TY - JOUR T1 - Comparative Study of Transcriptome Profile and Immune-related Genes Network Associated with Intestinal Epithelial Tissue based on Microarray Data in Poultry with Coccidiosis TT - مطالعه مقایسه‌ای پروفایل ترانسکریپتوم و شبکه ژن‌های اختصاصی عملکرد سیستم ایمنی مرتبط با بافت اپتلیال روده مبتنی بر داده‌های ریزآرایه‌ای در طیور مبتلا به بیماری کوکسیدیوز JF - rap JO - rap VL - 13 IS - 36 UR - http://rap.sanru.ac.ir/article-1-1248-fa.html Y1 - 2022 SP - 154 EP - 162 KW - Coccidiosis KW - Eimeria KW - Economic loss KW - Gene expression KW - Poultry industry KW - Public health N2 - چکیده مبسوط مقدمه و هدف: بیماری کوکسیدیوز که توسط انگل‌های ایمریایی بروز می‌کند، یکی از پر هزینه‌ترین بیماری‌های صنعت طیور به شمار می‌رود. در این راستا، شناخت نحوه پاسخ سیستم ایمنی بدن به کوکسیدیوز، می‌تواند در طراحی روشهای مولکولی پیشگیرانه و درمانی در مقابل آن، کمک‌کننده باشد. هدف پژوهش حاضر، شناسایی ژن‌های مهم دخیل در پاسخ سیستم ایمنی طیور مرتبط با آلودگی انگل‌های ایمریا با استفاده از داده‌های ریزآرایه‌ای موجود در پایگاه‌های داده با دسترسی آزاد می‌باشد. مواد و روش‌ها: در مطالعه حاضر، پس از جستجوی پایگاه اطلاعاتی GEO، دو مجموعه داده ریزآریه‌ای مرتبط با کوکسیدیوز در طیور انتخاب شد. پس از اعمال کنترل کیفی و حذف داده‌های نامناسب، با استفاده از بسته نرم‌افزاری LIMMA در برنامه R به شناسایی ژن‌های با بیان بالا و پایین معنادار در پاسخ به آلودگی با ایمریاها پرداخته شد. همچنین، آنالیز ژن آنتولوژی و مسیرهای KEGG با استفاده از برنامه DAVID اجرا شد. متعاقباً، شبکه ارتباط متقابل پروتئین-پروتئین مربوط به ژن‌های با تغییر سطح بیان معنادار شده، با استفاده از برنامه Cytoscape ترسیم شد. یافته‌ها: نتایج به‌دست آمده در این پژوهش نشان دادند که اغلب ژن‌هایی که دچار افزایش بیان معنادار شده بودند، در دسته ژن‌های مرتبط با سیستم ایمنی ذاتی قرار داشتند. ژن‌های با کاهش بیان معنادار نیز در فرآیندهای متابولیکی دخیل بودند. با توجه به خروجی های این مطالعه، به نظر می‌رسد بیماری کوکسیدیوز احتمالاً، به دلیل آسیب به روده طیور، بیشترین اثر منفی خود را بر فرآیندهای متابولیکی از جمله متابولیسم چربی می‌گذارد. مدارک علمی موجود درباره افزایش بیان معنادار ژن‌های MMP1، MMP7 و MMP9 نشان داد که کاتابولیسم کلاژن در بیماری کوکسیدیوز یکی از موارد افزایش یافته می‌باشد که می‌تواند ناشی از آسیب به بافت روده باشد. به نظر می‌رسد تغییر سطح بیان ژن‌های موثر در متابولیسم برخی از مواد مغذی از جمله چربی‌ها، یکی از تأثیرات مهم بیماری کوکسیدیوز باشد. نتیجه‌گیری: در نهایت، نتایج به‌دست آمده در مطالعه کنونی می‌تواند در درک بهتر نحوه پاسخ سیستم ایمنی طیور به بیماری کوکسیدیوز مفید باشد و این تغییرات مشاهده شده در الگوی بیان برخی از ژن‌ها می‌تواند به طراحی روش‌های درمانی این بیماری کمک کند. M3 10.52547/rap.13.36.154 ER -