دوره 12، شماره 32 - ( تابستان 1400 )                   جلد 12 شماره 32 صفحات 160-166 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Eskandarynasab S, Roudbari Z, Mohammadabadi M. Transcriptome Analysis of Mammary Gland Tissue to Identify Major Genes Involved in the Milk Production. rap. 2021; 12 (32) :160-166
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1177-fa.html
اسکندری نسب سعیده، رودباری زهرا، محمدآبادی محمدرضا. واکاوی ترانسکریپتوم بافت پستانی جهت شناسایی ژن های عمده اثر در فرآیند تولید شیر. پژوهشهاي توليدات دامي. 1400; 12 (32) :160-166

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1177-fa.html


گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران
چکیده:   (303 مشاهده)
تولید شیر یکی از مهم ترین صفات اقتصادی در صنعت پرورش گاو شیری است که توسط تعداد زیادی ژن کنترل می­ شود و تابعی از فعالیت سلول­های اپیتلیال می­ باشد که تحت تأثیر چندین مسیر بیولوژیکی و اثر متقابل ژن­های مختلف و بیان ژن­ها می­ باشند. بیان ژن فرایندی است که در آن از اطلاعات درون ژن استفاده می ­شود تا یک محصول کاربردی از آن به دست آید، همچنین یکی از مسائل بنیادی است که کمک می­ کند تا ژنوتیپ به صورت فنوتیپ ظاهر شود. هدف از این مطالعه شناسایی ژن­های مؤثر بر تولید شیر و رسم شبکه ژنی ژن­های مورد مطالعه جهت شناسایی ژن­های عمده اثر برای فهم بهتر مکانیسم تولید شیر با استفاده از بررسی الگوی بیان ژن طی بررسی ­های بیوانفورماتیکی می­ باشد. در این مطالعه به منظور شناسایی ژن­ها با بیان متفاوت در بافت پستان گاو شیری، داده ­های بیان ژن مربوط به بافت پستانی با شماره دسترسی  GSE33680 از بخش GEO بانک اطلاعاتی NCBI استخراج گردید. بررسی کیفیت داده­ ها با استفاده از بسته Limma موجود در نرم ­افزار R و با استفاده از روش تحلیل مؤلفه­ های اساسی انجام شد. به منظور بررسی عملکرد ژن­ها با بیان متفاوت از نرم ­افزار DAVID استفاده شد. پس از شناسایی ژن­های هدف به پایگاه داده­ای STRING ارائه شدند، جهت تبین نقش ژن­ها از نرم ­افزار Cytoscape استفاده شد. در این مطالعه نتایج تجزیه تفاوت بیان ژن­ها منجر به شناسایی 14020 ژن شد که بر اساس آماره Fold change  و  adj p-Value تعداد 409 ژن افزایش بیان و 326 ژن کاهش بیان داشتند. از جمله مسیرهای بیولوژیکی شناخته شده مؤثر بر تولید شیر NF-KB signaling, Glycerolipid metabolism ،EGFR1, IL6, B cell receptor,  می­ باشند. مهم­ ترین ژن­ها براساس درجه ارتباط با ژن­های دیگر و مرکزیت درونی و بیرونی ژن­های MYC، KRAS، HSPA8،ATP5B ، SRC، JAK1  و  FOXA2می­باشند که نقش آن­ها در تنظیم تولید شیر در گزاراشات متعددی به اثبات رسیده است.
متن کامل [PDF 708 kb]   (55 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1399/11/7 | ویرایش نهایی: 1400/6/9 | پذیرش: 1400/2/12 | انتشار: 1400/6/9

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb