Research on Animal Production

fa اثر خطای شجره بر وراثت پذیری و صحت پیش بینی ارزش اصلاحی در صفات آستانه ای The Effect of Pedigree Error on Heritability and Accuracy of Prediction of Breeding Value in Threshold Traits ژنتیک و اصلاح نژاد دام ژنتیک و اصلاح نژاد دام پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div>  <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;">چکیده مبسوط</div> <div style="text-align: justify;">   مقدمه و هدف: تشکیل کامل ماتریس روابط خویشاوندی، یک اصل مهم برای دستیابی به نتایج قابل اعتماد در ارزیابی های ژنتیکی میباشد. دو نوع خطای شجره شامل ثبت اطلاعات ناصحیح و گم شدن اطلاعات ثبتی منجر به کاهش قابلیت مدل دام در روش های سنتی میشود. هدف از مطالعه حاضر، اثر سطوح مختلف نقص اطلاعات شجره شامل پدری، مادری و هر دو والدین (پدری و مادری به طور همزمان) بر مقدار وراثت&lrm;پذیری، صحت ارزیابی و پیشبینی ارزش اصلاحی در صفات آستانه ای بود. مواد و روش‌ها: صفتی محدود به جنس با وراثت&lrm;پذیری 0/05، 0/1 و 0/2 ایجاد شد. به منظور ایجاد فنوتیپ های آستانه ای صفت چندقلوزایی، 20 درصد از فنوتیپ های بالا دو و 80 درصد باقیمانده یک در نظر گرفته شد. نسبت های مختلفی از نقص شجره پدری (صفر، 5، 10، 15 و20)، نقص شجره مادری (صفر، 5 و 10) و ترکیبی از هر دو (نقص شجره پدری و مادری به طور همزمان) ایجاد شد. یک مدل آستانه ای در نظر گرفته شد. وراثت&lrm;پذیری، ارزش های اصلاحی و صحت ارزیابی با روش آماری بیز برآورد شد.</div> <div style="text-align: justify;"></div> یافته ها: با معرفی سطوح مختلف نقص شجره به شجره کامل مقدار وراثتپذیری کاهش یافت. برای وراثت پذیری 05 / 0 ، 1 / 0 و 2 / 0 کمترین مقدار وراثتپ ذیری به دست آمده به ترتیب 018/ 0 ، 084/ 0 و 16/ 0 بود. در شجره کامل، کمترین و بیشترین مقدار صحت ارزیابی به ترتیب 375/ 0 ( 05 / 0 = ℎ2 ( و 521/ 0 ( 2/ 0 = ℎ2 ( بود. کمترین مقدار صحت ارزیابی برای وراثت پذیری 05/ 0 ، 1/ 0 و 2/ 0 به ترتیب 309/ 0 )نقص شجره ی پدری 10 درصد و مادری 10 درصد(، 353 / 0 )نقص شجره ی پدری 20 درصد و مادری 10 درصد( و 459/ 0 )نقص شجره ی پدری 5 درصد و مادری 10 درصد( بود. همچنین معرفی نقص شجره در سطوح مختلف منجر به کاهش میانگین ارزش اصلاحی شد. <div style="text-align: justify;">نتیجه‌گیری: نتایج نشان داد، در مقایسه با نقص شجره ی پدری یا مادری به صورت مجزا، نقص شجره ی پدری و مادری به صورت تواما، برآورد ارزیابیهای ژنتیکی را بیشتر کاهش </div> <div style="text-align: justify;">می دهد.  </div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;">Extended Abstract Introduction and Objective: Complete information of relationship matrix is an important principle to achieve reliable results in genetic evaluations. Two kinds of pedigree errors, including incorrect pedigree information and missing pedigree information, reduce the capability of the livestock model in traditional methods. The purpose of this study was to investigate the different levels of missing pedigree information such as sire, dam and both parents (sire and dam together) on heritability, accuracy of prediction and estimation of breeding value in threshold traits. Material and methods: Sex-limited traits with heritability of 0.05, 0.1, and 0.2, were simulated. In order to create threshold phenotypes of litter size, 20% of the top-phenotypes were considered as two and the rest were considered as one. Different ratios of missing sire information (zero, 5, 10, 15 and 20), missing dam information (zeros, 5 and 10) and a combination of both missing information (sire and dam together) were created. A threshold model was considered. Heritability, breeding values and accuracy of prediction were calculated by Bayesian statistical method. Results: With the introduction of different levels of missing pedigree information to the complete pedigree, the amount of heritability decreased. The lowest values of heritability were 0.018, 0.084 and 0.16 for heritability of 0.05, 0.1 and 0.2, respectively. In the complete pedigree, the lowest and highest accuracy of prediction were 0.375 (<m:omath><m:ssup><m:ssuppr><m:ctrlpr></m:ctrlpr></m:ssuppr><m:e><m:r>h</m:r></m:e><m:sup><m:r><m:rpr><m:scr m:val="roman"><m:sty m:val="p"></m:sty></m:scr></m:rpr>2</m:r></m:sup></m:ssup></m:omath> =0.05) and 0.521 (<m:omath><m:ssup><m:ssuppr><m:ctrlpr></m:ctrlpr></m:ssuppr><m:e><m:r>h</m:r></m:e><m:sup><m:r><m:rpr><m:scr m:val="roman"><m:sty m:val="p"></m:sty></m:scr></m:rpr>2</m:r></m:sup></m:ssup></m:omath> =0.2), respectively. The lowest values of accuracy of prediction for heritability of 0.05, 0.1, and 0.2 were 0.309 (30% in paternal pedigree defects and 10% in maternal pedigree defects), 0.353 (paternal pedigree defects 20% and maternal pedigree defects 10%), and 0.459 (5% defect in paternal pedigree and 10% defect in maternal pedigree), respectively. Furthermore, missing pedigree information led to a decrease in the average breeding value. Conclusion: The results showed that, compared to the paternal or maternal missing pedigree information separately, paternal and maternal missing pedigree information together, further reduces the estimation of genetic evaluations. </div> ارزش اصلاحی, روش بیزی, صفت محدود به جنس Bayesian method, Breeding Value, Sex-limited trait 139 144 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-904-5&slc_lang=fa&sid=1 Meysam latifi میثم لطیفی mlganjnameh@gmail.com 100319475328460019962 100319475328460019962 No Independent Researcher, PhD in genetics and Animal Breeding from university of Kurdistan, Kurdistan, Iran دکترای ژنتیک و اصلاح نژاد دام از دانشگاه کردستان، کردستان، ایران Yousef Naderi یوسف نادری yousefnaderi@gmail.com 100319475328460019963 100319475328460019963 Yes Department of Animal Science, Astara Branch, Islamic Azad University, Astara, Iran گروه علوم دامی، واحد آستارا،دانشگاه آزاد اسلامی، آستارا، ایران