XML English Abstract Print


دانشگاه جیرفت
چکیده:   (120 مشاهده)
تولید شیر یکی از مهم ترین صفات اقتصادی در صنعت پرورش گاو شیری است که توسط تعداد زیادی ژن کنترل می شود و تابعی از فعالیت سلول­های اپیتلیال می­باشد که تحت تأثیر چندین مسیر بیولوژیکی و اثر متقابل ژن­های مختلف و بیان ژن­ها می باشند. بیان ژن فرایندی است که در آن از اطلاعات درون ژن استفاده می­شود تا یک محصول کاربردی از آن به دست آید، همچنین یکی از مسائل بنیادی است که کمک می­کند تا ژنوتیپ به صورت فنوتیپ ظاهر شود. هدف از این مطالعه شناسایی ژن­های مؤثر بر تولید شیر و رسم شبکه ژنی ژن­های مورد مطالعه جهت شناسایی ژن­های عمده اثر برای فهم بهتر مکانیسم تولید شیر با استفاده از بررسی الگوی بیان ژن طی بررسی­های بیوانفورماتیکی می­باشد. در این مطالعه به منظور شناسایی ژن­ها با بیان متفاوت در بافت پستان گاو شیری، داده­های بیان ژن مربوط به بافت پستانی با شماره دسترسی  GSE33680 از بخش GEO بانک اطلاعاتی NCBI استخراج گردید. بررسی کیفیت داده­ها با استفاده از بسته Limma موجود در نرم­افزار R و با استفاده از روش تحلیل مؤلفه­های اساسی انجام شد. به منظور بررسی عملکرد ژن­ها با بیان متفاوت از نرم­افزار DAVID استفاده شد. پس از شناسایی ژن­های هدف به پایگاه داده­ای STRING ارائه شدند، جهت تبین نقش ژن­ها از نرم­افزار Cytoscape استفاده شد. در این مطالعه نتایج تجزیه تفاوت بیان ژن­ها منجر به شناسایی 14020 ژن شد که بر اساس آماره Fold change  و  adj p-Value تعداد 409 ژن افزایش بیان و 326 ژن کاهش بیان داشتند. از جمله مسیرهای بیولوژیکی شناخته شده مؤثر بر تولید شیر NF-KB signaling, Glycerolipid metabolism ،EGFR1, IL6, B cell receptor,  می­باشند. مهم­ترین ژن­ها براساس درجه ارتباط با ژن­های دیگر و مرکزیت درونی و بیرونی ژن­های MYC، KRAS، HSPA8،ATP5B ، SRC، JAK1  و  FOXA2می­باشند که نقش آن­ها در تنظیم تولید شیر در گزاراشات متعددی به اثبات رسیده است.
     
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1399/11/7 | ویرایش نهایی: 1400/4/5 | پذیرش: 1400/2/12

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb