دوره 11، شماره 29 - ( پاییز 1399 )
جلد 11 شماره 29 صفحات 142-135 |
برگشت به فهرست نسخه ها
گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چکیده: (2167 مشاهده)
هدف از پژوهش حاضر شناسایی جهش فقدان عملکرد p.R12X مؤثر بر مشکلات تولید مثلی و سقط جنین در ژن SLC37A2 با روش های PCR-SSCP و توالی یابی در گاوهای هلشتاین و مونبلیارد بوده است. تعداد 250 نمونه خون (150 نمونه هلشتاین و 100 نمونه مونبلیارد) تهیه و استخراج DNA با کیت انجام شد. یک جفت آغازگر اختصاصی با نرم افزارOligo7 طراحی شد که قطعهای با طول 208 جفت باز از اگزون 2 ژن SLC37A2 حاوی جهش p.R12X را تکثیر نماید. تعیین ژنوتیپ نمونه ها با روش SSCP انجام و فراوانیهای ژنی و ژنوتیپی و شاخصه های ژنتیک جمعیت با نرم افزارPOPGEN محاسبه شدند. در جایگاه SLC37A2 دو ژنوتیپ AA و AB به ترتیب با فراوانی های 7/98 و 3/1 و 86 و 14 درصد به ترتیب در دو نژاد هلشتاین و مونبلیارد مشاهده شدند. همچنین فراوانی های آللی ژن SLC37A2 در دو جمعیت هلشتاین و مونبلیارد برای آلل های A و B به ترتیب برابر با 3/99 و 7/0 و 93/0 و 7/0 برآورد شدند. تست دقیق فیشر و تست کای-اسکوئر نشان داد که اختلاف آماری معنی داری از نظر فراوانی های آللی و ژنوتیپی بین دو جمعیت هلشتاین و مونبلیارد وجود دارد (05/0p <). پس از تعیین ژنوتیپ، از هر ژنوتیپ دو نمونه به طور دو طرفه توالی یابی شدند و بررسی های بیوانفورماتیکی توالی های حاصل با نرم افزار BioEdit انجام شد. نتایج نشان داد که در ژنوتیپ AB ژن SLC37A2 در گاوهای هلشتاین و مونبلیارد جهش فقدان عملکرد (p.R12X) وجود دارد. با توجه به نقش جهش p.R12X در نقایص تولید مثلی و سقط جنین در گاو مونبلیارد میتوان از نتایج این پژوهش مستقیما در برنامه های اصلاح نژادی جهت شناسایی دام های حامل و حذف آنها در گله های تجاری و روستایی استفاده نمود.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1398/10/28 | ویرایش نهایی: 1399/8/18 | پذیرش: 1398/12/10 | انتشار: 1399/7/14
دریافت: 1398/10/28 | ویرایش نهایی: 1399/8/18 | پذیرش: 1398/12/10 | انتشار: 1399/7/14
فهرست منابع
1. Behmaram, R., P. Akbari, M.D. Shakouri and M. Kazemi. 2018. The Effect of calving season on some of productive and reproductive traits in Tehran province's Holstein cows. Research on Animal Production, 9(19): 76-82 (In Persian). [DOI:10.29252/rap.9.19.76]
2. De Vries, A., C. Steenholdt and Risco. 2005. Pregnancy rates and milk production in natural service and artificially inseminated dairy herds in Florida and Georgia. Journal of dairy science, 88(3): 948-956. [DOI:10.3168/jds.S0022-0302(05)72762-4]
3. Fritz, S., A. Capitan, A. Djari, S.C. Rodriguez, A. Barbat, A. Baur and C. Klopp. 2013. Detection of haplotypes associated with prenatal death in dairy cattle and identification of deleterious mutations in GART, SHBG and SLC37A2. PloS one, 8(6): e65550. [DOI:10.1371/journal.pone.0065550]
4. Hansen, L.B. 2000. Consequences of selection for milk yield from a geneticist's viewpoint. Journal of dairy science, 83(5): 1145-1150. [DOI:10.3168/jds.S0022-0302(00)74980-0]
5. He, L., K. Vasiliou and D.W. Nebert. 2009. Analysis and update of the human solute carrier (SLC) gene superfamily. Human genomics, 3(2): 195. [DOI:10.1186/1479-7364-3-2-195]
6. Hoseinpour Kol-Mahaleh, M., A. Farhadi, G. Rahimi Mianji and M. Gholizadeh. 2019. Molecular and bioinformatics analysis of regulatory upstream region of leptin and SIGLEC5 genes in association with production and reproduction traits in Holstein cattle. Animal ProductionResearch, 8(3): 73-85 (In Persian).
7. Ishida, N. and M. Kawakita. 2004. Molecular physiology and pathology of the nucleotide sugar transporter family (SLC35). Pflügers Archiv, 447(5): 768-775. [DOI:10.1007/s00424-003-1093-0]
8. Kanae, Y., D. Endoh, H. Nagahata and M. Hayashi. 2005. A method for detecting complex vertebral malformation in Holstein calves using polymerase chain reaction-primer introduced restriction analysis. Journal of veterinary diagnostic investigation, 17(3): 258-262. [DOI:10.1177/104063870501700309]
9. Lucy, M.C. 2001. Reproductive loss in high-producing dairy cattle: where will it end? Journal of dairy science, 84(6): 1277-1293. [DOI:10.3168/jds.S0022-0302(01)70158-0]
10. Nagahata, H., H. Oota, A. Nitanai, S. Oikawa, H. Higuchi, T. Nakade and H. Ogawa. 2002. Complex vertebral malformation in a stillborn Holstein calf in Japan. Journal of veterinary medical science, 64(12): 1107-1112. [DOI:10.1292/jvms.64.1107]
11. Pan, C.J., S.Y. Chen, H.S. Jun, S.R. Lin, B.C. Mansfield and J.Y. Chou. 2011. SLC37A1 and SLC37A2 are phosphate-linked, glucose-6-phosphate antiporters. PloS one, 6(9): e23157. [DOI:10.1371/journal.pone.0023157]
12. Plaizier, J.C.B., K.D. Lissemore, D. Kelton and G.J. King. 1998. Evaluation of overall reproductive performance of dairy herds. Journal of dairy science, 81(7): 1848-1854. [DOI:10.3168/jds.S0022-0302(98)75755-8]
13. Reinartz, S and O. Distl. 2016. Validation of deleterious mutations in Vorderwald cattle. PloS one, 11(7): e0160013. [DOI:10.1371/journal.pone.0160013]
14. Sewalem, A., G.J. Kistemaker and F. Miglior. 2010. Relationship between female fertility and production traits in Canadian Holsteins. Journal of dairy science, 93(9): 4427-4434. [DOI:10.3168/jds.2009-2915]
15. Thomsen, B., P. Horn, F. Panitz, E. Bendixen, A.H. Petersen, L.E. Holm and C. Bendixen. 2006. A missense mutation in the bovine SLC35A3 gene, encoding a UDP-N-acetylglucosamine transporter, causes complex vertebral malformation. Genome research, 16(1): 97-105. [DOI:10.1101/gr.3690506]
16. VanRaden, P.M., A.H. Sanders, M.E. Tooker, R.H. Miller, H.D. Norman, M.T. Kuhn and G. Wiggans. 2004. Development of a national genetic evaluation for cow fertility. Journal of dairy science, 87(7): 2285- 2292. [DOI:10.3168/jds.S0022-0302(04)70049-1]
17. Wall, E., S. Brotherstone, J.A. Woolliams, G. Banosa and M.P. Coffey. 2003. Genetic evaluation of fertility using direct and correlated traits. Journal of Dairy Science, 86(12): 4093-4102. [DOI:10.3168/jds.S0022-0302(03)74023-5]
18. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/506687.
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |