دانشگاه گیلان
چکیده: (87 مشاهده)
هدف تحقیق حاضر بررسی اثر روش برآورد اثرات نشانگری، توزیع اثرات QTLها، تعداد QTL، اندازه موثر جمعیت و وراثت پذیری صفت بر صحت ارزیابی های ژنومی بود. جمعیت پایه با دو اندازه موثر 100 و 500 فرد در نظر گرفته شده و به وسیله نرم افزار QMSim شبیه سازی شد. برای انجام این تحقیق، ژنومی متشکل از یک کروموزوم به طول 100 سانتی مورگان با تعداد 500 نشانگر SNP در طول ژنوم و با تعداد متفاوت QTL ( 50 و 200) که آنها نیز به طور تصادفی روی کروموزوم پراکنده شده اند شبیه سازی شد. در این تحقیق، سه صفت با وراثت پذیری 1/0 ، 3/0 و 5/0 مورد بررسی قرار گرفت. ارزش های اصلاحی ژنومی به وسیله روشهای رگرسیون ریج بیزی (BRR)، بیز A( BayesA)، بیز B( BayesB)، بیز C( BayesC)، بیز لزو ) BayesL)، روش نیمه پارامتری بر پایه کرنل (RKHS ) و شبکه های عصبی ( NN) پیش بینی شدند. بر اساس نتایج بدست آمده، عوامل وراثت پذیری، اندازه موثر جمعیت، روش برآورد اثرات نشانگری، توزیع QTL و تعداد QTL بر صحت ارزیابی ژنومی تاثیر محسوسی داشتند. بین روشهای برآورد اثرات نشانگری، روش های بیز A و B بیشترین و روش شبکه های عصبی کمترین صحت را داشتند. در تحقیق حاضر با افزایش وراثت پذیری و تعداد QTL، صحت پیش بینی های ژنومی افزایش و برعکس با کاهش اندازه موثر جمعیت، کاهش یافت. بیشترین صحت زمانی بدست آمد که QTLها دارای توزیع نرمال بودند.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1398/12/7 | ویرایش نهایی: 1399/10/13 | پذیرش: 1399/8/19
دریافت: 1398/12/7 | ویرایش نهایی: 1399/10/13 | پذیرش: 1399/8/19
ارسال پیام به نویسنده مسئول
