به­منظور بررسی اثر نقص شجره پدر بر پیشرفت و روند ژنتیکی یک صفت کمی در جمعیت با وراثت­پذیری 15/0 و 3/0
شبیه­سازی شدند. برای هر جمعیت اطلاعات حاصل از 10 سال انتخاب و آمیزش در فایل­های جداگانه ذخیره شد. در هر فایل شماره پدرها به میزان ده درصد (از صفر تا صد درصد) با دو روش تصادفی و متوالی از فایل شجره حذف شده و فایل­های داده مختلف با مدل حیوان تجزیه شدند. روند ژنتیکی در هر دو روش و در هر دو جمعیت  با افزایش درصد حذف پدرها بطور معنی­دار کاهش یافت. در جمعیت 1، میزان کاهش روند ژنتیکی برآورد شده در شجره فاقد پدر نسبت به شجره کامل و جامعه پایه به ترتیب 18/86% و 1/89% بود. در جمعیت 2 نیز این نسبت­ها به ترتیب 42/88% و 16/90% بودند. در روش حذف تصادفی، کاهش مقادیر در درصدهای حذف اولیه شدیدتر بوده و در حذف­های بالاتر کمتر بود، درحالیکه در روش حذف متوالی تغییرات یکنواخت­تر بود. پیشرفت ژنتیکی سالانه نیز در تمام این حالت­ها با افزایش درصد حذف شجره پدر بطور قابل ملاحظه­ای کاهش یافت. بنابراین لازم است شجره پدر با دقت بالا در گله های اصلاح نژادی ثبت شود.