دوره 12، شماره 33 - ( پاییز 1400 1400 )                   جلد 12 شماره 33 صفحات 185-172 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Bazgir Moghadam M, Dashab G R, Maghsoudi A, Rokouei M, Khanegir R. (2021). QTL Mapping of Body Weight Traits on the Chromosome 1 in Japanese Quail. rap. 12(33), 172-185. doi:10.52547/rap.12.33.172
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1219-fa.html
بازگیر مقدم منصوره، داشاب غلامرضا، مقصودی علی، رکوعی محمد، خانه گیر راحله. مکان‌یابی جایگاه‌های ژنی کنترل کننده صفات وزن بدن بر روی کروموزوم یک بلدرچین ژاپنی پژوهشهاي توليدات دامي 1400; 12 (33) :185-172 10.52547/rap.12.33.172

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1219-fa.html


دانشگاه زابل
چکیده:   (1734 مشاهده)
هدف از انجام این پژوهش مکان­یابی جایگاه ­های ژنی کنترل کننده صفات وزن بدن از هچ تا 45 روزگی بر روی کروموزوم یک در بلدچین­ ژاپنی است. بدین منظور از یک جمعیت آمیخته بلدرچین حاصل از یک الگو تلاقی چهار نسلی استفاده گردید. چهار سویه A and M Texas، Wild،Italian Speckled  و  Tuxedoبلدرچین­ ژاپنی دو به دو و رفت و برگشتی تلاقی داده شدند و نسل اول ایجاد گردید. سپس از تلاقی پرندگان دو رگه ، جمعیت نقشه ­یابی شامل نسل­ های دوم، سوم و چهارم ایجاد شدند. نمونه­ های خون جهت استخراج  DNAو تکثیر نشانگرهای ریز­ماهواره­ای بر روی کروموزوم یک از ورید زیر بال در لوله­ های حاوی EDTA 0/5 درصد جمع­ آوری شدند. مشاهدات شامل رکوردهای وزنی از تولد تا ۴۵ روزگی با فاصله ۵ روز بودند. اثرات نشانگرها و مؤلفه­ های واریانس با سه مدل افزایشی، غالبیت و افزایشی-غالبیت با رویه AI-REML نرم­­­ افزار GVCBLUP انجام گرفت. بر اساس میزان  برآورد آثار نشانگری، نقطه ­ای که بالاترین مقدار آماره F را دارا بود به عنوان مکان QTL گزارش شد. نتایج تجزیه QTL در مدل افزایشی برای صفات وزن هچ، 5 و 30 روزگی بیانگر وجود QTL­­های مؤثر بر صفات وزن بدن در انتها، QTLهای صفات وزنی 10، 15، 20، 25، 40 و 45 روزگی در میانه و برای صفت   وزن در 35 روزگی در ابتدای کروموزوم یک بودند. در مدل غالبیت QTL­های مؤثر بر صفات وزن بدن شامل زمان هچ، 5، 10، 15، 35، 40 و 45 در میانه و برای صفات وزن 20، 25 و 30 در انتهای کروموزوم یک شناسایی شدند. درصد واریانس ژنتیکی افزایشی و غالبیت به واسطه نشانگرها در مدل­ های مختلف به ترتیب در دامنه 0/17 تا 9/4 درصد و 3/3 تا 23/3 درصد تغییرات کل بودند. بنابراین، نتایج این تحقیق وجود حداقل دو جایگاه ژنی متمایز با آثار افزایشی و غالبیت مؤثر بر صفات وزن بدن بر روی کروموزوم یک در بلدرچین ژاپنی را تأیید می­ نماید.
متن کامل [PDF 4774 kb]   (454 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد طیور
دریافت: 1400/4/26 | ویرایش نهایی: 1401/11/16 | پذیرش: 1400/5/19 | انتشار: 1400/7/10

فهرست منابع
1. Atzmon, G., Y.I. Ronin, A. Korol, N. Yonash, H. Cheng and J. Hillel. 2006. QTLs associated with growth traits and abdominal fat weight and their interactions with gender and hatch in commercial meat‐type chickens. Animal Genetics, 37(4): 352-358. ‌ [DOI:10.1111/j.1365-2052.2006.01487.x]
2. Baron, E.E., A.S.A.M.T. Moura, M.C. Ledur, L.F.B. Pinto, C. Boschiero, D.C. Ruy and L.L. Coutinho. 2011. QTL for percentage of carcass and carcass parts in a broiler x layer cross. Animal Genetics, 42(2): 117-124. ‌ [DOI:10.1111/j.1365-2052.2010.02105.x]
3. Bolormaa, S., J.E. Pryce, Y. Zhang, A. Reverter, W. Barendse, B.J. Hayes and M.E. Goddard. 2015. Non-additive genetic variation in growth, carcass and fertility traits of beef cattle. Genetics Selection Evolution, 47(1): 26. [DOI:10.1186/s12711-015-0114-8]
4. Borevitz, J.O., J.N. Maloof, J. Lutes, T. Dabi and J.L. Redfern. 2002. Quantitative trait loci controlling light and hormone response in two accessions of Arabidopsis thaliana. Genetics, 160: 683-696. [DOI:10.1093/genetics/160.2.683]
5. Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetic, 32: 314-331.
6. Boysen, T.J., C. Heuer, J. Tetens, F. Reinhardt and G. Thaller. 2013. Novel use of derived genotype probabilities to discover significant dominance effects for milk production traits in dairy cattle. Genetics, 193(2): 431-442. [DOI:10.1534/genetics.112.144535]
7. Buchanan, F.C. and T.D. Thue. 1998. Intra-breed polymorphic information content of microsatellites in cattle and sheep. Canadian Journal of Animal Science, 78: 425-428. [DOI:10.4141/A98-002]
8. Christensen, O.F., P. Madsen, B. Nielsen, T. Ostersen and G. Su. 2012. Single-step methods for genomic evaluation in pigs. Animal, 6: 1565-1571. [DOI:10.1017/S1751731112000742]
9. Doerge, R.W. 2002. Mapping and analysis of quantitative trait loci in experimental populations. Nature Revolution Genetic, 3: 43-52 [DOI:10.1038/nrg703]
10. Esmailizadeh, A.K., A. Baghizadeh and M. Ahmadizadeh. 2012. Genetic mapping of quantitative trait loci affecting bodyweight on chromosome 1 in a commercial strain of Japanese quail. Animal Production Science, 52(1): 64-68. [DOI:10.1071/AN11220]
11. Flint, J. and R. Mott. 2001. Finding the molecular basis of quantitative traits: successes and pitfalls. Nature Reviews Genetics, 2: 437-445. [DOI:10.1038/35076585]
12. Iranmanesh, M., A. Esmailizadeh and M.R. Mohammadabadi. 2018. Mapping Quantitative trait affecting live weight on chromosome 5 in Japanese quail. Animal Production Research, 9(22): 111-118 (In Persian). [DOI:10.29252/rap.9.22.111]
13. Iranmanesh, M., A. Esmailizadeh, M.R. Mohammadabadi and S. Sohrabi. 2017. Identification of quantitative trait loci affecting average daily gain and Kleiber ratio on chromosome 5 in an F2 population of Japanese quail. Animal Production Research, 5(4): 12-22 (In Persian).
14. Jabbari, R., A.K. Esmailizadeh, H. Charati, M.R. Mohammadabadi and S.S. Sohrabi. 2014. Identification of QTL for live weight and growth rate using DNA markers on chromosome 3 in an F2 population of Japanese quail. Molecular Biology Reports, 41: 1049-1057. [DOI:10.1007/s11033-013-2950-3]
15. Jennen, D.G., A.L. Vereijken, H. Bovenhuis, R.M. Crooijmans, J.J. van Der Poel and M.A. Groenen. 2005. Confirmation of quantitative trait loci affecting fatness in chickens. Genetics Selection Evolution, 37(3): 215. ‌ [DOI:10.1186/1297-9686-37-3-215]
16. Kayang, B.B., A. Vignal, M. Inoue‐Murayama, M. Miwa, J.L. Monvoisin, S. Ito and F. Minvielle. 2004. A first-generation microsatellite linkage map of the Japanese quail. Animal Genetics, 35(3): 195-200. ‌ [DOI:10.1111/j.1365-2052.2004.01135.x]
17. Lie, Z., L. Cheng, D. Fang-Yin and F. Shou-min. 2010. Mapping of major quantitative trait loci for economic traits of silkworm cocoon. Genetics and Molecular Research, 9(1): 78-88. ‌ [DOI:10.4238/vol9-1gmr676]
18. Liu, K. and S.V. Muse. 2005. PowerMarker: An integrated analysis environment for genetic marker analysis. Bioinformatics, 21: 2128-2129. [DOI:10.1093/bioinformatics/bti282]
19. Lu, D., E.C. Akanno, J.J. Crowley, F. Schenkel, H. Li, M. De Pauw and G. Plastow. 2016. Accuracy of genomic predictions for feed efficiency traits of beef cattle using 50K and imputed HD genotypes. Journal of Animal Science, 94(4): 1342-1353. [DOI:10.2527/jas.2015-0126]
20. Lynch, M. and B.Walsh. 1998. Genetics and analysis of quantitative traits. Sinauer Assocs., Inc., Sunderland, MA.
21. McElroy, J.P., J.J. Kim, D.E. Harry, J.C.M. Dekkers and S.J. Lamont. 2006. Identification of trait loci affecting white meat percentage and other growth and carcass traits in commercial broiler chickens. Poultry Science, 85(4): 593-605. ‌ [DOI:10.1093/ps/85.4.593]
22. Minvielle, F., B.B. Kayang, M. Inoue-Murayama, M. Miwa, A. Vignal, D. Gourichon, and S.I. Ito. 2005. Microsatellite mapping of QTL affecting growth, feed consumption, egg production, tonic immobility and body temperature of Japanese quail. BMC Genomics, 6(1): 87. ‌ [DOI:10.1186/1471-2164-6-87]
23. Moores, S.L., M.D. Schaber, S.D. Mosser, E. Rands, M.B. O'Hara, V.M. Garsky and J. Gibbs. 1991. Sequence dependence of protein isoprenylation. Journal of Biological Chemistry, 266(22): 14603-14610. [DOI:10.1016/S0021-9258(18)98729-6]
24. Moradian, H., A. Esmailizadeh, S. Sohrabi and M. Mohammadabadi. 2014. Identification of quantitative trait loci associated with weight and percentage of internal organs on chromosome 1 in Japanese quail. Journal of Agricultural Biotechnology, 6(4): 143-158 (In Persian).
25. Moradian, H., A. Esmailizadeh and Mohammadabadi. 2012. Microsatellite mapping of quantitative trait loci associated with carcass traits on chromosome 1 in Japanese quail. Journal of Animal Productions, 15(2): 89-99 (In Persian).
26. Nadaf, J., F. Pitel, H. Gilbert, M.J. Duclos, F. Vignoles, C. Beaumont and J. Simon. 2009. QTL for several metabolic traits map to loci controlling growth and body composition in an F2 intercross between high-and low-growth chicken lines. Physiological Genomics, 38(3): 241-249. [DOI:10.1152/physiolgenomics.90384.2008]
27. Nassar, F.S., R.E.A. Moghaieb, A.M. Abdou and F.K.E. Stino. 2012. Microsatellite markers associated with body and carcass weights in broiler breeders. African Journal of Biotechnology, 11 (15): 3514-3521. [DOI:10.5897/AJB11.3721]
28. Navani, N., P.K. Jain, S. Gupta, B.S. Sisodia and S. Kumar. 2002. A set of cattle microsatellite DNA markers for genome analysis of riverine buffalo (Bubalus bubalis). Animal Genetics, 33(2): 149-154. [DOI:10.1046/j.1365-2052.2002.00823.x]
29. Sadeghi, M., H. Mohammadi, M. Moradi Shahrbabak and H. Moradi Shahrbabak, 2011. Comparison of the efficiency of the buffer-detergent extraction and standard salting-out methods for DNA extraction from blood and semen samples. Genetics in the 3RD Millennium, 8(4): 2155-2161 (In Persian).
30. Sohrabi, S., A. Esmailizadeh, M. Mohammadabadi, H. Moradian and E. Nasirifar. 2017. Mapping quantitative trait loci affecting skeletal asymmetry in Japanese quail (Coturnix japonica). Journal of Agricultural Biotechnology, 8(4): 69-84 (In Persian).
31. Sohrabi, S., A. Esmailizaseh, M.R. Mohammadabadi and H. Moradian. 2014. Mapping quantitative trait loci underlying Kleiber ratio and identification of their mode of action in an F2 population of Japanese quail (Coturnix coturnix japonica). Journal of Agricultural Biotechnology, 6(1): 111-121 (In Persian).
32. Sohrabi, S.S., A.K. Esmailizadeh, A. Baghizadeh, H. Moradian, M.R. Mohammadabadi, N. Askari and E. Nasirifar. 2012. Quantitative trait loci underlying hatching weight and growth traits in an F2 intercross between two strains of Japanese quail. Animal Production Science, 52(1): 1012-1018 (In Persian). [DOI:10.1071/AN12100]
33. Tautz, D. 1989. Hyper-variability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers. Nucleic acids Research, 17 (16): 6463-6471. ‌ [DOI:10.1093/nar/17.16.6463]
34. Wang, S., D. Dvorkin and Y. Da. 2012. SNPEVG: a graphical tool for GWAS graphing with mouse clicks. BMC bioinformatics, 13(1): 319. [DOI:10.1186/1471-2105-13-319]
35. Weller, J.I. 2001. Quantitative Trait Loci Analysis in Animals. CABI Publication, London, UK. [DOI:10.1079/9780851994024.0000]
36. Yeh, F.C., R. Yang and T. Boyle 1999. POPEGENE. Version 1.31. Microsoft Window-based Freeware for Population Genetic Analysis, University of Alberta. Edmonton.
37. Zane, L., L. Bargelloni and T. Patarnello. 2002. Strategies for microsatellite isolation: a review. Molecular ecology, 11(1): 1-16. [DOI:10.1046/j.0962-1083.2001.01418.x]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production

Designed & Developed by : Yektaweb