fa ارتباط چند شکلی تک‌ نوکلئوتیدی ناحیه اینترون (C2239T) ژن بتا4-دیفنسین با صفات تولید شیر و تعداد سلول های بدنی در گاوهای هلشتاین ژنتیک و اصلاح نژاد دام ژنتیک و اصلاح نژاد دام پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">چکیده مبسوط</span></span></span></strong><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مقدمه و هدف: </span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">دیفنسین&shy; ها پپتیدهای ضد میکروبی کوچکی هستند که نقش مهمی در ایمنـی ذاتـی به عهده دارند. از این رو، ژن&shy; های کدکننده آنها می&shy; توانند به&shy; عنوان نشانگر، در انتخاب به کمک نشانگرها، به بهبود صفت اقتصادی دام&shy; های اهلی کمک بسزایی کنند. از این رو، هدف از این تحقیق بررسی ارتباط بین چند شکلی تک نوکلئوتیدی جایگاه 2239 ناحیه اینترون ژن بتا4-دیفنسین با صفات تولید شیر و تعداد سلول&shy;های بدنی در گاوهای هلشتاین بود. </span></span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مواد و روش</span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">ها: </span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">برای این منظور، در مجموع تعداد 182 رأس گاو شیری هلشتاین انتخاب و </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">DNA</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> ژنومی استخراج شد. سپس، با استفاده از آغازگرهای مناسب قطعه &shy;ای به طول 393 جفت باز، در برگیرنده جهش جایگاه مورد نظر (از جایگاه 2100 الی2493 ژن بتا-4 دیفنسین به شماره دسترسی </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">AF008307.1</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">)، توسط تکنیک واکنش زنجیره پلی مراز تکثیر شد. سپس محصولات تکثیر شده از این ناحیه از اینترون ژن بتا4-دیفنسین توسط تکنیک تفاوت فرم فضایی رشته &shy;های منفرد (</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">SSCPs</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">) و متعاقبا، تعیین توالی مورد بررسی قرار گرفت. برای بررسی ارتباط بین چند شکلی تک نوکلئوتیدی&nbsp; با صفات تولید شیر و تعداد سلول&shy; های بدنی از رویه مدل خطی عمومی </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">(GLM)</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> نرم&shy;افزار </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">SAS</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> (</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نسخه 9/1</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">) استفاده شد.</span></span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">یافته</span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">ها: </span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نتایج این پژوهش حضور سه الگوی متفاوت </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">SSCP</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> در جمعیت مورد بررسی را نشان داد که نتایج تعیین توالی وجود چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی جایگاه 2239 (جایگزینی </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">C</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> با </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">T</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">) در این ناحیه را تایید کرد. فراوانی ژنوتیپ‌های </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">CC</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">CT</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">TT</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> شناسایی شده بر اساس توالی&shy;های بدست آمده در جمعیت مورد مطالعه به&shy; ترتیب 0/79، 0/13 و 0/08 بود. ارتباط معنی&shy; داری بین ژنوتیپ جهش جایگاه 2239 ژن بتا 4-دیفنسین و صفات تولید شیر، درصد چربی، درصد پروتئین و تعداد سلول‌های بدنی در نمونه</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">های مورد بررسی مشاهده نشد. اگرچه، تمایل نزدیک به معنی‌داری بین ژنوتیپ&shy; ها و مقدار تولید شیر مشاهده شد (0/1=</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">p</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">). میانگین تولید شیر و تعداد سلول‌های بدنی برای ژنوتیپ </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">TT</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> نسبت به ژنوتیپ‌های دیگر بیشتر بود در صورتی که ژنوتیپ&shy; های </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">CT</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">CC</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> &nbsp;به &shy;ترتیب کمترین تولید شیر و تعداد سلول&shy; های سوماتیکی را نشان دادند.</span></span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجه</span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">&shy;</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">گیری:</span></span></span></strong> <span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در این پژوهش</span></span></span><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:12.0pt;">،</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> ارتباط معنی‌داری بین ژنوتیپ&shy; های شناسایی شده با صفات تولیدی شیر و تعداد سلول&shy; های بدنی مشاهده نشد ولی این ارتباط برای صفت مقدار تولید شیر روزانه تمایل به معنی‌داری نشان داد. همچنین نتایج نشان داد ژنوتیپ&shy; های </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">TT</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">CT</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> برای این جهش به&shy; ترتیب دارای بیشترین و کمترین مقدار تولید شیر بودند.</span></span></span></div> &nbsp;<br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"></span></span></span></strong> <div style="text-align: justify;"><strong>Extended Abstract</strong><br> <strong>Introduction and Objective</strong>: Defensins are small antimicrobial peptides that play an important role in innate immunity. Therefore, their coding genes can be used as markers in selecting markers to help improve the economic quality of domestic animals. Therefore, the aim of this study was to investigate the relationship between C2239T SNP of the intron region of the beta-4-defensin gene with milk production traits and the somatic cell count in Holstein cows.<br> <strong>Material and Methods</strong>: For this purpose, genomic DNA was extracted from 182 dairy cows. Then, using a suitable primer pairs, a 393 bp fragment from intron of bovine B4-defensin sequence (2100 to 2493) was amplified by the polymerase chain reaction. Then, the amplified fragment was screened by single strand conformation polymorphism (SSCP) and DNA sequencing methods. The associations between genotypes of the SNP with SCC and milk production traits were analyzed using the GLM procedure of SAS (9.1).<br> <strong>Results</strong>:&nbsp; A total of 3 distinct SSCP patterns (A, B and C) were observed which confirmed single nucleotide polymorphism (substitution of C to T) at position 2239 upon sequence analysis in the population. The frequencies of CC, CT and TT genotypes were 0.79, 0.13 and 0.08, respectively. No significant difference was observed between SNP genotypes and milk production traits and SCC. However, the genotypes were tended to associate with milk yield (p=0.10). The highest average milk yield and somatic cell count were found in the TT genotype, whereas the lowest ones for average milk yield and somatic cell count were CT a CC genotypes, respectively.<br> <strong>Conclusion</strong>: In this study, no significant relationship was observed between the identified genotypes with milk production traits and the number of body cells, but this relationship showed a significant tendency for the amount of daily milk production. The results also showed that TT and CT genotypes for this mutation had the highest and lowest milk production, respectively.</div> &nbsp;<br> &nbsp; تعداد سلول­های بدنی, چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی, ژن بتا4-دیفنسین, صفات تولید شیر, SSCP B4-defensin gene, Milk production traits, Single nucleotide polymorphism, Somatic cell count, SSCP 141 147 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1257-1&slc_lang=fa&sid=1 mustafa mijahjehj dolatabady مصطفی محقق دولت آبادی mmuhaghegh@yu.ac.ir 100319475328460017133 100319475328460017133 Yes Animal Science Department, Faculty of Agriculture Science, University of Yasouj, Yasouj, Iran گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران azam rahimirezaei اعظم رحیمی رضایی azamrahimi34@yahoo.com 100319475328460017134 100319475328460017134 No Animal Science Department, Faculty of Agriculture Science, University of Yasouj, Yasouj, Iran گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران