دوره 8، شماره 17 - ( پاییز 1396 )                   جلد 8 شماره 17 صفحات 122-129 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Study of Quantitative Trait Loci Affecting Growth Traits in Japanese Quail using a Paternal Half-Sib Design. rap. 2018; 8 (17) :122-129
URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-875-fa.html
نصیری فر احسان، اسمعیلی زاده کشکوئیه علی، مرادیان حسن، سهرابی سعید، طالبی مهدی. بررسی جایگاه صفت کمی موثر بر صفات رشد در بلدرچین ژاپنی با استفاده از طرح ناتنی پدری . پژوهشهاي توليدات دامي. 1396; 8 (17) :122-129

URL: http://rap.sanru.ac.ir/article-1-875-fa.html


دانش‌آموخته دکتری
چکیده:   (442 مشاهده)
برای شناسایی جایگاه­های صفات کمی (QTL) موثر بر صفات رشد روی کروموزوم 2 در بلدرچین ژاپنی از یک طرح ناتنی پدری استفاده گردید. از آمیزش متقابل دو سویه سفید (تخم­گذار) و وحشی (گوشتی) بلدرچین ژاپنی تعداد 34 پرنده در نسل اول ایجاد شد و از آمیزش پرندگان نسل اول در قالب 9 خانواده ناتنی پدری تعداد 422 نتاج در طی پنج هچ متوالی تولید شد. رکوردگیری فنوتیپی از صفات رشد پرندگان انجام شد و تمامی پرندگان مربوط به 9 خانواده ناتنی پدری برای 4 نشانگر ریزماهواره موجود روی کروموزوم 2 تعیین ژنوتیپ شدند. آنالیز QTL به روش مکان­یابی درون فاصله­ای مبتنی بر رگرسیون به صورت طرح ناتنی پدری انجام گردید. در این آنالیز علاوه بر QTL موثر بر نسبت کلیبر، QTL­های دیگر مرتبط با رشد در موقعیت­های 13، 51، 53، 54، 55 سانتی مورگان (05/0P<) و 50 سانتی­مورگان (01/0P<) شناسایی شدند. درصد واریانس QTL در محدوده 01/0 تا 16/5 و میانگین میزان اطلاعات مفید نشانگرها در نقاط مختلف کروموزوم شماره دو (در بین و موقعیت نشانگرها) 58/0 و در محدوده 41/0-71/0 قرار داشت. به احتمال زیاد صفات قرار گرفته در نزدیک یک نشانگر خاص دارای اثر پلیوترپی می­باشند که در اصلاح نژاد بلدرچین صفات مهمی محسوب می­شوند. نتایج نشان دهنده این است که صفات ذکر شده در ارتباط بالایی با یکدیگر هستند. در صورت تایید تفرق QTL­های شناسایی شده در سویه های تجاری بلدرچین، می توان از نتایج این پژوهش در برنامه های انتخاب به کمک نشانگر استفاده کرد.
 
متن کامل [PDF 513 kb]   (118 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي

فهرست منابع
1. Ambo, M., A.S. Moura, M.C. Ledur, L.F. Pinto, E.E. Baron, D.C. Ruy, K. Nones, R.L. Campos, C. Boschiero, D.W. Burt and L.L. Coutinho. 2009. Quantitative trait loci for performance traits in a broiler x layer cross. Animal genetics, 40: 200-8. [DOI:10.1111/j.1365-2052.2008.01824.x]
2. Asadi Khoshoei, E., S.R. Miraei Ashtiani, A. Torkamanzehi, S.H. Rahimi and R. Vaez Torshizi. 1999. The evaluation of kleiber ratio as a selection criterion for ram selection in Lori-Bakhtiari sheep breed. Iranian Journal of Agriculture Science, 30: 649-655 (In Persian).
3. Ayatollahhi, A. 2012. Divergent selection for four-week body weight in Japanese quail (Coturnix coturnix japonica): response to selection and realized heritability. Journal of Livestock Science and Technologies, 1(1): 61-64.
4. Atzmon, G., S. Blum, M. Feldman, A. Cahaner, U. Lavi and J. Hillel. 2008. QTLs detected in a multigenerational resource chicken population. The Journal of Heredity, 99: 528-38. [DOI:10.1093/jhered/esn030]
5. Badnhorst, M.A. 1990. The kleiber ratio as a possible selection for sire selection. The Shepherd, 35: 18-19.
6. Berg, L., M.M. Scholtz and G.J. Erasmus. 1992. Identification and assessment of the best animals: The Kleiber Ratio as a selection criteria for beef cattle. Animal Breeding and Genetics, 10: 338-340.
7. Carlborg, O., S. Kerje, K. Schutz, L. Jacobsson, P. Jensen and L. Andersson. 2003. A global search reveals epistatic interaction between QTL for early growth in the chicken. Genome research, 13: 413-21. [DOI:10.1101/gr.528003]
8. Charati, H. and A.K. Esmailizadeh. 2013. Carcass traits and physical characteristics of eggs in Japanese quail as affected by genotype, sex and hatch. Journal of Livestock Science and Technologies, 2(1): 59-64.
9. Chatziplis, D.G. and C.S. Haley. 2000. Selective genotyping for QTL detection using sib pair analysis in outbred populations with hierarchical structures. Genetics Selection Evolution, 32: 547-560. [DOI:10.1186/1297-9686-32-6-547]
10. Churchill, G.A. and R.W. Doerge. 1994. Empirical threshold values for quantitative trait mapping. Genetics, 138: 963-971.
11. Darvasi. A., A. Weinreb, V. Minke, J.I. Wellert and M. Soller. 1993. Detecting Marker-QTL Linkage and Estimating QTL Gene Effect and Map Location Using a Saturated Genetic Map. Genetics, 134: 943-951.
12. De Koning, D.J., P.M. Visscher, S.A. Knott and C.S. Haley. 1998. A strategy for QTL detection in half-sib populations. Animal Science, 67: 257-268. [DOI:10.1017/S1357729800010018]
13. Esmailizadeh, A.K. and M.R. Mohammadabadi. 2009. The molecular research of bovine genome for mapping loci associated with carcass weight, Agricultural Biotechnology, 1: 130-117 (In Persian).
14. Esmailizadeh, A.K., A. Baghizadeh and M. Ahmadizadeh. 2012. Genetic mapping of quantitative trait loci affecting bodyweight on chromosome 1 in a commercial strain of Japanese quail. Animal Production Science, 52: 64-68. [DOI:10.1071/AN11220]
15. Haley, C.S., S.A. Knott and J.M. Elsen. 1994. Mapping quantitative trait loci in crosses between outbred lines using least squares. Genetics, 136: 1195-1207.
16. Ikeobi, C.O.N., J.A. Woolliams, D.R. Morrice, A. Law, D. Windsor, D.W. Burt and P.M. Hocking. 2002. Quantitative trait loci affecting fatness in the chicken. Animal Genetics, 33: 428-435. [DOI:10.1046/j.1365-2052.2002.00911.x]
17. Inoue-Murayama, M., B.B. Kayang, K. Kimura, H. Ide, A. Nomura, H. Takahashi, Y. Nagamine, T. Takeda, H. Hanada, K. Tatsuda, M. Tsudzuki, Y. Matsuda, M. Mizutani, Y. Murayama and S. Ito. 2001. Chicken microsatellite primers are not efficient markers for Japanese quail. Animal Genetics, 32: 7-11. [DOI:10.1046/j.1365-2052.2001.00699.x]
18. Jabbari, Ori R., A.K. Esmailizadeh, H. Charati, M.R. Mohammadabadi and S.S. Sohrabi. 2014. Identification of QTL for live weight and growth rate using DNA markers on chromosome 3 in an F2 population of Japanese quail. Molecular Biology Reports, 41: 1049-1057. [DOI:10.1007/s11033-013-2950-3]
19. Kayang, B., M. Inoue-Murayama, T. Hoshi, K. Matsuo, H. Takahashi, M. Minezawa, M. Mizutani and S. Ito. 2002. Microsatellite loci in Japanese quail and cross-species amplification in chicken and guinea fowl. Genetics Selection Evolution, 34: 233-253. [DOI:10.1186/1297-9686-34-2-233]
20. Kayang, B., A. Vignal, M. Inoue-Murayama, M. Miwa, J. Monvoisin, S. Ito and F. Minvielle. 2004. A first-generation microsatellite linkage map of the Japanese quail. Animal Genetics, 35: 195-200. [DOI:10.1111/j.1365-2052.2004.01135.x]
21. Kayang, B.B., V. Fillon, M. Inoue-Murayama, M. Miwa, S. Leroux, K. Fève, J.L. Monvoisin, F. Pitel, M. Vignoles, C. Mouilhayrat, C. Beaumont, S.I. Ito, F. Minvielle and A. Vignal. 2006. Integrated maps in quail (Coturnix japonica) confirm the high degree of synteny conservation with chicken (Gallus gallus) despite 35 million years of divergence. BMC Genomics, 7: 101. [DOI:10.1186/1471-2164-7-101]
22. Khatkar, M. S., P.C. Thomson, I. Tammen and H.W. Raadsma. 2004. Quantitative trait loci mapping in dairy cattle: review and meta-analysis. Genetics Selection Evolution, 36: 163-190. [DOI:10.1186/1297-9686-36-2-163]
23. Khaldari, M., A. Pakdel, H. Mehrabani Yegane, A. Nejati Javaremi and P. Berg. 2010. Response to selection and genetic parameters of body and carcass weights in Japanese quail selected for 4 week body weight. Poultry Science, 89: 1834-1841. [DOI:10.3382/ps.2010-00725]
24. Knott. S.A., L. Marklund, C.S. Haley, K. Andersson, W. Davies, H. Ellegren, M. Fredholm, I. Hansson, B. Hoyheim, K. Lundstrom, M. Moller and L. Andersson. 1998. Multiple markers mapping of quantitative trait loci in a cross between outbred wild boar and large white pigs. Genetics. 149: 1069-1080.
25. Miller, S.A., D.D. Dykes and H.F. Polesky. 1988. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research, 16: 12-15. [DOI:10.1093/nar/16.3.1215]
26. Minvielle, F., B. Kayang, M. Inoue-Murayama, M. Miwa, A. Vignal, D. Gourichon, A. Neau, J. Monvoisin and Ito S. 2005. Microsatellite mapping of QTL affecting growth, feed consumption, egg production, tonic immobility and body temperature of Japanese quail. BMC Genomics, 6: 87. [DOI:10.1186/1471-2164-6-87]
27. Moradian, H., A.K. Esmailizadeh, S.S. Sohrabi, E. Nasirifar, N. Askari, M.R. Mohammadabadi and A. Baghizadeh. 2014b. Genetic analysis of an F2 intercross between two strains of Japanese quail provided evidence for quantitative trait loci affecting carcass composition and internal organs. Molecular Biology Reports, 41: 4455-4462. [DOI:10.1007/s11033-014-3316-1]
28. Navarro, P., P.M. Visscher, S.A. Knott, D.W. Burt, P.M. Hocking and C.S. Haley. 2005. Mapping of quantitative trait loci affecting organ weights and blood variables in a broiler layer cross. British Poultry Science, 46(4): 430-42. [DOI:10.1080/00071660500158055]
29. Podisi, B. K., S.A. Knott, D.W. Burt and P.M. Hocking. 2013. Comparative analysis of quantitative trait loci for body weight, growth rate and growth curve parameters from 3 to 72 weeks of age in female chickens of a broiler–layer cross. BMC Genetics, 14: 22. [DOI:10.1186/1471-2156-14-22]
30. Rao, Y., X.U. Shen, M.X. Xia, C. Luo, Q. Nie, D. Zhang and X. Zhang. 2007. SNP mapping of QTL affecting growth and fatness on chicken GGA1. Genetics Selection Evolution, 39: 569-582. [DOI:10.1186/1297-9686-39-5-569]
31. Rezvannejad E. 2014. Productive, reproductive performance and biochemical parameters of short-term divergently selected Japanese quail lines and their reciprocal crosses. Journal of Livestock Science and Technologies, 1(2): 35-42.
32. Rowe, S.J., D. Windsor, C.S. Haley, D.W. Burt, P.M. Hocking, H. Griffin, J. Vincent and D.J. De Koning. 2006. QTL analysis of body weight and conformation score in commercial broiler chickens using variance component and half-sib analyses. Animal Genetics, 37: 269-272. [DOI:10.1111/j.1365-2052.2006.01424.x]
33. Shibusawa, M., S. Minai, C. Nishida-Umehara, T. Suzuki, T. Mano, K. Amada, T. Namikawa and Matsuda Y. 2001. A comparative cytogenetic study of chromosome homology between chicken and Japanese quail. Cytogenetics and Cell Genetics 95: 103-109. [DOI:10.1159/000057026]
34. Sohrabi, S.S., A.K. Esmailizadeh, A. Baghizadeh, H. Moradian, M.R. Mohammadabadi, N. Askari and E. Nasirifar. 2012. Quantitative trait loci underlying hatching weight and growth traits in an F2 intercross between two strains of Japanese quail. Animal Production Science, 52: 1012-1018. [DOI:10.1071/AN12100]
35. Vali, N., M. A. Edriss and H. R. Rahmani. 2005. Genetic parameters of body and some carcass traits in two quail strains. International Journal of Poultry Science, 4(5): 296-300. [DOI:10.3923/ijps.2005.296.300]
36. Wakasugi, N. 1984. Japanese quail. In: Evolution of domesticated animals (Ed. by I.L. Mason). Longman, London, 319-21.
37. Weller, J.I. 2001. Quantitative trait loci analysis in animals. London: CABI Publishing. 287 pp. [DOI:10.1079/9780851994024.0000]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA code

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به پژوهشهای تولیدات دامی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2018 All Rights Reserved | Research On Animal Production(Scientific and Research)

Designed & Developed by : Yektaweb