Research on Animal Production
پژوهشهاي توليدات دامي
Res Anim Prod
Agriculture
http://rap.sanru.ac.ir
1
admin
2251-8622
2676-461X
8
10.61186/rap
14
8888
13
fa
jalali
1395
5
1
gregorian
2016
8
1
7
13
online
1
fulltext
fa
(مقاله کوتاه) تجزیه فیلوژنی و تکامل مولکولی لپتین
(Short Paper) Phylogenetic Analysis and Molecular Evolution of the Leptin Gene
تخصصي
Special
پژوهشي
Research
<p dir="RTL"><strong> در بررسی حاضر به­منظور آگاهی از روند تکاملی و مولکولی ژن لپتین در پستانداران، آنالیز فیلوژنی و روند انتخاب طبیعی در طی تکامل انجام گرفت. توالی ژنی لپتین در پستانداران و سایر موجودات از جمله مرغ که هر کدام یک نسخه از توالی ژن را دارا بودند بر اساس جستجو در بانک اطلاعاتی ژنوم (</strong><strong><span dir="LTR">NCBI</span></strong><strong>) به­دست آمده و هم­تراز شدند. درصد جانشینی و جایگزینی نوکلئوتیدها با استفاده از روش حداکثر درست­نمایی و نیز ترسیم درخت فیلوژنتیک و تعیین روند انتخاب طبیعی به­روش </strong><strong><span dir="LTR">neighbor-joining</span></strong><strong> به­دست آمدند. نتایج حاصل از مطالعات بیوانفورماتیک نشان داد، که درصد جانشینی بازهای پیریمیدینی بیشتر از بازهای پورینی بوده است. مقدار عددی </strong><strong><span dir="LTR">d<sub>N</sub>/d<sub>S</sub></span></strong><strong> بیشتر از یک بود، که نشان­دهنده­ی انتخاب مثبت در طی تکامل این ژن­ها است. این نوع انتخاب سبب به­وجود آمدن واریته­های جدید، پروتئین­های جدید و از طرفی سبب تثبیت عمل­کرد آن­ها در طی روند تکامل و پیشرفت در جهت خالص­سازی عملکرد آنها شده است که ناشی از تبدیل نواحی غیر کدکننده ژنی به نواحی کدکننده ژنی است.درخت فیلوژنتیک برای ژن مذکور در موجودات مختلف نشان می­دهد که به­طور کلی پروتئین لپتین در موجودات مختلف بر اساس مسیر تکاملی خود به دو دسته مجزا تقسیم می­شود، که در یک دسته پستانداران با درصد شباهت بیشتر قرار گرفته است. هم­چنین، پروتئین لپتین مرغ نیز به­علت شباهت بالا با پستانداران در این دسته قرار گرفته است. در دسته دیگر سایر موجودات از جمله انواع مختلف ماهی­های ذکر شده با قرابت بیشتر دسته بندی شدند.</strong></p>
<p> In the current study, phylogenetic analysis and molecular evolution of the mammalian’s Leptin was investigated. Data was achieved and aligned by searching its genome database, while all examined mammals contained only a single copy of the Leptin. The nucleotide substitution rate of the sequences and molecular evolution of the Leptin were calculated by maximum likelihood and neighbor-joining method respectively and phylogenetic tree was constructed. Bioinformatics researches results identified that Leptin genes are distributed across the genome. On the other hand base substitution rate of the pyrimidines to pyrimidines or purines is much more than that of in purines to pyrimidines or purines. The d<sub>N</sub>/d<sub>s</sub> ratio of the Leptin sequences indicated that Positive selection was accrued during evolution which made new branches to give different responses. This can justifies high polymorphism of the Leptin. Phylogenetic analysis showed that Leptin proteins based on mainly are divided to two clades their evolutionary relationships. In the first clade the protein sequences are divided to mammals and chicken and in the second clade called the others we have all types of fish.</p>
لپتین, پستانداران, انتخاب طبیعی, فیلوژنی
Leptin, Mammals, Natural Selection, Phylogeny
213
208
http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-157&slc_lang=fa&sid=1
Javad
Ahmadpanah
جواد
احمدپناه
100319475328460010459
100319475328460010459
Yes
Islamic Azad University, Ilam Branch, Ilam, Iran
دانشگاه آزاد اسلامی واحد ایلام