دوره 8، شماره 18 - ( زمستان 1396 )                   جلد 8 شماره 18 صفحات 177-186 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


دانش آموخته کارشناسی ارشد
چکیده:   (383 مشاهده)
هد‌ف از پژوهش حاضر، مقایسه روش­های گوناگون بیزی (پارامتری) در پیش‌بینی ارزش­های اصلاحی ژنومی برای صفاتی با معماری ژنتیکی متفاوت در توزیع مختلف اثرات ژنی، تعداد جایگاه­های صفات کمی، وراثت‌پذیری و تعداد افراد جمعیت مرجع با استفاده از داده­های شبیه سازی بود. ژنومی حاوی 3 کروموزوم هر یک به طول 100 سانتی مورگان روی هر کروموزوم با 1000 نشانگر تک نوکلئوتیدی (SNP) با فواصل نشانگری یکسان از یکدیگر شبیه سازی شدند. توزیع متفاوت اثرات ژنی (یکنواخت، نرمال و گاما)، سه سطح تعداد QTL (50، 200 و 400)، دو سطح وراثت‌پذیری (16/0 و 5/0 ) و دو سطح تعداد افراد جمعیت مرجع (1000 و 2000) به ‌‌‌‌‌‌عنوان فرضیه­های شبیه سازی صفت، درنظر گرفته شدند. به منظور پیش‌بینی ارزش­های اصلاحی افراد موجود در جمعیت­های مرجع و تأیید، از پنج روش بیزی شامل بیز ریج رگرسیون (BRR)1، بیز A، بیز L (LASSO)2، بیز و بیز B استفاده شد. با افزایش فاصله بین جمعیت مرجع و کاندیدا­های انتخاب به علت برهم خوردن فاز لینکاژ، صحت ارزش­های اصلاحی ژنومیک در همه روش­ها کاهش نشان داد. با افزایش وراثت‌پذیری از 16/0 به 5/0 در تمام روش­ها افزایش صحت ارزش­های اصلاحی ژنومی کاملاً مشهود و حدود 20/0 بود. زمانی که تعداد افراد جمعیت مرجع از 1000 به 2000 افزایش یافت تمام روش­ها افزایش صحتی نزدیک به 18/0 را نشان دادند. زمانی که توزیع اثرات ژنی گاما بود، روش بیز A در مقایسه با سایر روش­ها در هر دو سطح از مقدار وراثت‌پذیری، برتری آشکاری را نشان داد. زمانی که توزیع اثرات ژنی یکنواخت بود تمام
روش­ها صحت مشابهی را نشان دادند.
برای صفاتی با وراثت‌پذیری بالا، با افزایش تعداد QTL از 50 به 200 صحت تخمین­ها کاهش یافت. ولی در صفاتی با وراثت‌پذیری پایین، تأثیر مشهودی در صحت ارزش­های اصلاحی ژنومی مشاهده نشد.
متن کامل [PDF 4890 kb]   (232 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي