دوره 9، شماره 19 - ( بهار و تابستان 1397 )                   جلد 9 شماره 19 صفحات 54-62 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

khanahmadi A R, rahimi G, moradi shahre babak H, hafezian H, zandi M B. Genomic scan for detection of selective sweeps in Turkmen horse population. rap. 2018; 9 (19) :54-62
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-623-fa.html
خان احمدی علیرضا، رحیمی قدرت ا...، مرادی شهر بابک حسین، حافظیان سیدحسن، زندی باغچه مریم محمد باقر. کاوش ژنومی برای ردیابی نشانه‌های انتخاب در اسب نژاد ترکمن. پژوهشهاي توليدات دامي. 1397; 9 (19) :54-62

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-623-fa.html


دانشجو دانشگاه علوم کشاورزی ساری
چکیده:   (74 مشاهده)

     انتخاب در جهت افزایش فراوانی جهش­های جدیدی که در برخی از جمعیت­ها مفید هستند باعث به جا گذاشتن نشانه­هایی در سطح ژنوم می­شوند. از آنجایی که این مناطق غالبا صفات مهم اقتصادی را کنترل می­نمایند، در نتیجه شناسایی و ردیابی این مناطق از موضوعات مهم در مباحث ژنتیک حیوانی به حساب می­آید. هدف از انجام این تحقیق ردیابی نشانه­های انتخاب در سطح ژنوم در جمعیت اسب نژاد ترکمن با استفاده از 70000 نشانگر SNP بود. تعداد 23 رأس اسب نژاد ترکمن از مناطق مختلف گنبد کاووس انتخاب، بعد از خون­گیری و استخراج DNA، تعیین ژنوتیپ شدند. جهت جستجوی نشانه­های انتخاب از آزمون­های مبتنی بر عدم تعادل پیوستگی (LD) شامل آزمون EHH  (هموزیگوسیتی هاپلوتیپی بسط داده شده) و iHS (رتبه­بندی هاپلوتایپ یکپارچه) استفاده شد. برای شناسایی مناطقی از ژنوم که دارای بیشترین نشانه­های انتخاب بودند از آماره iHS استفاده شد و در نهایت 6 منطقه ژنومی که در صدک 9/99 % کل ارزش­های iHS قرار داشتند به­عنوان مناطق کاندیدای نشانه انتخاب، انتخاب شدند. این مناطق در کروموزوم­های 5، 4، 7، 8، 9 و 10 قرار داشتند. نتایج آماره EHH به همراه بررسی دیاگرام ­های شاخه­ بندی هاپلوتیپی وجود نشانه ­های انتخاب در این مناطق ژنومی را تأیید کرد. براساس نتایج حاصله از آماره EHH در برخی از جایگاه­ها فرسایش LD با سرعت بیشتر (کروموزوم 7، 9 و 10) و در برخی جایگاه­ها به کندی (4، 5 و 8) اتفاق افتاده است به­ طوریکه آلل­های موجود روی کروموزوم­ های 4،5 و 8 دامنه طولانی از LD داشته و فراوانی آنها به ترتیب برابر با 43، 52 و 37 درصد بودند. بنابراین، این مناطق از ژنوم اسب ترکمن احتمالا هدف انتخاب مثبت بوده است.

متن کامل [PDF 1173 kb]   (34 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA code

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2018 All Rights Reserved | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb