Research on Animal Production
پژوهشهاي توليدات دامي
rap
Agriculture
http://rap.sanru.ac.ir
1
admin
2251-8622
2676-461X
8
10.61186/rap
14
8888
13
fa
jalali
1396
8
1
gregorian
2017
11
1
8
16
online
1
fulltext
fa
شناسایی چندشکلی در اگزون دوم ژن GDF9در گوسفندان خالص و آمیخته پاکستانی
Detection of Polymorphism in Exon 2 of GDF9 gene in Pure and Crossbred of Pakistani Sheep
تخصصي
Special
پژوهشي
Research
<strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">ژن </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">GDF9</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> از</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مهم­ ترین ژن­ های</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">موثر</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">بر</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">چندقلوزایی</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">گوسفندان می­ باشد. لذا، هدف از انجام این تحقیق شناسایی چندشکلی ­های تک­نوکلئوتیدی موجود در اگزون دوم ژن </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;"> GDF9</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در <span style="color:black;">گوسفندان </span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">خالص و آمیخته </span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">پاکستانی </span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">به روش </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">PCR-SSCP</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> بود. به این منظور،</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نمونه</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> های</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">خون از 30 رأس گوسفند پاکستانی، 17 رأس</span></span></strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> <strong>گوسفند آمیخته پاکستانی و لری بختیاری و 7 رأس گوسفند آمیخته پاکستانی و کرمانی تهیه و استخراج </strong></span></span><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">DNA</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> به روش نمکی بهینه انجام شد. با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی یک قطعه 634 جفت بازی با کمک واکنش زنجیره­ای پلیمراز تکثیر شد. پس از تعیین</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> چند شکلی فضایی تک رشته ­ای محصولات </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">PCR</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، الگوهای باندی مربوط به ژن </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">GDF9</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> روی ژل پلی اکریل­آمید </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">8 درصد</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">رنگ آمیزی شده با نیترات نقره مشاهده شد. </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در مجموع </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">سه جمعیت مورد مطالعه، چهار الگوی باندی 1، 2، 3 و 4</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">با فراوانی­ های 093/0، </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">129/0،</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">371/0 و 407/0 بدست آمد. <span style="color:black;">نتایج توالی­یابی منجر به شناسایی سه جهش در موقعیت­های نوکلئوتید </span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">443</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، 477 و 721</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> ژن </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">GDF9</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> در <span style="color:black;">جمعیت­های مورد مطالعه گردید.</span> </span></span></strong>
GDF9 gene is one of the most important effective factors on litter size in sheep. Thus, the aim of the present study was to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) available in exon 2 of GDF9 gene in pure and crossbred of Pakistani sheep using PCR-SSCP. Hence, blood samples were collected from 30 Pakistani sheep, 17 crossbred sheep (Pakistani rams × Lori-Bakhtiari) and 7 crossbred sheep (Pakistani rams × Kermani ewes) and genomic DNA was extracted using salting-out method. A 634 bp fragment was amplified using one specific primer pairs using polymerase chain reaction. After single stranded conformation polymorphism (SSCP) of PCR products, band patterns of GDF9 gene were observed on 8% polyacrylamide gel stained with silver-nitrate method. In total, 4 banding patterns 1, 2, 3 and 4 were obtained with frequencies of 0.193, 0.129, 0.371 & 0.407, respectively. The sequencing results were led to identification of 3 mutations in 443, 477 and 721 nucleotide situations of GDF9 gene in the studied populations<span dir="RTL">.</span>
چندشکلی, چندقلوزایی, ژنGDF9 ,PCR-SSCP ,SNP
GDF9 gene, Litter Size, PCR-SSCP, Polymorphism, SNP
158
165
http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-233&slc_lang=fa&sid=1
رسول
خدابخش زاده
10031947532846007039
10031947532846007039
No
محمدرضا
محمدآبادی
10031947532846007040
10031947532846007040
Yes
علی
اسمعیلی زاده کشکوئیه
10031947532846007041
10031947532846007041
No
حسین
مرادی شهربابک
10031947532846007042
10031947532846007042
No