fa آنالیز بیان افتراقی ژن ها در پاسخ به عصاره لیپوپلی ساکاریدی ازباکتری اشیرشیاکولای در سلول های اپی تلیال اندومتریوم گاوی تخصصي Special پژوهشي Research <strong><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">لیپو&shy;پلی&shy;ساکارید1</span>(</span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">LPS</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">)، بخشی از ساختار غشای بیرونی باکتری&shy;های گرم منفی است که در فرآیند&shy;های پاتوژنی که منجر به ورم پستان و التهاب رحم در گاوهای شیری می&shy;شود، دخالت دارد. هم</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">چنین </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">LPS</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> باعث التهاب اندومتریوم و شکست لانه</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">گزینی در بسیاری از گونه</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">های حیوانی می&shy;شود. باتوجه به اهمیت اقتصادی این بیماری&shy;ها در صنعت گاو شیری، آنالیز بیان افتراقی ژن&shy;ها و شناسایی مسیرهای مرتبط در پاسخ به عصاره لیپوپلی</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">ساکاریدی از باکتری اشیرشیا&shy;کولای با استفاده از &nbsp;آنالیز ترانسکریپتوم برای فهم مکانیسم دقیق این فرآیند بسیار حیاتی و ضروری است. در این پژوهش، بعد از مراحل جداسازی و تیمار سلول&shy;های اپی&shy;تلیال اندومتریوم گاو با دوزهای مختلفی از</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">LPS </span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;(صفر، 2 و 8 میلی&shy;گرم بر میلی&shy;لیتر) در محیط کشت، </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">RNA</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> کل استخراج و برای تهیه کتابخانه ترانسکریپتومی مورد استفاده قرار گرفت. در مجموع 12 کتابخانه ترانسکریپتومی از سه گاو قرمز سوئدی (4 نمونه به ازای هر راس گاو) توسط تکنولوژی با توان عملیاتی بالا تعیین توالی و آنالیز بیان افتراقی ژن&shy;ها و هم&shy;چنین مسیرهای بیولوژیکی مرتبط مورد شناسایی قرار گرفتند. نتایج این پژوهش نشان داد در مجموع 2035 ژن در بین گروه&shy;های شاهد و تیمار شده با </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">LPS</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> دارای بیان متفاوت بوده که تعداد 752 ژن در مسیر تکثیر و مرگ سلولی نقش داشتند. هم&shy;چنین نتایج شمارش سلول&shy;های<br> اپی&shy;تلیال نشان داد که عصاره لیپوپلی&shy;ساکاریدی توانست به&shy;طور معنی&shy;داری باعث افزایش تکثیر سلولی شود. آنالیز مسیرهای بیولوژیکی نشان داد که این ژن&shy;ها در تعدادی از مسیرهای سیگنالی &nbsp;از جمله سیستم ایمنی &nbsp;شامل مسیر سیگنالی </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">Toll-Like Receptor</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">T Cell Receptor</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">MAPK</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، شیموکین&shy;ها، سرطان اندومتریوم رحمی و هم&shy;چنین مسیر سیگنالی مرگ و تکثیر سلولی دخالت دارند. طبق اطلاعات ما این مطالعه، نخستین تحقیقی است که روی سلول&shy;های اپی&shy;تلیال اندومتریوم گاوی انجام شده است که می&shy;تواند درک ما را در ارتباط با مکانیسم&shy;های مرتبط به التهاب&shy;های ناشی از عفونت&shy;های رحمی در گاو شیری افزایش دهد.</span></span></span></strong> Lipopolysaccharide is a component of outer membrane of gram-negative bacteria involved in the pathogenic process leading to mastitis and metritis in dairy cattle. Additionally, LPS could be caused endometrium inflammation and implantation failure in many animal species. Based on economic importance of these diseases in dairy cattle industry, analysis of differential gene expression (DGE) and also detection of related pathways in LPS challenge using transcriptome analysis is essential in understanding the mechanism of process. In the present study, after separation of endometrial epithelial cells, and expose them with different doses of LPS (0, 2 and 8 mg/ml), total RNA was extracted and was used for transcriptome libraries preparation. In general, 12 samples (four samples per cow) were sequenced by high throughput technology from three Swedish Red breed cows. The DGE and also biological pathways were identified. The results of present study showed that 2035 genes differentially were expressed between control and treated groups which 752 genes involved in cell proliferation and apoptosis pathway. Additionally, the results of counted epithelial cells have shown that LPS could be significantly increased cell proliferation. Biological pathway analysis showed that some signaling pathways related to immune system such as Toll-like receptor, T cell receptor, MAPK signaling pathway, chemokine signaling pathways, endometrial cancer pathway and also apoptosis and cell proliferation signaling pathways involved in this challenge. According to our knowledge, this study is the first research that has been done in bovine endometrial epithelial cells which can increase our understanding related to the mechanisms of inflammations caused by uterine infections in dairy cattle. آنالیز ترانسکریپتوم, تکثیر سلولی سلول های اپی تلیال اندومتریوم, لیپوپلی ساکارید, مسیرهای بیولوژیکی Biological Pathways, Endometrial, Epithelial Cells, Cell Proliferation, Lipopolysaccharide, Transcriptome Analysis 121 130 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-282&slc_lang=fa&sid=1 Mojtaba Najafi مجتبی نجفی 10031947532846007800 10031947532846007800 Yes Ghodrat Rahimi-Mianji قدرت رحیمی میانجی 10031947532846007801 10031947532846007801 No Yongzhi Guo یونچه گئو 10031947532846007802 10031947532846007802 No Naveed Jhamat نوید جمات 10031947532846007803 10031947532846007803 No Goran Andersson یوران اندرسون 10031947532846007804 10031947532846007804 No Patrice Humblot پاتریس هومبلت 10031947532846007805 10031947532846007805 No Erik Bangcom-Rudllof اریک بنککام 10031947532846007806 10031947532846007806 No