دوره 12، شماره 32 - ( تابستان 1400 )                   جلد 12 شماره 32 صفحات 140-149 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Shakeri R, Javanmard A, Hasanpur K, Abbasi M, Mazlom S M, Khansefid M et al . Assessment of Genetic Diversity Within Holstein Population using Bovine SNP Chip Data. rap. 2021; 12 (32) :140-149
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1162-fa.html
شاکری رئوف، جوانمرد آرش، حسن پور کریم، عباسی مختار علی، مظلوم سید مصطفی، خان سفید مجید و همکاران.. بررسی شاخص‌های تنوع ژنتیکی در یک جمعیت از گاو هلشتاین با استفاده از نشانگرهای متراکم اسنیپ. پژوهشهاي توليدات دامي. 1400; 12 (32) :140-149

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1162-fa.html


گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز
چکیده:   (551 مشاهده)
کاهش میزان تنوع ژنتیکی و به­ تبع آن افزایش تجمعی میزان هم­خونی از جمله عوامل تهدید کننده صنعت پرورش گاو شیری محسوب می­ شوند. هدف از پژوهش حاضر، ارزیابی شاخص­ های تنوع ژنتیکی (توزیع عدم تعادل لینکاژی، آماره هتروزیگوتی مشاهده ­شده و مورد انتظار، آماره Fis، توزیع فراوانی آلل های نادر، میزان اتوزیگوتی و تجزیه به مؤلفه­ های اصلی) در گاو هلشتاین با استفاده از نشانگرهای متراکم اسنیپ بود. داده­ های ژنوتیپی متعلق به 25 گاو ماده هلشتاین حاصل از تراشه اسنیپ گاوی 50 هزارتایی، اهدایی از شرکت تجاری آلتادلتا ژنتیک تجزیه و تحلیل شد. محاسبات آماری شاخص­ های مولکولی مذکور از طریق نرم­ افزار معروف پلینک، نسخه 1/9تحت محیط R صورت گرفت. میانگین فراوانی آلل نادر (0/28)، میانگین فراوانی هتروزیگوتی مشاهده ­شده و هتروزیگوتی مورد انتظار به ­ترتیب (0/38، 0/37)، آماره شاخص تثبیت (Fis) (منفی0/032)، آماره Fhom(0/0328-) اندازه ­گیری شد. همچنین، نتایج تجزیه به مؤلفه­ های اصلی، تنوع و پراکنش معنی­ دار بالایی را نشان داد که تأییدی بر مطابقت و هم­خوانی همه آماره­ های مولکولی اندازه­ گیری شده و بالا بودن میزان تنوع ژنتیکی اندازه­ گیری شده بود. از آنجایی که، شاخص ROH، از اطلاعات توالی نوکلئوتیدی یکسان انتقال یافته به دو فرد حاصل می ­شود لذا، در مقایسه با شاخص Fis، معیار آماری مناسب­تری برای مطالعه میزان هم­خونی، می­ باشد. نتیجه­ گیری نهایی این که، بکارگیری نشانگرهای متراکم اسنپ می تواند، ابزاری مناسب برای ارزیابی وضعیت تنوع ژنتیکی و هم­خونی جمعیت­ های دامی محسوب شود.
متن کامل [PDF 1317 kb]   (47 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1399/9/21 | ویرایش نهایی: 1400/6/9 | پذیرش: 1399/12/2 | انتشار: 1400/6/9

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb