دوره 16، شماره 3 - ( پاییز 1404 )
جلد 16 شماره 3 صفحات 44-24 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Moradgholi K, Dashab G R, Rokouei M, Faraji Arough H. (2025). Bioinformatic Analysis of the FEZL Gene sequence in Sistani, Holstein, and their Crossbreds. Res Anim Prod. 16(3), 24-44. doi:10.61882/rap.2025.1485
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1485-fa.html
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1485-fa.html
مرادقلی کوثر، داشاب غلامرضا، رکوعی محمد، فرجی آروق هادی.(1404). تجزیه بیوانفورماتیکی توالی ژن FEZL درجمعیت گاوهای خالص سیستانی، هلشتاین و آمیخته های آنها پژوهشهاي توليدات دامي 16 (3) :44-24 10.61882/rap.2025.1485
1- گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران
2- گروه شترمرغ، پژوهشکده دام های خاص، پژوهشگاه زابل، زابل، ایران
2- گروه شترمرغ، پژوهشکده دام های خاص، پژوهشگاه زابل، زابل، ایران
چکیده: (1192 مشاهده)
چکیده مبسوط
مقدمه و هدف: FEZL یکی از ژن های کاندیدا مرتبط با عملکرد، صفات کیفی شیر و مقاومت به بیماری ورم پستان درگاوهای شیری است. ورم پستان یکی از بیماری های شایع در جمعیت گاوهای شیری است که ضرر و زیان های اقتصادی زیادی را بر دامدار تحمیل می کند. مطالعاتی که به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در جایگاه ژن FEZL و ارتباط آنها با شمار سلول های سوماتیکی شیر (SCC) انجام گرفته اند بیانگر وجود ارتباط معنی دار بین واریانت های ژنتیکی در جایگاه مذکور و شمار سلول های سوماتیکی شیر به عنوان شاخصی از ورم پستان هستند. همچنین، نتایج ضد و نقیض از اثرات واریانتهای ژن مذکور بر صفات کمی و کیفی شیر گزارش شده اند. لذا، هدف از این تحقیق بررسی میزان چندشکلی های مختلف حذف، اضافه و جهش ها در جایگاه FEZL، شناسایی واریانت مهم مرتبط با ترکیبات شیر و بررسی میزان تفرق بین نژادهای خالص و آمیخته گاو سیستانی و هلشتاین است.
مواد و روش ها: در تحقیق حاضر، تعداد 27 رأس گاو خالص سیستانی و هلشتاین (از هر گروه 10 رأس) و آمیخته های سیستانی با هلشتاین (7 رأس) از مرکز تحقیقات گاو سیستانی و گله های بومی منطقه سیستان به طور تصادفی انتخاب و خون گیری از ورید گردنی انجام گرفت. صفات کمی و کیفی شیر در یک دوره سه ماهه از دو دوشش صبح و عصر اندازه گیری شدند. DNA کل از نمونه های خون به روش نمکی-بهینه یافته استخراج شد. سپس DNA استخراج شده بر روی ژل آگارز 0/5 درصد الکتروفورز شد و نمونه هایی که کیفیت مناسبی داشتند، برای واکنش تکثیر PCR استفاده شدند. برای تکثیر قطعه 229 جفت بازی از جایگاه ژن FEZL از یک جفت آغازگر اختصاصی با چرخه دمایی در دستگاه ترموسیکلر استفاده شد. توالی یابی با نرم افزار (Chromas) با فرمت FASTA انجام و توالی های بی کیفیت حذف شدند. بعد از مرحله حذف نواحی، یک رشته منفرد از توالی رفت و برگشت تولید شد، و تولید کانتیگ با استفاده از نرم افزار CAP3 انجام شد. هم ترازی 27 نمونه با نرم افزارMEGA به صورت دوتایی و چندتایی انجام شد. تعداد چهار نمونه به دلیل همترازی نامطلوب حذف و 23 نمونه برای آنالیز بعدی ذخیره شدند. تجزیه نواحی چندشکلی ناشی از جهش ها، حذف و اضافه و هاپلوتیپی با نرم افزارهای MEGA6 و DNASP5 انجام شد. در نهایت، میزان اثر هر نشانگر با صفات کیفی شیر با مدل تک نشانگری و رویه GLM نرم افزار SAS9 برآورد شد. برای کاهش خطای نوع اول در تست های چندگانه از تست بنفرونی در سطح احتمال 5 درصد استفاده شد. در نهایت، میانگین های گروه ها با روش توکی-کرامر در سطح احتمال 5 درصد مقایسه شدند.
یافته ها: در مجموع، 86 ناحیه چندشکل در اگزون 1 ژن FEZL در بین جمعیت های خالص و آمیخته شناسایی شدند. در کل نمونه ها، درصد جایگزینی انتقالی 32/56 درصد و تقاطعی 67/44 درصد بودند. درصدهای جایگزینی انتقالی و تقاطعی به ترتیب در نژاد هلشتاین 50/6 و 49/4 درصد، در نژاد سیستانی 28/08 و 71/92 درصد و در آمیخته ها 33/55 و 66/45 درصد برآورد شدند. در مقایسه، درصد جایگزینی انتقالی در نژاد سیستانی کمترین و در هلشتاین بیشترین بود، اما درصد جایگزینی تقاطعی در هلشتاین کمترین و سیستانی بیشترین بود. ضریب نسبت جایگزینی انتقالی به تقاطعی به عنوان شاخصی از تکامل در طی دوره های گذشته (مقادیر 0/5 حد خنثی، بیش از 0/5 نشانگر دخالت انتخاب و کمتر از 5/0 بیانگر عدم دخالت انتخاب و تأثیر سایر عوامل تکاملی شامل جهش و مهاجرت هستند)، در هلشتاین بالاترین (0/75) و در سیستانی کمترین (0/30) بود. در تمامی جمعیت ها، درصد فراوانی بازها در توالی نوکلئوتیدی ناحیه اگزون 1 ژن FEZL، باز تیمین کمترین و باز سیتوزین بالاترین فراوانی را داشتند. بالاترین واگرایی در درون نژادها مربوط به آمیخته های هلشتاین و سیستانی (0/15) و کمترین میزان واگرایی متعلق به نژاد سیستانی (0/044) بود. از میزان واگرایی در بین نژادهای مختلف، بالاترین میزان واگرایی بین آمیخته ها با هلشتاین (10/126) و کمترین بین سیستانی با آمیخته ها (0/012) بود. از تعداد 77 جایگاه چندشکل (SNP) 33 مورد دو واریانتی، 9 مورد سه واریانتی و دو مورد چهار واریانتی بودند. از نظر ترکیبات شیر، در نژاد سیستانی درصدهای چربی، پروتئین، لاکتوز و ماده خشک بدون چربی بالاترین و در نژاد هلشتاین کمترین بودند و در آمیخته ها در حد واسط قرار داشتند. اثر نژاد بر تمام صفات شیر به جز درصد پروتئین معنی دار بود (0/01 >P ). از بین نشانگرهای چندشکلی (SNP)، نشانگر در موقعیت 97 جفت بازی اگزون 1 ژن FEZL بالاترین میزان اثر بر صفات درصدهای چربی، لاکتوز، پروتئین و ماده خشک بدون چربی شیر را داشت (0/01 > P).
نتیجه گیری: چندشکلی های مختلف در اگزون 1 ژن FEZL و میزان فاصله ژنتیکی موجود در بین و درون نژادهای هلشتاین و سیستانی را می توان به عنوان نشانگرهای مفید در اصلاح دام های بومی در نظر گرفت و از قدرت ترکیب پذیری واریانت ها در آمیخته ها جهت بهبود صفات اقتصادی شیر استفاده نمود. همچنین، چندشکلی در ناحیه مذکور را می توان همچنان به عنوان یک نشانگر در بهبود شمار سلول های سوماتیکی شیر به عنوان شاخصی از کنترل ورم پستان در گاوهای شیری استفاده نمود که در این تحقیق امکان اندازه گیری آن فراهم نگردید و در مطالعات بعدی توصیه می گردد.
مقدمه و هدف: FEZL یکی از ژن های کاندیدا مرتبط با عملکرد، صفات کیفی شیر و مقاومت به بیماری ورم پستان درگاوهای شیری است. ورم پستان یکی از بیماری های شایع در جمعیت گاوهای شیری است که ضرر و زیان های اقتصادی زیادی را بر دامدار تحمیل می کند. مطالعاتی که به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در جایگاه ژن FEZL و ارتباط آنها با شمار سلول های سوماتیکی شیر (SCC) انجام گرفته اند بیانگر وجود ارتباط معنی دار بین واریانت های ژنتیکی در جایگاه مذکور و شمار سلول های سوماتیکی شیر به عنوان شاخصی از ورم پستان هستند. همچنین، نتایج ضد و نقیض از اثرات واریانتهای ژن مذکور بر صفات کمی و کیفی شیر گزارش شده اند. لذا، هدف از این تحقیق بررسی میزان چندشکلی های مختلف حذف، اضافه و جهش ها در جایگاه FEZL، شناسایی واریانت مهم مرتبط با ترکیبات شیر و بررسی میزان تفرق بین نژادهای خالص و آمیخته گاو سیستانی و هلشتاین است.
مواد و روش ها: در تحقیق حاضر، تعداد 27 رأس گاو خالص سیستانی و هلشتاین (از هر گروه 10 رأس) و آمیخته های سیستانی با هلشتاین (7 رأس) از مرکز تحقیقات گاو سیستانی و گله های بومی منطقه سیستان به طور تصادفی انتخاب و خون گیری از ورید گردنی انجام گرفت. صفات کمی و کیفی شیر در یک دوره سه ماهه از دو دوشش صبح و عصر اندازه گیری شدند. DNA کل از نمونه های خون به روش نمکی-بهینه یافته استخراج شد. سپس DNA استخراج شده بر روی ژل آگارز 0/5 درصد الکتروفورز شد و نمونه هایی که کیفیت مناسبی داشتند، برای واکنش تکثیر PCR استفاده شدند. برای تکثیر قطعه 229 جفت بازی از جایگاه ژن FEZL از یک جفت آغازگر اختصاصی با چرخه دمایی در دستگاه ترموسیکلر استفاده شد. توالی یابی با نرم افزار (Chromas) با فرمت FASTA انجام و توالی های بی کیفیت حذف شدند. بعد از مرحله حذف نواحی، یک رشته منفرد از توالی رفت و برگشت تولید شد، و تولید کانتیگ با استفاده از نرم افزار CAP3 انجام شد. هم ترازی 27 نمونه با نرم افزارMEGA به صورت دوتایی و چندتایی انجام شد. تعداد چهار نمونه به دلیل همترازی نامطلوب حذف و 23 نمونه برای آنالیز بعدی ذخیره شدند. تجزیه نواحی چندشکلی ناشی از جهش ها، حذف و اضافه و هاپلوتیپی با نرم افزارهای MEGA6 و DNASP5 انجام شد. در نهایت، میزان اثر هر نشانگر با صفات کیفی شیر با مدل تک نشانگری و رویه GLM نرم افزار SAS9 برآورد شد. برای کاهش خطای نوع اول در تست های چندگانه از تست بنفرونی در سطح احتمال 5 درصد استفاده شد. در نهایت، میانگین های گروه ها با روش توکی-کرامر در سطح احتمال 5 درصد مقایسه شدند.
یافته ها: در مجموع، 86 ناحیه چندشکل در اگزون 1 ژن FEZL در بین جمعیت های خالص و آمیخته شناسایی شدند. در کل نمونه ها، درصد جایگزینی انتقالی 32/56 درصد و تقاطعی 67/44 درصد بودند. درصدهای جایگزینی انتقالی و تقاطعی به ترتیب در نژاد هلشتاین 50/6 و 49/4 درصد، در نژاد سیستانی 28/08 و 71/92 درصد و در آمیخته ها 33/55 و 66/45 درصد برآورد شدند. در مقایسه، درصد جایگزینی انتقالی در نژاد سیستانی کمترین و در هلشتاین بیشترین بود، اما درصد جایگزینی تقاطعی در هلشتاین کمترین و سیستانی بیشترین بود. ضریب نسبت جایگزینی انتقالی به تقاطعی به عنوان شاخصی از تکامل در طی دوره های گذشته (مقادیر 0/5 حد خنثی، بیش از 0/5 نشانگر دخالت انتخاب و کمتر از 5/0 بیانگر عدم دخالت انتخاب و تأثیر سایر عوامل تکاملی شامل جهش و مهاجرت هستند)، در هلشتاین بالاترین (0/75) و در سیستانی کمترین (0/30) بود. در تمامی جمعیت ها، درصد فراوانی بازها در توالی نوکلئوتیدی ناحیه اگزون 1 ژن FEZL، باز تیمین کمترین و باز سیتوزین بالاترین فراوانی را داشتند. بالاترین واگرایی در درون نژادها مربوط به آمیخته های هلشتاین و سیستانی (0/15) و کمترین میزان واگرایی متعلق به نژاد سیستانی (0/044) بود. از میزان واگرایی در بین نژادهای مختلف، بالاترین میزان واگرایی بین آمیخته ها با هلشتاین (10/126) و کمترین بین سیستانی با آمیخته ها (0/012) بود. از تعداد 77 جایگاه چندشکل (SNP) 33 مورد دو واریانتی، 9 مورد سه واریانتی و دو مورد چهار واریانتی بودند. از نظر ترکیبات شیر، در نژاد سیستانی درصدهای چربی، پروتئین، لاکتوز و ماده خشک بدون چربی بالاترین و در نژاد هلشتاین کمترین بودند و در آمیخته ها در حد واسط قرار داشتند. اثر نژاد بر تمام صفات شیر به جز درصد پروتئین معنی دار بود (0/01 >P ). از بین نشانگرهای چندشکلی (SNP)، نشانگر در موقعیت 97 جفت بازی اگزون 1 ژن FEZL بالاترین میزان اثر بر صفات درصدهای چربی، لاکتوز، پروتئین و ماده خشک بدون چربی شیر را داشت (0/01 > P).
نتیجه گیری: چندشکلی های مختلف در اگزون 1 ژن FEZL و میزان فاصله ژنتیکی موجود در بین و درون نژادهای هلشتاین و سیستانی را می توان به عنوان نشانگرهای مفید در اصلاح دام های بومی در نظر گرفت و از قدرت ترکیب پذیری واریانت ها در آمیخته ها جهت بهبود صفات اقتصادی شیر استفاده نمود. همچنین، چندشکلی در ناحیه مذکور را می توان همچنان به عنوان یک نشانگر در بهبود شمار سلول های سوماتیکی شیر به عنوان شاخصی از کنترل ورم پستان در گاوهای شیری استفاده نمود که در این تحقیق امکان اندازه گیری آن فراهم نگردید و در مطالعات بعدی توصیه می گردد.
فهرست منابع
1. Adesina, K. (2012). Effect of breed on the composition of cow milk under traditional management practices in Ado-Ekiti, Nigeria. Journal of Applied Science and Environmental Management, 16(1), 55-59.
2. Ahsani, M. R., Mohammadabadi, M., Buchkovska, V. and Ievstafiieva, Y. M. (2022). Association of Stearoyl‐CoA Desaturase Expression with Cattle Milk Characteristics. Iranian Journal of Applied Animal Science, 12(2), 271-279.
3. Ali, G. E., Ibrahim, M. A. & Zaki, S. M. (2019). Association assessment of single nucleotide polymorphism in Forebrain Embryonic Zinc Finger-Like (FEZL) gene with mastitis susceptibility in Holstein cattle (Bos Taurus). Large Animal Review, 25, 163-171.
4. Alinaghizadeh, R., Mohammad Abadi, M. R., & Moradnasab Badrabadi, S. (2007). Kappa-casein gene study in Iranian Sistani cattle breed (Bos indicus) using PCR-RFLP. Pakistan Journal of Biological Sciences, 10(23), 4291-4294. [DOI:10.3923/pjbs.2007.4291.4294]
5. Asghari, E. B., Dashab, G. R., Banabazi, M. H., & Rokouei, M. (2021). Analysis of genetic differences in genes associated with immune response among purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde cow population using RNA-Seq data. Research on Animal Production, 12(31), 134-145. DOI:10.52547/rap.12.31.134 [In Persian] [DOI:10.52547/rap.12.31.134]
6. Ateya, A., Ibrahim, S., & Al-Sharif, M. (2022). Single nucleotide polymorphisms, gene expression and economic evaluation of parameters associated with mastitis susceptibility in European cattle breeds. Veterinary Science, 9(6), 294. DOI: 10.3390/vetsci9060294 [DOI:10.3390/vetsci9060294]
7. Badakhshan, Y., & Mohammadabadi, M. R. (2015). Thermoregulatory mechanisms of jersey adult cattle and calves based on different body sites temperature. Iranian Journal of Applied Animal Science, 5(4), 793-798.
8. Barazandeh, A., Mohammadabadi, M. R., & Ghaderi-Zefrehei, M. (2016). Predicting CpG Islands and Their Relationship with Genomic Feature in Cattle by Hidden Markov Model Algorithm. Iranian Journal of Applied Animal Science, 6(3), 571-579.
9. Birjandi, M. R. (1997). Investigating the status of breeding and determining milk production capacity and milking characteristics of Sistani cattle in Sistan region. Abstract Research projects of the Ministry of Jihad (Volume II), pp. 368-370. [In Persian]
10. Bordbar, F., Mohammadabadi, M., Jensen, J., Xu, L., Li, J., & Zhang, L. (2022). Identification of candidate genes regulating carcass depth and hind leg circumference in simmental beef cattle using Illumina Bovine Beadchip and next-generation sequencing. Animals, 12 (9), 1103. [DOI:10.3390/ani12091103]
11. Carlén, E., Strandberg, E., & Roth, A. (2004). Genetic parameters for clinical mastitis, somatic cell score, and production in the first three lactations of Swedish Holstein cows. Journal Dairy Science, 87, 3062- 3070. [DOI:10.3168/jds.S0022-0302(04)73439-6]
12. Chegini, A., Hossein-Zadeh, N. G., Hosseini-Moghadam, H., & Shadparvar, A. A. (2016). Estimation of genetic and environmental relationships between milk yield and different measures of mastitis and hyperkeratosis in Holstein cows. Acta Scientiaraum, 38, 191-196. [DOI:10.4025/actascianimsci.v38i2.29207]
13. Cole, J. B., Makanjuola, B. O., Rochus, C. M., van Staaveren, N., & Baes, C. (2023). The effects of breeding and selection on lactation in dairy cattle. Animal Frontiers, 13(3), 62-70.
https://doi.org/10.1093/af/vfad044 [DOI:10.1093/af/vfad044.]
14. Ehsaninia, J., Moradi, M., Haffezian, S. S. H., & Sayad, M. B. (2011). Crossbreeding effects on milk fatyields performance of Iran population local cattle. Animal Sciences Journal, 91, 27-33. [In Persian]
15. Ghada, G. G., & Abdalla, E. A. (2019). Physiological study on nano particle to improve immune response and performance of broiler chicken. Egyptian Journal of Nutrition and Feeds, 22(3), 635-646. Doi: 10.21608/ejnf.2019.79502. [DOI:10.21608/ejnf.2019.79502]
16. Gorbani, A., & Behpai, M. (2020). Association of GDF9 gene polymorphism with sperm quality and quantity traits in Iranian Holstein bulls. Research Animal Production, 11(27), 95-100. Doi: 10.29252/rap.11.27.95. [In Persian] [DOI:10.29252/rap.11.27.95]
17. Heyen, D. W., Weller, J. I., Ron, M., Band, M., Beever, J. E., Feldmesser, E., Da, Y., Wiggans, G. R., VanRaden, P. M., & Lewin, H. A. (1999). A genome scan for QTL influencing milk production and health traits in dairy cattle. Physiological Genomics, 1, 165-175. [DOI:10.1152/physiolgenomics.1999.1.3.165]
18. DOI: 10.1152/physiolgenomics.1999.1.3.165. [DOI:10.1152/physiolgenomics.1999.1.3.165]
19. Hirata, T., Suda, Y., Nakao, K., Narimatsu, M., Hirano, T., & Hibi, M. (2004). Zinc finger gene fez-like functions in the formation of subplate neurons and thalamocortical axons. Develop-Mental Dynamics, 230, 546-556. DOI: 10.1002/dvdy.20068. [DOI:10.1002/dvdy.20068]
20. Huang, X., & Madan, A. (1999). CAP3: A DNA sequence assembly program. Genome Research, 9, 868-877. DOI: 10.1101/gr.9.9.868. [DOI:10.1101/gr.9.9.868]
21. Jafari Ahmadabadi, S. A. A., Askari-Hemmat, H., Mohammadabadi. M., Asadi Fouzi. M., & Mansouri, M. (2023). The effect of Cannabis seed on DLK1 gene expression in heart tissue of Kermani lambs. Agricultural Biotechnology Journal, 15(1), 217-234.
22. Kamalzadeh, A., Rajabbaigy, M., & Kiasat, A. (2008). Livestock production systems and trends in livestock industry in Iran. Journal of Agriculture and Social Sciences, 4, 183-188.
23. Kebede, E. (2018). Effect of cattle breeds on milk composition in the same management conditions. Ethiopia Journal of Agricultural Science, 28(2), 53-63.
24. Librado, P., & Rozas, J. (2009). DnaSP v5: software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Journal of Bioinformatics, 25, 1451-1452. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp187. [DOI:10.1093/bioinformatics/btp187]
25. Lopez, A., & Bonasora, M. G. (2017). Phylogeography, genetic diversity and population structure in a Patagonian endemic plant. AoB Plants, 16(4), 275. DOI: 10.1093/aobpla/plx017. [DOI:10.1093/aobpla/plx017]
26. Malik, T. A., Mohini, M., Mir, S. H., Ganaie, B. A., Singh, D., Varun, T. K., Howal, S., & Thakur, S. (2018). Somatic cells in relation to udder health and milk quality-a review. Journal Animal Health Production, 6(1), 18-26. DOI: 10.17582/journal.jahp/2018/6.1.18.26. [DOI:10.17582/journal.jahp/2018/6.1.18.26]
27. Matsuo-Takasaki, M., Lim, J. H., Beanan, M. J., Sato, S. M., & Sargent, T. D. (2000). Cloning and expression of a novel zinc finger gene, Fez, transcribed in the forebrain of Xenopus and mouse embryos. Mechanisms of Development, 93, 201-204.
https://doi.org/10.1016/S0925-4773(00)00264-1 [DOI:10.1016/S0925-4773(00)00264-1.]
28. Mehmarian, M. (2006). Cattle and buffalo fattening. First Edition, Research and Construction Publications, Mashhad, 113-123. [In Persian]
29. Mohammadabadi, M., Golkar, A., & Askari Hesni, M. (2023). The effect of fennel (Foeniculum vulgare) on insulin-like growth factor 1 gene expression in the rumen tissue of Kermani sheep. Agricultural Biotechnology Journal, 15(4), 239-256.
30. Naderi Y. (2004). The effect of maternal factors on growth traits in Moghani breed sheep, master's thesis. Higher Education Complex of Agricultural Sciences and Agricultural Natural Resources, Sari University of Mazandaran, pp. 98. [In Persian]
31. Nafez, M., Zerehdaran, S., Hassani, S., & Samiei, R. (2012). Genetic Evaluation of Productive and Reproductive Traits of Holstein Dairy Cows in the North of Iran. Iranian Journal of Animal Science Research, 4(1),69-77. DOI: 10.22067/ijasr.v4i1.13914. [In Persian]
32. Nejad, F. M., Mohammadabadi, M., Roudbari, Z., Gorji, A. E., & Sadkowski, T. (2024). Network visualization of genes involved in skeletal muscle myogenesis in livestock animals. BMC Genomics, 25 (1), 294. [DOI:10.1186/s12864-024-10196-3]
33. Norouzy, A., Nassiry, M. R., Shahrody, F. E., Javadmanesh, A., Abadi, M. R. M., & Sulimova, G. E. (2005). Identification of bovine leucocyte adhesion deficiency (BLAD) carriers in Holstein and Brown Swiss AI bulls in Iran. Russian Journal of Genetics, 41(12), 1409-1413. [DOI:10.1007/s11177-006-0014-7]
34. Ogorevc, J., Prpar, S., & Dovc, P. (2000). Establishment and characterization of a caprine mammary epithelial cell line. In vitro Cell Development Biology Science, 36(1), 26-37. DOI: 10.1290/1071-2690(2000)036<0026: EACOAC>2.0.CO;2.
https://doi.org/10.1290/1071-2690(2000)036<0026:EACOAC>2.3.CO;2 [DOI:10.1290/1071-2690(2000)0362.3.CO;2]
35. Petersen, G., & Seberg, O. (2003). Phylogenetic analyses of the diploid species of Hordeum (Poaceae) and a revised classification of the genus. Systematic Botany, 28, 293-306. DOI: 10.1043/0363-6445-28.2.293.
36. Razavi, M., Vatankhah, M., Mirzaei, H., & Rokouei, M. (2006). Estimation of genetic trend of productive traits in Holstein cows of Central Province. Research and Construction, 77, 63-55. [In Persian]
37. Sanchez, M. P., Govignon-Gion, A., Ferrand, M., Gelé, M., Pourchet, D., Amigues, Y., Fritz, S., Boussaha, M., Capitan, A., & Rocha, D. (2016). Whole-genome scan to detect quantitative trait loci associated with milk protein composition in 3 French dairy cattle breeds. Journal of Dairy Science, 99, 8203-8215.
https://doi.org/10.3168/jds.2016-11437 [DOI:10.3168/jds.2016-11437.]
38. Sanchez, M. P., Govignon-Gion, A., Croiseau, P., Fritz, S., Hozé, C., Miranda, G., Martin, P., Barbat-Leterrier, A., Letaïef, R., & Rocha, D. (2017). Within-breed and multi-breed GWAS on imputed whole-genome sequence variants reveal candidate mutations affecting milk protein composition in dairy cattle. Genetic Selection Evolution, 49, 68. DOI: 10.1186/s12711-017-0344-z. [DOI:10.1186/s12711-017-0344-z]
39. Shokri, S., Khezri, A., Mohammadabadi, M., & Kheyrodin, H. (2023). The expression of MYH7 gene in femur, humeral muscle and back muscle tissues of fattening lambs of the Kermani breed. Agricultural Biotechnology Journal, 15(2), 217-236.
40. Somasundaram, R. K., Gupta, I. D., Raja, K. N., Periasamy, K., & Ramasamy, S. (2020). Polymorphism of Bovine Forebrain Embryonic Zinc Finger Like (FEZL) gene associated with resistance to mastitis in Indian cattle. International Journal of Livestock Research, 10(8), 144-149.
https://doi.org/10.5455/ijlr.20200425120435 [DOI:10.5455/ijlr.20200425120435.]
41. Sugimoto, M., & Sugimoto, Y. (2012). Variant in the 5'untranslated region of insulin-like growth factor 1 receptor is associated with susceptibility to mastitis in cattle. G3, 2, 1077-1084. DOI: 10.1534/g3.112.003095. [DOI:10.1534/g3.112.003095]
42. Sugimoto, M., Fujikawa, A., Womack, J. E., & Sugimoto, Y. (2006). Evidence that bovine forebrain embryonic zinc finger-like gene influences immune response associated with mastitis resistance. Proceedings of National Academy of Sciences, 103(17), 6454-6459. DOI: 10.1073/pnas.0601015103. [DOI:10.1073/pnas.0601015103]
43. Sugimoto, M., Itoh, T., Gotoh, Y., Kawahara, T., Moriya, H., Uchimura, Y., & Sugimoto, Y. (2011). Enhanced clinical mastitis resistance in Holsteins with a FEZL p.Gly105(12/13) polymorphism. Journal of Dairy Science, 94, 2103-2107.
https://doi.org/10.3168/jds.2010-3362 [DOI:10.3168/jds.2010-3362.]
44. Sugimoto, M., Uchiza, M., & Kuniyuki, M. (2013). Effects of a Forebrain embryonic zinc finger-like p.Gly105 (12:13) polymorphism on mastitis resistance: an embryo-transfer study. Molecular Biology and Genetic Engineering, 1(1), 2053-5767. DOI:10.7243/2053-5767-1-1. [DOI:10.7243/2053-5767-1-1]
45. Tamura, K., & Nei, M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution, 10, 512-526. DOI: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040023. [DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a040023]
46. Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A., & Kumar, S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution, 30, 2725-2729. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. [DOI:10.1093/molbev/mst197]
47. Urioste, J. I., Franzén, J., Windig, J. J., & Strandberg, E. (2012). Genetic relationships among mastitis and alternative somatic cell count traits in the first 3 lactations of Swedish Holsteins. Journal of Dairy Science, 95(6), 3428-3434. DOI: 10.3168/jds.2011-4739. [DOI:10.3168/jds.2011-4739]
48. Wall, R. J., Powell, A. M., Paape, M. J., Kerr, D. E., Bannerman, D. D., Pursel, V. G., Wells, K. D., Talbot, N., & Hawk, H. W. (2005). Genetically enhanced cows resist intramammary Staphylococcus aureus infection. Nature Biotechnology, 23, 445-451. DOI: 10.1038/nbt1078. [DOI:10.1038/nbt1078]
49. Wu, J. Y., Feng, L., Park, H. T., Havlioglu, N., Wen, L., Tang, H., Bacon, K. B., Jiang, Z., Zhang, X. C., & Rao, Y. (2001). The neuronal repellent slit, a molecule known to guide axon projection and neuronal migration, inhibits leukocyte chemotaxis induced by chemotactic factors. Nature, 410, 948-952. DOI: 10.1038/35073616. [DOI:10.1038/35073616]
50. Yang, T. X., Li, H., Wang, F., Liu, X. L., & Li, Q. Y. (2013). Effect of cattle breeds on milk composition and technological characteristics in China. Asian-Australasia Journal Animal Science, 26(6), 896-904. DOI: 10.5713/ajas.2012.12677. [DOI:10.5713/ajas.2012.12677]
51. Zhang, C., Fan, X., Yu, H. Q., Zhang, H. Q., Wang, X. L., & Zhou, Y. H., (2009). Phylogenetic analysis of questionable tetraploid species in Roegneria and Pseudoroegneria (Poaceae: Triticeae) inferred from a gene encoding plastid acety1-CoA carboxylase. Biochemical Systematics and Ecology, 37, 412-420.
https://doi.org/10.1016/j.bse.2009.04.011 [DOI:10.1016/j.bse.2009.04.011.]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
