fa کارایی انتخاب ژنومی در برنامه‌های اصلاح نژاد مرغان بومی ژنتیک و اصلاح نژاد طیور ژنتیک و اصلاح نژاد طیور پژوهشي Research <p dir="RTL"><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; توسعه انتخاب ژنومی استراتژی&shy; های جدیدی را در اصلاح نژاد حیوانات ایجاد کرده است. هدف از این مطالعه بررسی کارایی انتخاب ژنومی در برنامه&shy; های اصلاح نژادی مرغان بومی بود. در این مطالعه یک سناریوی مرجع با تعداد 3380 پرنده با استفاده از اطلاعات فنوتیپی و شجره&shy;ای</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">شبیه&shy; سازی شد و پیشرفت ژنتیکی با روش قطعی توسط نرم&shy;افزار </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">ZPLAN+</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> ارزیابی گردید. این سناریو با دو برنامه اصلاحی ژنومی به&shy; منظور تعیین بهترین استراتژی برای کاربرد اطلاعات ژنومی در مرغان بومی مقایسه شد. در سناریوی ژنومی اول از اطلاعات ژنومی هر دو جنس و در سناریوی ژنومی دوم تنها از اطلاعات ژنومی خروس&shy; ها استفاده شد.</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در هر دو سناریو ژنومی تعداد کاندیداهای انتخابی نر بین 800 تا 1600 خروس متغیر بود و چهار اندازه از </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">جمعیت مرجع (500</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، 1000، 1500</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">و یا</span></span></strong> <strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">2000 پرنده) در نظر قرار گرفت. فاصله بین&shy;نسلی در سناریوی مرجع </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">برابر با 5/14 ماه بود. در هر دو سناریوی ژنومی، انتخاب در زودترین زمان ممکن از لحاظ بیولوژیکی انجام شد. به&shy; همین دلیل فاصله بین&shy;نسلی به 8 ماه کاهش یافت. در سناریوهای ژنومی رشد ژنتیکی و سود اقتصادی برنامه اصلاحی افزایش یافت (</span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">9434880 ریال تا 10931310 ریال سود </span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">به&shy; ازای هر واحد حیوانی در سناریوی دو). دقت شاخص انتخاب در سناریوی مرجع برای مسیر خروس&shy;ها 61/0 و برای مسیر مرغ&shy;ها 63/0 بود. دقت در سناریوهای ژنومی در مقایسه با سناریوی مرجع افزایش داشت (67/0 تا 76/0). این مطالعه نشان داد افزایش دقت و کاهش فاصله بین&shy;نسلی در سناریوهای ژنومی تأثیر مثبت بر سود و رشد ژنتیکی داشت. بنابراین کاربرد اطلاعات ژنومی کارایی برنامه&shy;های اصلاحی را در مرغان بومی افزایش داد. با تکیه بر نتایج بدست آمده از این مطالعه، می&shy;توان انتخاب ژنومی را در برنامه &shy;های اصلاحی ژنومی مرغان بومی کشور به کار برد. برای کاهش هزینه&shy; ها نیز پیشنهاد می &shy;شود کاربرد تراشه&shy; های </span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">SNP</span></span></span></strong><strong><span style="font-family:2 mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> با تراکم پایین بررسی شود.</span></span></strong><br> &nbsp;</p> <p style="margin-left:18.0pt;">The development of genomic selection has created new strategies in animal breeding programs. The aim of this study was to investigate the efficiency of genomic selection in breeding programs of native hens. In this study, a reference scenario with 3380 birds using pedigree and phenotypic information was simulated and the expected genetic progress was derived deterministically with the software of ZPLAN+. The reference scenario was compared with two genomic breeding programs to determine the best strategy for implementing genomic information in breeding programs of native hens. In scenario I, the genomic information of both sexes was used, but in scenario II, only one&#39;s of males was used. In both scenarios, the number of genotyped male selection candidates was varied between 800 and 1600 males and four size of the reference population including (500, 1000, 1500 or 2000 birds) were considered. The generation interval of 14.5 months was in the reference scenario. In both genomic scenarios, breeders of both sexes were select at the biologically earliest possible age. So, the generation interval was reduced to eight months. All genomic scenarios increased the genetic gain and the economic profit of the breeding program (&euro; 235.87 to &euro; 273.28 profit per animal unit in scenario II). The accuracy of the selection index in reference scenario was 0.61 and 0.63 for cocks and hens, respectively. This study showed that the increase of accuracy and decrease of general interval in genomic scenarios has a positive effect on the profit and genetic gain<span dir="RTL">.</span> So, application of genomic information increased the efficiency of breeding programs in native fowl. Based on the results of this study, genomic selection can be used in genomic breeding programs of native fowls. To reduce costs, it is also recommended to investigate the application of low-density SNP chips.</p> انتخاب ژنومی, مرغان بومی, رشد ژنتیکی, شبیه‌سازی, ZPLAN+ Genomic Selection, Genetic Gain, Native Hens, Simulation, ZPLAN+ 83 92 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-527-2&slc_lang=fa&sid=1 Sara Ebrahimpour Taher سارا ابراهیم پورطاهر sa.pourtaher@gmail.com 10031947532846008365 10031947532846008365 Yes University of Tabriz دانشگاه تبریز Sadegh Alijani صادق علیجانی sad-ali@tabrizu.ac.ir 10031947532846008366 10031947532846008366 No University of Tabriz دانشگاه تبریز Seyed Abbas Rafat سید عباس رافت Rafat@tabrizu.ac.ir 10031947532846008367 10031947532846008367 No University of Tabriz دانشگاه تبریز Aahmad Reza Sharifi احمد رضا شریفی rsharifi@gwdg.de 10031947532846008368 10031947532846008368 No University of Göttingen دانشگاه گوتینگن المان