Research on Animal Production

fa آنالیز چند شکلی های ژنتیکی در چهار جایگاه نشانگری ژن PEPCK-C در سویه های مختلف مرغ Analysis of Genetic Polymorphisms in Four Marker Sites of PEPCK-C Gene in Different Strains of Chickens تخصصي Special پژوهشي Research      این پژوهش به منظور شناسایی چند شکلیهای آللی در چهار جایگاه ژنی <a name="OLE_LINK9"></a><a name="OLE_LINK8">PEPCK-C</a> در سویههای مرغ تجاری گوشتی، تخمگذار و مرغهای مولد از ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی مازندران با استفاده از تکنیک PCR-RFLP انجام شد.<a name="OLE_LINK18"></a> نمونههای خون به طور تصادفی از 150 قطعه مرغ (هر جمعیت 50 قطعه) جمعآوری و استخراج DNA با روش نمکی بهینه یافته انجام گرفت. <a name="OLE_LINK34"></a><a name="OLE_LINK33">با استفاده از </a>PCR و آغازگرهای اختصاصی در مجموع قطعهای با طول 3792 جفت باز از ناحیه 1723- تا اگزون 4 ژن PEPCK-C تکثیر شد. فراوانی آللی در جایگاه RsaI، <a name="OLE_LINK140"></a><a name="OLE_LINK139">در جمعیت مرغان بومی مازندران </a>A (33%) و B (67%) و ژنوتیپ AB و BB به ترتیب با فروانی 66 و 34 درصد، در جمعیت مرغهای گوشتی A (34%) و B (66%) و ژنوتیپهای AB و BB به ترتیب با فروانی 68 و 32 درصد و در جمعیت مرغهای تخم‌گذار A (24%) و B (76%) و ژنوتیپهای AB و BB به ترتیب با فراوانی 48 و 52 درصد مشاهده شد. <a name="OLE_LINK51"></a><a name="OLE_LINK50"></a>برای جایگاه BstEII در جمعیت مرغ<a name="OLE_LINK5">های</a> بومی فراوانی <a name="OLE_LINK47"></a><a name="OLE_LINK46">آللی </a>A (28%) و B (72%) و سه ژنوتیپ AA، AB و  BBبه ترتیب با فراوانی هر یک 2، 52 و 46 درصد، در جمعیت مرغهای گوشتی A (19%) و B (81%) ، سه ژنوتیپ AA، AB وBB به ترتیب با فراوانی هر یک 2، 34 و 64 درصد و در جمعیت مرغهای تخم‌گذار A (59%) و B (41%) ، ژنوتیپهای AA، AB و BB به ترتیب با فراوانی هر یک 42، 34 و 24 درصد محاسبه شد. <a name="OLE_LINK2"></a><a name="OLE_LINK1"></a>فراوانی آللی در جایگاه PstI، در جمعیت مرغهای بومی مازندران A (43%) و B (57%) و سه ژنوتیپ AA، AB و BB به ترتیب با فراوانی هر یک 16، 54 و 30 درصد، در جمعیت مرغهای گوشتی A (52%) و B (48%) و سه ژنوتیپ AA، AB و BB به ترتیب با فراوانی هر یک 18، 68 و 14 درصد و در جمعیت مرغهای تخم‌گذار A و B (50%) و سه ژنوتیپ AA، AB و  BBبه ترتیب با فراوانی هر یک 6، 88 و 6 درصد برآورد شد. نتایج برای جایگاه BstEII (موقعیت 26+ تا 1035+) نشان داد که همه نمونهها در سویههای مختلف الگوی باندی یکسان (ژنوتیپ وحشی BB) دارند. از میان سه SNP شناسایی شده دو SNP در ناحیه پروموتور و یک SNP در ناحیه اینترون 2 واقع شده بود. با توجه به چند شکل بودن و همچنین بزرگ اثر بودن آن بر صفات تولیدی مختلف، مانند تولید تخم مرغ، ضریب تبدیل غذایی و رشد، این جایگاه ژنی میتواند به عنوان ژن کاندید در مطالعات شناساییQTL  مرتبط به این صفات در صنعت طیور مورد توجه قرار گیرد.      This research was carried out in order to detect the polymorphisms in four sites of PEPCK-C gene by PCR-RFLP method in a commercial layer and broiler strains and breeder hens of Mazandaran native fowls breeding station. Blood samples were collected randomly from 150 birds from a three populations and DNA was extracted using modified salting out method. Using polymerase chain reaction (PCR) and specific primers pairs a region with the length of 3792 bp from position -1723 to exon 4 from PEPCK-C gene was amplified. In RsaI marker site two alleles of A (33%) and B (67%) were detected in Mazandaran native fowls, A (34%), B (66%) in commercial broiler and A (24%) and B (76%) in commercial layer population. Two genotypes of AB and BB were detected with the frequency of 66 and 34% in Mazandaran native fowls 68 and 32% in commercial broiler and 48 and 52% in commercial layer hens. In BstEII marker site two alleles of A (28%) and B (72%) were detected in Mazandaran native fowls population, A (19%), B (81%) in commercial broiler and A (59%) and B (41%) in commercial layer lines. Three genotypes of AA, AB and BB were detected with the frequency of 2, 52 and 46 in Mazandaran native fowls, 2, 34 and 64% in commercial broiler and 42, 34 and 24% commercial layer. In PstI marker site two alleles of A (43%) and B (57%) were detected in Mazandaran native fowls population, A (52%), B (48%) in commercial broiler and A and B (50%) in commercial layer samples. Three genotypes of AA, AB and BB were detected with the frequency of 16, 54 and 30% in Mazandaran native fowls, 18, 68 and 14% in commercial broiler and 6, 88 and 6% in commercial layer population. In BstEII marker site (position +26 to +1035) the results showed that all samples from different strains had the same banding pattern with monomorphic BB genotype. Among 3 observed SNPs 2 were in the promoter site and 1 in intron 2 region. As a result of finding polymorphism in this marker site and also its major effect on production traits such as egg for production, feed conversion ratio and growth rate it can be considered as a candidate gene in detection of QTL related to these traits in poultry industry. چند شکلی, PEPCK-C, مرغ, PCR-RFLP Polymorphism, PEPCK-C, Chicken, PCR-RFLP 115 121 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-263&slc_lang=fa&sid=1 زهره یوسفی 10031947532846007479 10031947532846007479 Yes قدرت رحیمی میانجی 10031947532846007480 10031947532846007480 No زربخت انصاری پیرسرایی 10031947532846007481 10031947532846007481 No