دوره 12، شماره 32 - ( تابستان 1400 )
جلد 12 شماره 32 صفحات 166-160 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Eskandarynasab S, Roudbari Z, Mohammadabadi M. (2021). Transcriptome Analysis of Mammary Gland Tissue to Identify Major Genes Involved in the Milk Production. rap. 12(32), 160-166. doi:10.52547/rap.12.32.160
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1177-fa.html
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1177-fa.html
اسکندری نسب سعیده، رودباری زهرا، محمدآبادی محمدرضا. واکاوی ترانسکریپتوم بافت پستانی جهت شناسایی ژن های عمده اثر در فرآیند تولید شیر پژوهشهاي توليدات دامي 1400; 12 (32) :166-160 10.52547/rap.12.32.160
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران
چکیده: (1894 مشاهده)
تولید شیر یکی از مهم ترین صفات اقتصادی در صنعت پرورش گاو شیری است که توسط تعداد زیادی ژن کنترل می شود و تابعی از فعالیت سلولهای اپیتلیال می باشد که تحت تأثیر چندین مسیر بیولوژیکی و اثر متقابل ژنهای مختلف و بیان ژنها می باشند. بیان ژن فرایندی است که در آن از اطلاعات درون ژن استفاده می شود تا یک محصول کاربردی از آن به دست آید، همچنین یکی از مسائل بنیادی است که کمک می کند تا ژنوتیپ به صورت فنوتیپ ظاهر شود. هدف از این مطالعه شناسایی ژنهای مؤثر بر تولید شیر و رسم شبکه ژنی ژنهای مورد مطالعه جهت شناسایی ژنهای عمده اثر برای فهم بهتر مکانیسم تولید شیر با استفاده از بررسی الگوی بیان ژن طی بررسی های بیوانفورماتیکی می باشد. در این مطالعه به منظور شناسایی ژنها با بیان متفاوت در بافت پستان گاو شیری، داده های بیان ژن مربوط به بافت پستانی با شماره دسترسی GSE33680 از بخش GEO بانک اطلاعاتی NCBI استخراج گردید. بررسی کیفیت داده ها با استفاده از بسته Limma موجود در نرم افزار R و با استفاده از روش تحلیل مؤلفه های اساسی انجام شد. به منظور بررسی عملکرد ژنها با بیان متفاوت از نرم افزار DAVID استفاده شد. پس از شناسایی ژنهای هدف به پایگاه دادهای STRING ارائه شدند، جهت تبین نقش ژنها از نرم افزار Cytoscape استفاده شد. در این مطالعه نتایج تجزیه تفاوت بیان ژنها منجر به شناسایی 14020 ژن شد که بر اساس آماره Fold change و adj p-Value تعداد 409 ژن افزایش بیان و 326 ژن کاهش بیان داشتند. از جمله مسیرهای بیولوژیکی شناخته شده مؤثر بر تولید شیر NF-KB signaling, Glycerolipid metabolism ،EGFR1, IL6, B cell receptor, می باشند. مهم ترین ژنها براساس درجه ارتباط با ژنهای دیگر و مرکزیت درونی و بیرونی ژنهای MYC، KRAS، HSPA8،ATP5B ، SRC، JAK1 و FOXA2میباشند که نقش آنها در تنظیم تولید شیر در گزاراشات متعددی به اثبات رسیده است.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
ژنتیک و اصلاح نژاد دام
دریافت: 1399/11/7 | ویرایش نهایی: 1400/6/9 | پذیرش: 1400/2/12 | انتشار: 1400/6/9
دریافت: 1399/11/7 | ویرایش نهایی: 1400/6/9 | پذیرش: 1400/2/12 | انتشار: 1400/6/9
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
