fa اهمیت خویشاوندی ژنتیکی و رکورد فنوتیپی بر صحت ژنومی داده‌های جانهی شبیه‌ سازی شده با استفاده از مدل های حیوانی در حضور اثرات متقابل ژنوتیپ و محیط ژنتیک و اصلاح نژاد دام ژنتیک و اصلاح نژاد دام پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><strong><span style="font-size:11px;">هدف این تحقیق بررسی نقش ارتباط خویشاوندی بین جمعیت مرجع و تأیید با نسبت‌های مختلف رکوردهای فنوتیپی جمعیت مرجع بر صحت پیش‌بینی‌های ژنومی مدل‌های حیوانی مختلف با استفاده از شبیه‌سازی داده‌های ژنومی جانهی بود.&nbsp; بدین منظور، چهار سناریو متفاوت برای سطوح مختلف عدم تعادل پیوستگی (بالا و پایین<span dir="LTR">LD=</span>) و جایگاه &shy;های صفات کمی (90 و 300) با تراکم <span dir="LTR">K</span>15 شبیه‌سازی شد. بعد از شبیه‌‌سازی جمعیت‌&shy;ها، به طور تصادفی اقدام به حذف 50 و 95 درصد نشانگرها نموده و در مرحله بعد نشانگرهای حذف شده جانهی شدند. در ادامه، از طریق کد نویسی در نرم افزار <span dir="LTR">R</span>، شبیه‌سازی جهت ایجاد خویشاوندی ژنتیکی بین صفات در سه محیط با وراثت&shy;‌پذیری‌های مختلف برای داده‌های اصلی و جانهی انجام شد. دامنه صحت جانهی بین 737/0-941/0 بود. <span dir="LTR">LD</span> فاکتور اصلی مؤثر بر صحت جانهی بود. با افزایش سطح <span dir="LTR">LD</span> و وراثت &shy;پذیری، صحت پیش&shy; بینی ژنومی افزایش یافت. زمانی که حیوانات بدون رکورد فنوتیپی محیط دوم، با استفاده از اطلاعات ژنومی خویشاوندان شان در محیط سوم ارزیابی شدند مقدار صحت پیش &shy;بینی ژنومی بالا بود. هنگامی که حیوانات با 75 درصد رکورد فنوتیپی در محیط دوم، با استفاده از اطلاعات ژنومی خویشاوندان شان در محیط اول و سوم ارزیابی شدند بالاترین مقدار صحت پیش&shy;&shy; بینی ژنومی مشاهده شد. نتایج نشان داد که جانهی پنل&shy;‌های با تراکم خیلی پایین به <span dir="LTR">K</span>15 همیشه راه کار مناسبی جهت پیش&shy;‌بینی ژنوتیپ‌ها نمی‌باشد. به طور کلی، استفاده هم&shy;زمان از اطلاعات </span>خویشاوندان و افزایش تعداد رکورد فنوتیپی در جمعیت مرجع، صحت پیش&shy; بینی ژنومی <span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مدل&shy;‌های حیوانی مختلف را در حضور اثرات متقابل ژنوتیپ و محیط</span></span> <span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">افزایش داد.</span></span></strong></div> The objective of this study was to investigate the role of genetic relationships between training and validation set with considering different ratio of phenotypic records of training set on accuracy of genomic prediction via animal models containing genotype &times; environment interactions in simulated imputation data. For this purpose, four different scenarios using 15k density containing different levels of linkage disequilibrium (LD= low and high) and quantitative trait loci (90 and 300) was simulated. After simulating the population, the markers randomly masked with 50 and 95 percentage of missing rate for each scenario; afterwards, hidden markers were imputed. In the following, using coding in R software, the simulation was done to create the genetic relationships between the traits in three environments with different heritability&rsquo;s in original and imputed data. The accuracy of imputation ranged from 0.737 to 0.941. LD was main factor on accuracy of imputation. Accuracy of genomic prediction generally increased when LD and heritability was increased. When <s>non</s>-phenotyped animals for the second environment were estimated using information of their relatives in the third environment, accuracy of genomic predictions was generally high. The accuracy of genomic prediction was the highest, when 75% of the second environment animals had phenotypic records and evaluated using information of their relatives in the first and third environments. The results showed that genotype imputation of very low density to 15k panel is not always helpful for genotypes prediction. Generally, simultaneous usage of relatives information and increasing phenotypic records of validation set increase the accuracy of genomic predictions using animal models in presence of genotype &times; environment interactions.<br> <strong><span dir="RTL"></span></strong><br> <br> <strong><span dir="RTL"></span></strong> اطلاعات ژنومی, صحت جانهی, صفات همبسته, عدم تعادل پیوستگی, وراثت‌پذیری Genomic information, imputation accuracy, Correlated traits, Linkage disequilibrium, Heritability 119 130 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-904-3&slc_lang=fa&sid=1 Yousef Naderi یوسف نادری y.naderi@iau-astara.ac.ir 100319475328460012000 100319475328460012000 Yes Islamic Azad University, Astara Branch استادیار، گروه علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد آستارا، آستارا، ایران