دوره 10، شماره 26 - ( زمستان 1398 )                   جلد 10 شماره 26 صفحات 122-131 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Madad M, shodja J, Alijani S, Rafat S A, Dekkers J. Comparison of Single and Multi-Step Bayesian Methods for Predicting Genomic Breeding Values in Genotyped and Non-Genotyped Animals- A Simulation Study. rap. 2019; 10 (26) :122-131
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1024-fa.html
مدد مصطفی، شجاع جلیل، علیجانی صادق، رافت سید عباس، دکرز جک. مقایسه روش‌های چند مرحله‌ای و تک ‌مرحله‌ای بیزی برای برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی در حیوانات ژنوتیپ شده و نشده- مطالعه شبیه‌سازی. پژوهشهاي توليدات دامي. 1398; 10 (26) :122-131

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1024-fa.html


گروه علوم دامی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
چکیده:   (122 مشاهده)
     هدف از این مطالعه، مقایسه صحت ارزیابی ژنومی روش‌های چندمرحله‌ای BayesA، BayesB،BayesC ، BayesL و روش‌های تک‌مرحله‌ای بیزیSSBR-C و SSBR-A در مقادیر متفاوت π برای برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی حیوانات تعیین ژنوتیپ شده و نشده بود. ژنومی حاوی 40000 نشانگر تک‌نوکلئوتیدی دوآللی پراکنده شده روی 20 کروموزوم هرکدام به طول 100 سانتی‌مورگان شبیه‌سازی شد. مقادیر بهینه π در روش BayesC به‌ترتیب 980/0 و 995/0 در دو توزیع نرمال و گامای اثرات ژنی برآورد شد و در روش SSBR-C نیز مورد استفاده قرار گرفت. صحت پیش‌بینی ژنومی در روش SSBR–C (π=0.995)  نسبت به سایر روش‌ها­ از 02/0 تا 09/0 در توزیع گامای اثرات ژنی بیش­تر برآورد شد. بنابراین، روشSSBR–C (π=0.995) با در نظر گرفتن توزیع مزدوج و استفاده همزمان از همه اطلاعات شجره‌ای، فنوتیپی و ژنومی توانست در حالت توزیع گامای اثرات ژنی عملکرد بهتری را از خود نشان داده و انتخاب مناسب‌تری به­ شمار ‌رود. کلیه روش‌های تک‌‌‌مرحله‌ای و چندمرحله­ای بیزی عملکرد تقریبا مشابهی را در حالت توزیع نرمال اثرات ژنی از خود نشان دادند. فلذا، در حالت توزیع نرمال اثرات ژنی توصیه می‌شود تا از روش SSBR–C (π=0) با توجه به ضریب تابعیت پیش‌بینی ژنومی نزدیک به یک استفاده شود. همچنین، افت صحت‌ پیش‌بینی ژنومی با افزایش فاصله نسلی بین جمعیت مرجع و تایید برای افراد ژنوتیپ شده در مقایسه با افراد ژنوتیپ نشده از حساسیت کمتری برخوردار بود.
متن کامل [PDF 1241 kb]   (18 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: ۱۳۹۸/۴/۱۱ | ویرایش نهایی: ۱۳۹۸/۱۱/۱ | پذیرش: ۱۳۹۸/۶/۲۰ | انتشار: ۱۳۹۸/۱۱/۱

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2020 All Rights Reserved | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb