دوره 14، شماره 39 - ( بهار 1402 )                   جلد 14 شماره 39 صفحات 153-145 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Karimi M, Ghafouri-Kesbi F, Zamani P. Investigating the Impact of Dominance Genetic Effects on the Accuracy of Genomic Evaluation. rap 2024; 14 (39) :145-153
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1342-fa.html
کریمی مسلم، غفوری کسبی فرهاد، زمانی پویا. بررسی میزان تأثیر اثرات ژنتیکی غالبیت بر صحت ارزیابی ژنومی. پژوهشهاي توليدات دامي. 1402; 14 (39) :145-153

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1342-fa.html


گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایران
چکیده:   (251 مشاهده)
چکیده مبسوط
مقدمه و هدف:
بررسی مقالات منتشر شده در حوزه انتخاب ژنومی نشان می ­دهد که در اکثر مطالعات انجام شده در گونه­ های دامی و زراعی ارزیابی ژنومی و پیش­ بینی ارزش­ های اصلاحی ژنومی بدون در نظر گرفتن اثرات ژنتیکی غالبیت انجام شده است. در صورتیکه مطالعاتی که اخیرا انجام شده، نشان می­دهند که اثرات ژنتیکی غالبیت به نحو قابل توجهی در تنوع فنوتیپی صفات تولیدی دام ­های اهلی مشارکت دارند. از این رو به ­نظر می­رسد چشم پوشی از اثرات ژنتیکی غالبیت صحت ارزیابی ژنومی را تحت تاثیر قرار می­دهد. در این مطالعه پیامدهای در نظر نگرفتن اثرات ژنتیکی غالبیت در مدل ارزیابی ژنومی بر صحت، میانگین مربعات خطا، اریبی و قابلیت اعتماد ارزش­ های اصلاحی ژنومی بررسی شد.

مواد و روش­ ها: ژنومی شامل 5 کروموزوم، هر کدام به طول یک مورگان و حاوی 5000 نشانگر تک نوکلئوتیدی دو آللی (SNP) در سطح وراثتپذیری 0/5 شبیه­ سازی شد. به همه جایگاه­ های صفات کمی (QTLها) اثرات ژنتیکی افزایشی داده شد. توزیع ­های متفاوت اثرات QTL (یکنواخت، نرمال و گاما) و نیز سه سناریو از تعدادQTL  به‌صورت 5، 10 و 20% از تعداد کل SNPها (به‌ترتیب 250، 500 و 1000 QTL) به‌صورت فرضیه­های شبیه­سازی در نظر گرفته شد. در سناریوهای مختلف به صفر، 10، 25، 50 و 100% از QTLها اثرات غالبیت داده شد. ارزش ­های اصلاحی ژنومی با استفاده از روش بهترین پیشبینی نااریب خطی ژنومی (GBLUP) برآرود شده و شاخص ­های روش LR، شامل صحت پیشبینی، میانگین مربعات خطای پیشبینی، اریبی و قابلیت اعتماد ارزش ­های اصلاحی برای تجزیه و تحلیل ارزش ­های اصلاحی حاصل از GBLUP مورد استفاده قرار گرفتند.
یافته­ ها: نتایج نشان داد در صورتیکه اثرات ژنتیک غالبیت در تنوع فنوتیپی صفت مشارکت داشته باشند اما در مدل ارزیابی ژنومی لحاظ نشده و به‌صورت تفکیک نشده از اثرات ژنتیکی افزایشی باقی بمانند، منجر به کاهش صحت ارزش­ های اصلاحی ژنومی تا حدود 25% خواهد شد. همچنین میانگین مربعات خطای پیش­بینی ارزش ­های اصلاحی ژنومی نیز با افزایش درصد QTLهای دارای اثر غالبیت (از 0/00 به 100%) تا 60% افزایش یافت. میزان اریبی ارزش ­های اصلاحی ژنومی نیز تحت تاثیر چشم پوشی از اثرات غالبیت قرار گرفت و با افزایش درصد QTLهای دارای اثر غالبیت (از 0/00 به 100%) تا 36% افزایش یافت. در ضمن قابلیت اعتماد ارزش ­های اصلاحی ژنومی نیز به‌طور چشمگیری با افزایش درصد QTLهای دارای اثر غالبیت (از 00/00 به 100%) تا حدود 40% کاهش یافت.
نتیجه‌گیری: به‌طورکلی نتایج این تحقیق نشان داد که عدم تفکیک اثرات ژنتیکی غالبیت از اثرات ژنتیکی افزایشی منجر به برآوردهای با صحت پایین، اریب و غیرقابل اعتماد از ارزش های اصلاحی ژنومی می­ شود که در نهایت بازدهی انتخاب ژنومی را کاهش می­ دهد. بنابراین پیشنهاد می شود که به‌منظور افزایش کارایی طرح­ های انتخاب ژنومی، اثرات غالبیت در مدل ارزیابی ژنومی منظور شود.

متن کامل [PDF 1524 kb]   (4 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1401/9/15 | ویرایش نهایی: 1402/3/9 | پذیرش: 1401/11/5 | انتشار: 1402/3/9

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2023 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production

Designed & Developed by : Yektaweb