XML English Abstract Print


گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران
چکیده:   (127 مشاهده)
چکیده مبسوط
مقدمه و هدف:
برخلاف ارزیابی باروری دام ­های نر که براساس رکوردهای فنوتیپی دام ­های ماده مانند نرخ آبستنی انجام می­شود، صفات اسپرم به طور مستقیم در دام­ های نر قابل اندازه­ گیری می­باشند. هدف پژوهش حاضر مطالعه پویش کل ژنوم بر مبنای آنالیز غنی­ سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی مناطق ژنومی مؤثر بر صفات اسپرم گاوهای نر هلشتاین بود.
مواد و روش­ ها:  بدین منظور، از اطلاعات ژنوتیپی 1508 رأس گاو نر و داده­ های فنوتیپی صفات مرتبط با اسپرم شامل حجم انزال، میزان جنبندگی اسپرم، غلظت اسپرم، تعداد اسپرم و تعداد اسپرم متحرک در هر انزال استفاده گردید. ارزیابی پویش کل ژنومی با نرم­ افزار PLINK نسخه 90/1 انجام شد. سپس با استفاده از بسته نرم افزاری biomaRt2 برنامه R ژن­ های معنی­ داری که در داخل و یا 15 کیلوباز بالا و پایین دست نشانگرهای معنی­ دار قرار داشتند، شناسایی گردید. در مرحله بعد تفسیر مجموعه­ های ژنی با استفاده از بسته نرم افزاری goseq برنامه R و برای شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژن­های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا از طریق پایگاه­های برخط GO، DAVID و Panther استفاده گردید.
یافته ­ها: در این پژوهش، تعداد 11 نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع روی کروموزوم ­های 1، 2، 5، 7، 8، 15، 18، 20، 21، 25 و 27 شناسایی شدند که ژن­ های SPEF2، SEPT12، SLC24A، BSP3، ETNK1،ERBB4  (میزان جنبندگی و تعداد اسپرم متحرک در هر انزال)،DSCAML ، MYH3، RPM1­، RPM2، CAPSL  ­(تعداد و غلظت اسپرم)،  DMRT1­و  PPARγ (حجم اسپرم) مرتبط بودند. برخی از این ژن­ ها در مناطق معنی­ دار با مطالعات مشابه پیشین هم خوانی داشت. در آنالیز غنی سازی مجموعه ژنی، تعداد 15 مسیر هستی شناسی ژنی با صفات اسپرم مرتبط بودند. از این بین مسیرهای فرآیند متابولیکی نوکلئوتیدهای پورینی، هوموستازی یون کلسیم داخل سلولی و تنظیم باروری نقش مهمی با میزان جنبندگی و تعداد اسپرم متحرک در هر انزال داشتند. همچنین در ارتباط با حجم و غلظت اسپرم مسیرهای فعال­ کننده­ های تنظیمی یون کلسیم، مسیر سیگنال­دهی PPAR، مسیر سیگنال­دهی هورمون­ های استروئیدی و کانون چسبندگی ارتباط معنی ­داری داشتند.
نتیجه ­­گیری: شناسایی ژن ­های کاندیدای مؤثر بر صفات اسپرم و انتخاب گاوهای نرها با استفاده از روش­ های نوین مبتنی بر انتخاب ژنومی، تأثیر قابل ملاحظه­ ای بر بهبود باروری و سود آوری مراکز اصلاح نژادی و کاهش قیمت­های نهایی تولید برای مصرف کنندگان خواهد داشت.


     
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1400/7/6 | ویرایش نهایی: 1401/3/23 | پذیرش: 1400/8/16 | انتشار: 1401/1/10

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2022 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb