Research on Animal Production
پژوهشهاي توليدات دامي
rap
Agriculture
http://rap.sanru.ac.ir
1
admin
2251-8622
2676-461X
8
10.61186/rap
14
8888
13
fa
jalali
1399
7
1
gregorian
2020
10
1
11
29
online
1
fulltext
fa
بررسی چند شکلی اگزون 2 ژن MHC-DRB1 با روش PCR-RFLP و ارتباط آن با صفات رشد در بز عدنی
Investigation of Polymorphism in Exon II of MHC-DRB1 Gene Using PCR-RFLP Technique and Its Association with Growth Traits in Adani Goat
ژنتیک و اصلاح نژاد دام
ژنتیک و اصلاح نژاد دام
پژوهشي
Research
<p style="text-align: justify;"><span style="font-size:11px;"> <strong><span style="color:black;">در مطالعه حاضر برای شناسایی چند</span></strong> <strong><span style="color:black;">شکلی ناحیه اگزون 2 ژن </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">MHC</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> (مجتمع اصلی سازگاری بافتی) و ارتباط آن با صفات رشد (وزن تولد و سه ماهگی) در جمعیت بز عدنی، از تعداد 97 راس بزعدنی استان بوشهر خون‏گیری انجام گرفت. </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">DNA</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> ژنومی از نمونه‏ های خون استخراج و قطعه ‏ای به اندازه 279 جفت باز از ناحیه اگزون 2 ژن </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">MHC</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> با استفاده از واکنش زنجیره‏ای پلی‏مراز (</span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">PCR</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">) تکثیر و محصولات </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">PCR</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> به دست آمده به وسیله آنزیم برشی </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">Ras I</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> هضم شدند. نتایج بدست آمده حاکی از وجود 4 نوع آلل </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">A</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">، </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">B</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">، </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">C</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> و </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">D</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> در این جایگاه بود که فراوانی آن‏ها در کل جمعیت به ترتیب 51، 8/26، 4/13 و 8/8 درصد محاسبه شد. تعداد 5 ژنوتیپ </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AA</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">، </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AB</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">،</span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">BB </span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">، </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AC</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> و </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AD</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> شناسایی شدند که فراوانی ژنوتیپی محاسبه شده آن‏ها در جمعیت به ترتیب برابر 432/14، 866/28، 371/12، 80/26 و 52/17 درصد بود.‏‏ نتایج نشان دهنده ‏ی وجود چند</span></strong> <strong><span style="color:black;">شکلی و میزان هتروزیگوسیتی بالا در جمعیت مورد مطالعه ابود. تعداد آلل موثر، شاخص شانون، هتروزیگوسیتی مورد‏انتظار و مشاهده شده برای این جایگاه به ترتیب 794/2، 179/1، 642/0 و732/0 محاسبه شد. بعلاوه، آزمون کای مربع نشان داد که جمعیت در جایگاه </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">MHC-DRB1</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> در تعادل هاردی-‏وینبرگ قرار ندارد. نتایج نشان داد که تاثیر ژنوتیپ ‏های مختلف بر وزن تولد معنی‏ دار بود (05/0</span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">p<</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">) اما بر وزن سه ماهگی معنی‏ دار نبود (05/0< </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">p</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">). بعلاوه، سایر صفات مثل سن مادر، جنسیت، فصل و تیپ تولد روی هیچ کدام از صفات رشد بدن معنی‏ دار نشد (05/0<</span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">p</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;">). بیشترین وزن تولد مربوط به ژنوتیپ‏ های هتروزیگوت </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AC</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> و </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AD</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> ( 05/3 و 02/3 کیلوگرم) و کمترین وزن تولد مربوط به ژنوتیپ خالص </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AA</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> (75/1 کیلوگرم) بود. به نظر می‏رسد با انتخاب ژنوتیپ </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AC</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> و </span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">AD</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"> بتوان افزایش وزن تولد را در بز عدنی انتظار داشت. همچنین می توان از این ژن به عنوان یک ژن کاندیدا برای بهبود ژنتیکی برخی از صفات رشد در برنامههای اصلاح نژادی بز مورد توجه قرار گیرد.</span></strong></span></p>
In the present study, blood samples were collected from 97 Adani goat from Bushehr province in order to identify the polymorphism in the exon II region of MHC-DRB1 gene (Major Histocompatibility Complex) and also, its association with growth traits (birth weight and 3 months weight). Genomic DNA was extracted from blood samples. A 279-bp fragment was amplified using polymerase chain reaction (PCR). Eventually, the PCR products were digested by RasI enzyme. The results showed that there were 4 types of alleles A, B, C and D in this locus with the frequencies of %51, %26.8, %13.4 and %8.8, respectively. Five genotypes including AA, AB, BB, AC and AD were identified with the frequency of %14.432, %28.866, %12.371, %26.80 and %17.525, respectively. The results indicated polymorphism and high heterozygosity in the population under study. Also, the number of effective alleles, Shannon index, expected and observed heterozygosity for this site was calculated at 2.794, 1.179, 0.642 and 0.732, respectively. Moreover, the chi-square (χ<sup>2</sup>) test showed that population was not in Hardy-Weinberg equilibrium. The ANOVA results showed that the effect of different genotypes on birth weight was significant (p<0.05), but it was not significant on 3 MW (p<0.05). Furthermore, other traits such as dam age, sex, season and birth type effects were not significant on the growth traits (p<0.05). The highest birth weight was found for heterozygous AC and AD genotypes (3.05 and 3.02 Kg, respectively), and the lowest birth weight was related to pure AA genotype (1.75 Kg). It seems that selecting AC and AD genotypes can be expected to increase birth weight in Adani goat. Also, we expect that this gene can act as a candidate gene for genetic improvement of some growth traits in goat breeding programs.
چند شکلی, ژنMHC, بز عدنی, PCR-RFLP
Polymorphism, MHC Gene, RFLP, Adani Goat
107
115
http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1138-1&slc_lang=fa&sid=1
sakineh
hezarsi bori
سکینه
هزارسی بوری
sakinehhezarsi@gmail.com
100319475328460014671
100319475328460014671
Yes
Faculty of Animal Science and Food Technology, Agricultural science and Natural Resources University of Khuzestan, Ahvaz, Iran
گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران
mohammad taghi
beigi nassiri
محمدتقی
بیگی نصیری
mt_nassiri@yahoo.com
100319475328460014672
100319475328460014672
No
Department of Animal Science, Faculty of Animal science and Food Technology, Agricultural Science and Natural Resources University of Khuzestan, Ahvaz, Iran
گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران
hedayatallah
roshanfekr
هدایت اله
روشنفکر
ROSHANFEKR_hd@yahoo.com
100319475328460014673
100319475328460014673
No
گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران
mahmood
nazari
محمود
نظری
m.nazari@asanrukh.ac.ir
100319475328460014674
100319475328460014674
No
Department of Animal Science, Faculty of Animal science and Food Technology, Agricultural Science and Natural Resources University of Khuzestan, Ahvaz, Iran
گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران