XML English Abstract Print


دانشگاه کشاورزی ومنابع طبیعی ساری
چکیده:   (3395 مشاهده)
فرا تحلیل عبارت است از به‌ کارگیری روش‌های آماری خاص برای ترکیب و خلاصه نمودن نتایج  مطالعات  مستقل ولی مرتبط، برای یافتن دقیق ‌ترین شکل ارتباط بین متغیرهای مورد بررسی. هدف این مطالعه، شناسایی QTL ها و ژن های مرتبط با صفات عملکردی در گوسفندان جهان  با استفاده از روش های نوین و بر پایه فراتحلیل و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی مناطق ژنومی است. بدین منظور فایل های­ تعیین ژنوتیپ با استفاده از تراشه­های ژنومی مربوطه به 1591 رأس گوسفند از نژادهای مختلف جهان که در پایگاه­ های مختلف داده­های ژنومی (Dryad ،Frontiresin ،Zenodo ، Animal Genome ، Hapmap) ذخیره شده بودند، استفاده گردید. ابتدا جهت تعیین اختلاط جمعیتی بین نژاد های مختلف از مناطق با شرایط آب و هوایی متنوع آنالیز ساختار جمعیتی انجام گردید. برای شناسایی نشانه­های انتخاب از آزمون های Fst، hapflk، iHs ، Rsb ، XpEHH و در نهایت فرا تحلیل روش های فوق استفاده گردید. جمعیت با آنالیزPCA در سه گروه جدا از یکدیگر شامل  AIT: نژاد های آسیایی، ترکیه­ای و آفریقایی،  AUNZ: نژاد های استرالیایی و نیوزیلند و EU : نژاد های اروپایی قرارگرفتند. براساس آزمون فرا تحلیل 10 منطقه ژنگانی روی کروموزوم­ های 22، 20، 12، 9، 7، 6، 5، 4، 3، 2  شناسایی شدند. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی نشان داد که برخی از این مناطق ژنگانی به طور مستقیم و غیر مستقیم با ژن­ های مؤثر  بر سازگاری  با شرایط محیطی(ADAMTS9)، تولید مثلی(GNAQ)، تنظیم ملانوسیت ها(KITLG)، تولید ایمونوگلوبولین(BATF ،TNFSF13 ،AICDA ،MZB1)، تمایز سلولی(TNFSF13 ،TGFB1)، فرآیند ایمنی(AGBL5 ،ATG7 ، PRDX1،CCL26 ،IL17RC ،TNFSF12 ،TGFB2 ،PTGS1)، پاسخ سلولی به تحریکات بیرونی( PRKAA1، NFKB1،MAP3K2)، تولید اینترفرون آلفا(DDX58)، فرآیند پاسخ دفاعی(CCL24 ،FAM13B ،LDLR ، CLDN7)، هموستاز سلولی(BAMBI ،DVL2تنظیم پروتئین کیناز فعال شده با میتوژن(PLCE1) و تنظیم پاسخ به استرس (FXR2 ،HSPH1) همپوشانی دارند. تجزیه و تحلیل تطبیقی فرا تحلیل نشانه های انتخاب بر اساس پایگاه داده های بیوانفورماتیکی می تواند مناطق ژنومی مورد انتخاب را برای صفات با اهمیت اقتصادی و بیولوژیکی در گوسفند را شناسایی کند.
     
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1399/9/25 | ویرایش نهایی: 1400/4/5 | پذیرش: 1399/12/2

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb