fa آنالیز تفاوت ژنتیکی ژن های مرتبط با پاسخ ایمنی بین گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد با استفاده از داده های RNA-Seq ژنتیک و اصلاح نژاد دام ژنتیک و اصلاح نژاد دام پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:11px;"><strong>جهش در طول توالی ژن&shy;ها سبب بروز تغییرات نوکلئوتیدی و درنتیجه ایجاد عملکرد جدید در ژن&shy;ها می&shy;شود. هدف از مطالعه حاضر، ارزیابی تنوع ژنتیکی و تحلیل بیان متفاوت ژن‌های مرتبط با سیستم ایمنی در بین دو جمعیت گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت&shy; بیلیارد بود. در این مطالعه از نتایج مربوط به آنالیز بیان افتراقی در بین جمعیت گاو&shy;های نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت&shy; بیلیارد با استفاده از داده&shy; های</strong> <strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;">RNA-Seq</span></span></strong><strong> جهت تجزیه ژنتیکی و ترسیم درخت فیلوژنتیکی استفاده ‌شد. توالی&shy;های نوکلئوتیدی با روش</strong> <strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;">ClustalW</span></span></strong> <strong>توسط نرم &shy;افزار</strong> <strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;">MegaAlign</span></span></strong> <strong>هم&shy;ردیفـ</strong> <strong>سازی&shy; شدند و درخت فیلوژنتیکی و ماتریس تفاوت و تشابه توالی&shy;ها ترسیم &nbsp;شد. بر اساس نتایج این تحقیق، میانگین اختلاف نوکلئوتیدها و تعداد کل جهش&shy;ها برای ژن‌های مورد مطالعه در بین جمعیت‌های گاو نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت&shy;بیلیارد به&shy;ترتیب در محدوده&shy;ی (2598/66-186) و (3898-74) قرار داشت. هم&shy;چنین، نواحی حفاظت‌ شده بخش اندکی از توالی ژن&shy;های مورد مطالعه را تشکیل دادند که این امر نشان دهنده چند شکلی بالای این ژن&shy;ها و هم&shy;چنین مستعد بودن به تغییرات نوکلئوتیدی و جهش می&shy;باشد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنی توالی نوکلئوتیدی ژن&shy;های مورد مطالعه نشان داد که تنوع ژنتیکی و واگرایی برای ژن&shy;های مورد مطالعه در بین جمعیت&shy;های گاو نژاد خالص، آمیخته سیستانی و مونت&shy; بیلیارد و ایندیکوس وجود دارد.</strong> <strong>میزان عددی نسبت جایگزینی</strong> <strong><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;">d_N/d_S</span></span></strong> <strong>برای ژن&shy;های مورد مطالعه نشان &shy;دهنده انتخاب مثبت این ژن&shy;ها بود.</strong></span></div> <div style="text-align: justify;">Mutations during gene sequencing lead to nucleotide changes, resulting in new function in gene. The aim of the present study was to evaluate the genetic diversity and analysis the reasons for the differential expression of immune-related genes between the two populations of purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde cows. In this study, the results of the analysis of differential expression among the population of purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde cows using RNA-Seq data were used for genetic analysis and phylogenetic tree mapping. Clustal W nucleotide sequences were aligned using the MegaAlign software, and the phylogenetic tree and matrix of differences and similarities of the sequences were plotted. Based on the results of this study, the mean difference between nucleotides (nucleotide divergence) and the total number of mutations for the studied genes among purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde populations were in the range (2598-1869) and (3898-74) . Also, conserved regions make up a small part of the sequence of genes studied, indicating a high polymorphism of these genes and their susceptibility to nucleotide changes and mutations. The results of the phylogenetic tree for the nucleotide sequence of the studied genes showed that there is genetic diversity and divergence in the studied genes among purebred and crossbreed Sistani and Montebilliard and Indicus populations. The numerical value of the d_N/d_S ratio for the studied genes indicated the positive selection for these genes.</div> تکامل, تنوع ژنتیکی, جهش, فیلوژنتیک, گاو سیستانی Evolution, Genetic diversity, Mutations, Phylogenetic, Sistani cows 134 145 http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-458-7&slc_lang=fa&sid=1 Batol AsghariEsfeden بتول اصغری اسفدن batol_asghari@yahoo.com 100319475328460015226 100319475328460015226 No University of Zabol گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران Gholam Reza Dashab غلامرضا داشاب dashab@uoz.ac.ir 100319475328460015227 100319475328460015227 Yes University of Zabol گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران Mohammad Hossein Banabazi محمد حسین بنابازی hossein.banabazi@gmail.com 100319475328460015228 100319475328460015228 No Department of Biotechnology, Animal Science Research Institute of IRAN (ASIR) بخش پژوهش های بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی،کرج، Mohammad Rokouei محمد رکوعی rokouei@uoz.ac.ir 100319475328460015229 100319475328460015229 No University of Zabol گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران