 10(4): 481-488.
9. Dashab, G.R., A. Aslaminejad, M.R. Nasirri, A. Esmailizadeh and D.A. Saghi. 2011. Analysis of genetic diversity and structure of Baluchi Sheep by microsatellite markers. Tropical and Subtropical Agroecosystems, 14(3).
10. Gholizadeh, M. and M. Najafi. 2017. Association of genetic variation in exon 1 and 3 of FSHB gene with litter size in Baluchi Sheep. rap, 8(16): 177-182. [DOI:10.29252/rap.8.16.177]
11. Hosseinzadeh, S. and S.A. Rafat. 2017. Investigation of Relationship between DRB2 Gene Polymorphism and egg number of Marshallagia Marshalli Parasites in Gastrointestinal of Ghezel Sheep Breed. Research on Animal Production, 8(16): 152-157. [DOI:10.29252/rap.8.16.152]
12. Miller, S., D. Dykes and H. Polesky. 1988. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic acids research, 16(3): 1215. [DOI:10.1093/nar/16.3.1215]
13. Hulme, D., A. Smith, J. Silk, J. Redwin and K. Beh. 1995. Polymorphic sheep microsatellites at the McM2, McM131, McM135, McM136, McM140, McM200, McM214, McM373, McM505, McM507 and McM512 loci. Animal genetics, 26(5): 369a-370. [DOI:10.1111/j.1365-2052.1995.tb02681.x]
14. Ott, J. 1989. Program HET Version 1.10. Utility programs for analysis of genetic linkage. Rokefeller University, New York, USA, 20.
15. Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 89(3): 583-590.
16. Georges, M. and J.M. Massey. 1992. Polymorphic DNA markers in Bovidae. World Intellectual Property Organization.
17. Esmaeelkhanian, S. and R.V. Torshizi. 2007. Microsatellite variation in one breed of Iranian sheep with 12 markers. Pakistan journal of biological sciences: PJBS, 10(24): 4455-4460. [DOI:10.3923/pjbs.2007.4455.4460]
18. Nanekarani, S., C. Amirinia, N. Amirmozafari, R.V. Torshizi and A.A. Gharahdaghi. 2010. Genetic variation among pelt sheep population using microsatellite markers. African Journal of Biotechnology, 9(44): 7437-7445. [DOI:10.5897/AJB10.656]
19. Bishop, M.D., S.M. Kappes, J.W. Keele, R.T. Stone, S. Sunden, G.A. Hawkins, S.S. Toldo, R. Fries, M.D. Grosz, and J. Yoo. 1994. A genetic linkage map for cattle. Genetics, 136(2): 619-639.
20. Stone, R., J. Pulido, G. Duyk, S. Kappes, J. Keele and C.W. Beattie. 1995. A small-insert bovine genomic library highly enriched for microsatellite repeat sequences. Mammalian Genome, 6(10): p. 714-724. [DOI:10.1007/BF00354294]
21. Poissant, J., A. Shafer, C. Davis, J. Mainguy, J. Hogg, S. Coté and D. Coltman. 2009. Genome‐wide cross‐amplification of domestic sheep microsatellites in bighorn sheep and mountain goats. Molecular Ecology Resources, 9(4): 1121-1126. [DOI:10.1111/j.1755-0998.2009.02575.x]
22. Maddox, J., C. Riffkin and K. Beh. 2000. Dinucleotide repeat polymorphism at the ovine McMA1, McMA2, McMA5, McMA8, McMA9, McMA11, McMA14, McMA20, McMA24, McMA26 loci. Animal genetics, 31(2): 148-148. [DOI:10.1046/j.1365-2052.2000.00593.x]
23. Davies, K. and J. Maddox. 1997. Genetic linkage mapping of three anonymous ovine EST microsatellites: KD101, KD103 and KD721. Animal genetics, 28(6): 455-456. [DOI:10.1111/j.1365-2052.1997.tb03292.x]
24. Al-Atiyat, R.M. 2015. The power of 28 microsatellite markers for parentage testing in sheep. Electronic Journal of Biotechnology, 18(2): 116-121. [DOI:10.1016/j.ejbt.2015.01.001]
25. Paredes, M., A. Membrillo, J. Gutiérrez, I. Cervantes, P. Azor, R. Morante, A. Alonso-Moraga, A. Molina, and A. Muñoz-Serrano. 2014. Association of microsatellite markers with fiber diameter trait in Peruvian alpacas (Vicugna pacos). Livestock Science, 161: 6-16. [DOI:10.1016/j.livsci.2013.12.008]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2020 All Rights Reserved | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb