fa بررسی شاخص‌های تنوع ژنتیکی در یک جمعیت از گاو هلشتاین با استفاده از نشانگرهای متراکم اسنیپ ژنتیک و اصلاح نژاد دام ژنتیک و اصلاح نژاد دام پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:11px;"><strong>کاهش میزان تنوع ژنتیکی و به&shy; تبع آن افزایش تجمعی میزان هم&shy;خونی از جمله عوامل تهدید کننده صنعت پرورش گاو شیری محسوب می&shy; شوند. هدف از پژوهش حاضر، ارزیابی شاخص&shy; های تنوع ژنتیکی (توزیع عدم تعادل لینکاژی، آماره هتروزیگوتی مشاهده &shy;شده و مورد انتظار، آماره </strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">F_is</span></span></strong><strong>، توزیع فراوانی آلل های نادر، میزان اتوزیگوتی و تجزیه به مؤلفه&shy; های اصلی) در گاو هلشتاین با استفاده از نشانگرهای متراکم اسنیپ بود. داده&shy; های ژنوتیپی متعلق به 25 گاو ماده هلشتاین حاصل از تراشه اسنیپ گاوی 50 هزارتایی، اهدایی از شرکت تجاری آلتادلتا ژنتیک تجزیه و تحلیل شد. محاسبات آماری شاخص&shy; های مولکولی مذکور از طریق نرم&shy; افزار معروف پلینک، نسخه 1/9تحت محیط </strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">R</span></span></strong><strong> صورت گرفت. میانگین فراوانی آلل نادر (0/28)، میانگین فراوانی هتروزیگوتی مشاهده &shy;شده و هتروزیگوتی مورد انتظار به &shy;ترتیب (0/38، 0/37)، آماره شاخص تثبیت (</strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">F_is</span></span></strong><strong>) (منفی0/032)، آماره </strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">Fhom</span></span></strong><strong>(0/0328-) اندازه &shy;گیری شد. همچنین، نتایج تجزیه به مؤلفه&shy; های اصلی، تنوع و پراکنش معنی&shy; دار بالایی را نشان داد که تأییدی بر مطابقت و هم&shy;خوانی همه آماره&shy; های مولکولی اندازه&shy; گیری شده و بالا بودن میزان تنوع ژنتیکی اندازه&shy; گیری شده بود. از آنجایی که، شاخص </strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">ROH</span></span></strong><strong>، از اطلاعات توالی نوکلئوتیدی یکسان انتقال یافته به دو فرد حاصل می &shy;شود لذا، در مقایسه با شاخص </strong><strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman Bold,serif;">F_is</span></span></strong><strong>، معیار آماری مناسب&shy;تری برای مطالعه میزان هم&shy;خونی، می&shy; باشد. نتیجه&shy; گیری نهایی این که، بکارگیری نشانگرهای متراکم اسنپ می تواند، ابزاری مناسب برای ارزیابی وضعیت تنوع ژنتیکی و هم&shy;خونی جمعیت&shy; های دامی محسوب شود.</strong></span></div> <gdiv></gdiv><gdiv></gdiv> <div style="text-align: justify;">Historically, both significant decline of genetic diversity and <a href="https://www.google.com/search?safe=active&rlz=1C1GGRV_enIR751IR751&q=simultaneously&spell=1&sa=X&ved=2ahUKEwi2g_-7zazuAhXxaRUIHR0SBhwQkeECKAB6BAgEEC0">simultaneously</a> increasingly rate of inbreeding are two serious threaded factors in worldwide dairy industry. With this motivation, the aim of present report was to investigate the intra genetic diversity criteria (linkage disequribrium, observed and expected heterozygosity, F_is statistics, MAF distribution, autozygosity rate and population stratification using principal component analysis) in Holstein cattle population using dense markers. An Illumina Bovine 50k SNP Chip (V2) ready genotyped file for 25 Holstein cows obtained for further investigation. Here, we used Plink software for statistical analysis and measurement of molecular diversity indices. Observed outcomes results addressed average of MAF (0.28), mean frequency of observed and expected heterozygosity (0.38, 0.37), F_is statistic (&ndash; 0.032), F_hom statistic (-0.028-0328. In addition, PCA graph showed a significant indicating high population diversity, which was in accordance with all other calculated parameters. As a final conclusion, high-density SNP markers seems be as an accurate tool applicable for high-precision intra-diversity analyses.</div> &nbsp;<br> <gdiv></gdiv><gdiv></gdiv> تراشه اسنیپ, تنوع ژنتیکی, گاو هلشتاین, هم خونی Holstein cows, Inbreeding, Intera population diversity, SNP chip technology 140 149 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-733-3&slc_lang=fa&sid=1 Raoof Shakeri رئوف شاکری raoofshakeri1995@gmail.com 100319475328460015715 100319475328460015715 No Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز Arash Javanmard آرش جوانمرد arash_707@yahoo.com 100319475328460015716 100319475328460015716 Yes Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز Karim Hasanpur کریم حسن پور karimhasanpur@yahoo.com 100319475328460015717 100319475328460015717 No Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز Mokhtarali Abbasi مختار علی عباسی pmaz_abbasi@yahoo.com 100319475328460015718 100319475328460015718 No Animal Science Research Institute of Iran, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO) Iran سازمان تات، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، کرج S. mostafa Mazlom سید مصطفی مظلوم m.mazloom68@gmail.com 100319475328460015719 100319475328460015719 No Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Ferdowsi, Mashhad گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد Majid Khansefid مجید خان سفید mkhansefid@gmail.com 100319475328460015720 100319475328460015720 No Agri Bioscience, Agriculture Victoria Services, Bundoora, VIC, Australia موسسه اگرو بیوساینس، دپارتمان کشاورزی ویکتوریا، استرالیا Mehran Rahimi Varposhti مهران رحیمی ورپشتی 100319475328460015721 100319475328460015721 No M.Sc Animal Genetics and Breeding, CEO Arian Delta Gene Company, Tehran, Iran ژنتیک و اصلاح دام، مدیر عامل شرکت آرین دلتا ژنتیک، تهران