fa ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان بومی فارس بر مبنای توالی‌یابی بخشی از ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری تخصصي Special پژوهشي Research <p><strong>&nbsp; طیور بومی به عنوان ذخایر ژنتیکی ملی مطرح هستند و نگهداری آن‌ها از نظر حفظ تنوع زیستی بسیار با</strong> <strong>‌‌اهمیت است. بررسی ژنوم میتوکندری در یک نژاد و مقایسه آن با سایر نژادها می‌تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در آن جمعیت را ارائه دهد. این پژوهش با هدف تعیین توالی بخش بسیار متغیر 1</strong><strong><span dir="LTR">(HVR-I) </span></strong>&nbsp;<strong>از ناحیه </strong><strong><span dir="LTR">D-loop</span></strong> <strong>ژنوم میتوکندری مرغ بومی فارس صورت گرفت. به این منظور از تعداد 20 قطعه مرغ بومی فارس به&shy;طور تصادفی خون‌گیری انجام شد. پس از استخراج </strong><strong><span dir="LTR">DNA</span></strong> <strong>از خون کامل، ناحیه </strong><strong><span dir="LTR">HVR-I</span></strong> <strong>با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و سپس توالی‌یابی شد. در کل 12 عدد توالی با کیفیت مناسب به دست آمد. بعد از تجزیه و تحلیل توالی&shy;ها، تعداد 3 هاپلوتیپ از بین توالی‌های مورد بررسی مشخص شد که دارای 5 جایگاه چند شکلی تک نوکلئوتیدی </strong><strong><span dir="LTR">(SNP)</span></strong> <strong>بودند. این تغییرات به&shy;طور عمده از نوکلئوتیدهای شماره 217 تا 446 مشاهده شدند. درخت فیلوژنی پس از اخذ توالی‌های مشابه ژنوم میتوکندری دیگر نژادهای موجود در بانک جهانی ژن ترسیم شد. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که مرغان بومی فارس با مرغان بومی کشور آذربایجان، لگهورن سفید، مرغ ابریشمی، مرغ جنگلی خاکستری (سونراتی)، پلیموت راک پر‌خط‌دار، مرغ بومی مرندی و مازندرانی ایران در یک دسته قرار دارند. بنابراین می‌توان نتیجه‌گیری کرد که مرغ فارس ممکن است دارای برخی شباهت‌های ژنتیکی با این نژادها باشد.</strong></p> <p>Native chickens are considered as national genetic resources and their conservation is very important from biodiversity aspects. The study of mitochondrial genome in one breed and comparing it with others can be a useful index for genetic diversity in that population. This study carried out for determining the sequences of mitochondrial high variable 1 (HVR-I) of<br> D-loop region in Fars native chicken. Blood samples were collected randomly from 20 birds. After extracting DNA from whole blood, the HVR-I region was amplified using specific primers and then was sequenced. Totally, 12 sequences were obtained properly. After analyzing of the sequences, three haplotypes were identified with 5 single nucleotide polymorphic sites (SNP). These changes were mainly observed from nucleotides 217 to 446. After obtaining similar mtDNA sequence from GenBank, phylogenetic tree was drawn. Phylogenetic results indicated the Fars native chickens were clustered with Azerbaijan native, White Leghorn, Silky, Sonneratii, Barred Plymouth Rock, Iranian Marandi and Mazandarani native chickens. Therefore, we conclude that the Fars chicken might has some genetic similarities with these chicken breeds.</p> ژنوم میتوکندری, ناحیه بسیار متغیر 1 (HVR-I), چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP), فیلوژنی Genome, Highly variable region I (HVR-I), Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Phylogenetic 185 180 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-181&slc_lang=fa&sid=1 مهسا نیکوبین بروجنی 10031947532846005897 10031947532846005897 Yes نصرالله پیرانی 10031947532846005898 10031947532846005898 No فریبا رفیعی بروجنی 10031947532846005899 10031947532846005899 No